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一研究称华南海鲜市场不是病毒发源地


2月22日,中国科学院西双版纳热带植物等机构研究员发布文章称,通过收集覆盖了四大洲12个国家的93个新型冠状病毒样本的基因组数据(截止2月12日),通过全基因组数据解析发现,华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其他地方传入进来,在市场中发生快速传播蔓延到市场之外。且新冠病毒在2月12日之前发生过2次明显的种群扩张,早期扩张发生在12月8日,近期扩张在1月6日。

该文章题为“使用整个基因组数据解码新冠病毒的演化和传播”(Decoding evolution and transmissions of novel pneumonia coronavirus using the whole genomic data),为中国科学院西双版纳热带植物园联合华南农业大学和北京脑科中心的科研人员共同研究成果。


“华南海鲜市场的新冠病毒
是从其他地方传入的”

文章显示,在对覆盖了四大洲12个国家的93个新型冠状病毒样本基因数据分析,共发现了58种基因类型,根据基因类型分析演化确定其之间的关系为,H13和H38是比较“古老的”基因类型,通过一个中间载体与蝙蝠冠状病毒RaTG13关联,并通过H3衍生出了基因类型H1。

该研究表示,对于“古老的”基因类型H13和H38的病毒样品溯源发现,分别是来自深圳的病患(广东首例)和美国华盛顿州的病患(美国首例)。他们的旅行记录表明应该于2019年12月底至2020年1月初在武汉探亲期间被感染。而与华南海鲜市场有关联的患者样品基因类型都是H1及其衍生的H2,可见华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其他地方传入进来,在市场中发生快速传播蔓延到市场之外。另外,文章表示,根据病患发病时间记录和种群扩张时间推断,也印证了华南海鲜市场不是病毒发源地。

新冠病毒在2月12日之前
发生过2次明显的种群扩张

研究还显示,新冠病毒在2月12日前发生过2次明显种群扩张:一次是2019年12月8日,该结果暗示病毒可能在12月初,甚至11月下旬已开始人际传播,随后在华南海鲜市场加快。

另一次种群扩张发生在1月6日,这个可能与元旦假期有关联。研究人员指出指出,这一天国家疾控中心发布了2级应急响应。当时的预警起到了一些警示作用,公众活动和出行都有所减少。研究人员进一步确认我国其他9个省区和其他11个国家的感染病例基本都是从武汉直接或者间接输入而来。

研究还表明,新冠病毒基因组没有发生基因重组事件。

南方都市报(nddaily)报道
南都记者 余毅菁

* 南方都市报(nddaily)原创内容未经授权,不得转载。


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