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两次国奖,优秀毕业生!交大小姐姐诠释热爱与勇敢

请收藏 上海交通大学 2022-07-29

发表论文十余篇

连续两年获博士生国家奖学金

投身科研,不负青春

因为热爱,所以勇敢

她是上海市优秀毕业生

生命科学技术学院 褚晏伊


///


褚晏伊,生科院17级致远博士生,上海市优秀毕业生。师从生信生统系魏冬青教授和加拿大卡尔加里大学Dennis Salahub院士,研究方向为应用人工智能方法在生物医药上的研究,在Briefingsin Bioinformatics和Nature Machine Intelligence等期刊发表论文十余篇,连续两年获博士生国家奖学金。


01

扬帆起航,无畏风雨

“我常常觉得,人生价值不仅在于取得令人羡慕的成就,更要遵从内心做自己真正热爱的事业”,褚晏伊说到。从本科的药学,到如今博士所读的生物信息学,这份让她决心实现专业跨越的勇气,源自于2016年9月魏冬青教授在北京的一场报告。那时魏教授精彩的发言,从生物问题讲到计算方法,深深地震撼了她。会后,褚晏伊内心激动又忐忑地找到魏教授,讲述了自己的理想和未来规划,并并申请在魏老师指导下读博。经过一番努力,褚晏伊成功开启了生物信息专业的交大求学生涯。

转专业的背后意味着一切都要从最基础的学起。生物信息学涵盖了大量数学领域的知识,只有药学背景的她最先面临的挑战便是恶补数学。她与实验室的小伙伴起早贪黑,把每天的时间都花在补习基础知识上,甚至还去旁听大一新生的数学课,这才慢慢地补足了在数学方面的短板。


02

风雨过后,终见彩虹

在最初科研的两年,褚晏伊曾一度产生放弃的念头。那时候同伴们都已经完成了工作,但她却在修改自己的文章时,发现了一个微小却致命的错误,内心万分沮丧和失望,脑海里一直充斥着文章撤稿和退学的念头。

就要放弃之时,课题组的熊毅副研究员积极鼓励她:“任何负面情绪都不能解决我面前的科学问题。”于是在熊老师的帮助下,褚晏伊补充完善了大量的实验数据。实验室肖太龙同学也指导她如何理解和解释数据。最终她渡过难关,顺利修正了论文中的错误。后来这篇论文发表于影响因子9.1的一区期刊Briefings in Bioinformatics,成为实验室发表于该期刊的首篇文章。

发表第一篇论文的经历使褚晏伊迅速成长,开始注重代码的规范性和数据处理的准确性。同时她也意识到作为博士生,绝不止于按部就班的工作,更应该有发现问题、提出解决办法的创新能力。在后续的科研中,她逐渐找到了自信,努力也收获了回报。她将图神经网络应用于miRNA-疾病的关联数据,预测药物-靶点相互作用并取得令人惊喜的性能,顺利地在Briefings in Bioinformatics上发表了第二、第三篇文章,并连续两年获得国家奖学金。渐渐的,褚晏伊不再过多关注发表文章的数量,更加注重提高研究的应用价值。在与他人的合作下,褚晏伊开启了主题为“癌症新抗原的鉴定和疫苗开发”的研究工作,朝着人类健康事业不断深入。


03

 国外访学,喜结硕果

疫情期间,褚晏伊来到加拿大卡尔加里大学访学,跟随Dennis Salahub教授参与量子力学和量子化学的课题研究。国外的访学生活受疫情影响,并没有想象的那么顺利。想到出国前自己的雄心壮志,但出国后却过着不能与导师同学面对面交流的居家隔离生活,使她感到人生无比灰暗。

再一次,身边的老师、亲朋好友用他们温暖的光芒照耀了褚晏伊,将她从灰暗里拯救出来。魏老师和熊老师时常关心她的学习和生活,在遇到困难时大力支持;李芳老师和顾若虚老师为了让她保持平稳的心态,体贴地帮忙联系了心理医生;父母和朋友们跨越时差,每天陪她打电话。远在卡尔加里的留学生朋友们知道她食欲不振后,经常做好饭菜邀请她一起吃,甚至千里迢迢送饭。在亲友师长的关爱下,褚晏伊重燃斗志,调整心态,积极投入进访学科研中。

最终,褚晏伊顺利完成了合作研究,期间所撰写的文章已经发表在了Nature Machine Intelligence期刊上。国外的访学经历再一次磨砺了她的身心,让她在遇到困难的时候更加从容和冷静,相信在未来的学习和生活中将无惧任何挑战。


04

心怀感恩,坚定前行

回首五年时光,褚晏伊感谢交大对她的培养,终成一个心怀使命爱国荣校的人,也衷心感谢所有帮助过她的老师、同学和朋友。

即将在6月份结束博士研究生学习的她,未来将前往国外进行博士后深造,学成回国为祖国医药事业奋斗终生。褚晏伊坚定地表示,她将时刻谨记母校和师友们的嘱托,不负众望,不负青春,做一个对社会有责任、对祖国有贡献的交大人。

来源 |  生命科学技术学院

编辑 | 冯硕 鲁新钰

责任编辑 | 金雪

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