53年前,瑞士生化学家从手术绷带的脓血中成功分离出DNA(当时称为“核蛋白”),从此人类便开启了DNA的探索之旅,也将看不见摸不着的DNA带入了大众的视野。怎样验证细胞中DNA的存在?又如何成功提取DNA?这些疑问是人类深入挖掘DNA奥秘的起始与关键。今天,小编与生物大咖们一起从教材入手,共同解析《DNA的粗提取与鉴定》实验。
如何进行DNA的粗提取与鉴定?
实验原理
DNA提取的原理为裂解细胞,使细胞中的核酸和大分子物质释放出来,然后用一系列的试剂纯化,最后得到DNA的过程。
1、研磨液中的变性剂SDS是去污剂的主要成分,能溶解细胞膜,可促使细胞破裂,释放出DNA,并使得蛋白质变性,抑制DNA酶活性;NaCl利于提取时DNA溶解在研磨液中;EDTA是一种金属离子螯合剂,螯合金属二价阳离子,降低DNA酶活性,减少DNA分解;Tris是缓冲液的主要成分,稳定溶液pH值,防止DNA在pH发生变化时降解或变性。
2、DNA不溶于酒精,而细胞中的某些物质溶于酒精。因此,可用乙醇进一步提取出含杂质较少的DNA。
3、DNA中的嘌呤核苷酸中的脱氧核糖遇酸生成ω-羟基-γ-酮基戊醛,在沸水浴条件下,它和二苯胺试剂反应使溶液呈蓝色,因此,二苯胺可以作为鉴定DNA的试剂。
4、微量可调移液器、电子天平、研磨过滤器、水浴锅、铝制试管架、试管、吸头、吸头盒、油性记号笔等。
5、植物DNA粗提取与鉴定试剂盒、无水乙醇、纯水/蒸馏水。
实验方法与步骤
在加入DNA粗提物的试管中,颜色变为蓝色;而空白对照的试管中无颜色变化,说明通过实验系列操作,成功提取菜花中的DNA。
4、更多实验结果
实验成功关键
充分研磨,DNA释放的量更多,提取与鉴定效果则更加明显。较之传统的研磨工具,研磨过滤器具有研磨更快速、充分、安全等优势。提取与分离一“器”呵成。应用广泛,除本实验外,《叶绿素的提取与分离》及研磨相关的实验均可使用。
提取过程中,加入冷的无水乙醇时,需倾斜试管,吸头接触试管斜面缓慢加入试管中,切忌快速加入时冲散已析出的DNA,并顺着一个方向快速旋转试管,使得絮状物析出并凝结成团,切勿剧烈震荡,以免絮状物破碎。
二苯胺是实验鉴定的关键试剂,因此选择专业的试剂盒产品,是试剂品质保障的前提。其次配制过程中不仅要掌握A、B液的配比,更要遵循“现配现用”的基本原则,才可以取得理想的实验效果。
专业的仪器设备、高品质的试剂耗材,科学的实验方法,掌握实验的关键细节,任何实验都可以“不攻自破”。
注意事项
1、DNA提取时,EP管和枪头等耗材要先进行高压蒸汽灭菌,去除DNA酶(无酶无菌耗材除外)。
2、实验前,需保证细胞状态活性良好。如细胞死亡,提取的DNA不完整。
3、由于实验过程存在有机试剂,实验操作人员严格穿戴实验服和手套。保障自身安全。
质粒提取方法
质粒DNA的提取方法主要有碱裂解法、煮沸法、酚氯仿裂解法。跟据不同的实验目的和仪器设备择取不同的实验方案。
1、碱裂解法:
此方法适用于小量质粒DNA的提取,提取的质粒DNA可直接用于酶切、PCR扩增、银染序列分析。
1.接1%含质粒的大肠杆菌细胞于2ml LB培养基。
2.37°℃振荡培养过夜。
3.取1.5ml菌体于Ep管,以4000rpm离心3min,弃上清液。
4.加加o.1lm1溶液I(1%葡萄糖,50mM/L EDTA pH8.0,25mML Tris-HC1 pH8.0)充分混合。
5.加入0.2ml溶液II(0.2 mM/L NaOH,1% SDS),车轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。
6.加入0.15m1预冷溶液III(5 molLKAc, pH4.8),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。
7.以10,000rpm离心20min,取上清液于另一新Ep管
8.加入等体积的异戊醇,混匀后于0℃静置10min。
9.再以10,000rpm离心20min,弃上清。
10.用70%乙醇0.5ml洗涤一次,抽干所有液体。
11.待沉淀干燥后,溶于0.05mlTE缓冲液中
2、煮沸法
1.将1.5ml培养液倒入eppendorf管中,4C下12000g离心30秒。
2.弃上清,将管倒置于卫生纸上几分钟,使液体流尽。
3.将菌体沉淀悬浮于120m1 STET溶液中,涡旋混匀。
4.加入10ml新配制的溶菌酶溶液(10mg/ml),涡旋振荡3秒钟。
5.将eppendorf管放入沸水浴中,50秒后立即取出。
6.用微量离心机4C下12000g离心10分钟。
7.用无菌牙签从eppendorf管中去除细菌碎片。
8.取20ml进行电泳检查。
3、酚氯仿裂解法
1.从琼脂平板上挑取转化菌阳性克隆,接种到标准LB培养液中(含有卡那霉素30 ug/mL)摇菌12 h;收集1.5 mL菌液,8000 g/min离心3 min,弃上清,沉淀加入200 _uL TE,充分混匀;加入400 uL酚氯仿(1 : 1体积)混合液,剧烈振动10 s,混匀;12 000g/min离心5 min,1 mL胰岛素注射针收集上清,尽量避免吸入蛋白沉淀层;上清经国产0。22 um针式滤器过滤1次;向过滤上清液内加入2倍体积无水乙醇,振荡10 s,12 000 g/min离心5 min;沉淀溶于20uL的RTE溶液中,37℃水浴。
2.按PstI内切酶说明书进行酶切反应(37°C,1h)。酶切产物10 uL,10 g/L琼脂糖凝胶电泳。3.PCR引物根据参考文献设计,预计扩增产物片断大小为714 bp。
4.常规制备感受态菌E。coli DH5a,提取质粒DNA常规转化感受态,涂于含有卡那霉素(30 umL)LB培养平板中,37C培养,15 h后观察筛选克隆情况。
文章来源:生命科学教育 医思倍研究院 信裕生物
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审核人:邢海涛