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【大数据专栏】英国制药公司联手挖掘基因数据

2015-04-09 胡德良(译) 科技杂谈

【摘要】在利用英国国民卫生服务体系(NHS)的病人基因数据进行医学研究的最初阶段,世界上最大的几家制药公司跟英格兰基因组项目公司(GenomicsEngland)建立了合作关系。




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文 / 胡德良(译),邢台学院外语系英语教授,原文来自英国《金融时报》官网


在利用英国国民卫生服务体系(NHS)的病人基因数据进行医学研究的最初阶段,世界上最大的几家制药公司跟英格兰基因组项目公司(GenomicsEngland)建立了合作关系。


英国政府启动了为10万癌症和罕见病患者进行基因组解码的项目。为了通过该项目采集信息,英国两家最大的制药集团——葛兰素史克公司(GlaxoSmithKline)和阿斯利康公司(AstraZeneca),将要跟竞争对手联合起来,其中包括瑞士的罗氏公司(Roche),以及美国的艾伯维公司(AbbVie)和百健艾迪公司(Biogen)。


生物领域的大数据有多值钱?


这十强制药公司联盟将要开展一项为期一年的试验,目的是为该项目注入医药产业的专门知识,找到办法利用这些基因数据促进开发更加个性化的药品。


到目前为止,在该项目的试验阶段大约为3,000个基因组进行了测序,到2017年测序的目标是要达到100,000个基因组,创建世界上最大的人类细胞DNA编码数据库。


该数据库应该能够帮助研究人员发现跟特定疾病相关的基因突变,这反过来可能会有助于基因靶向疗法的开发。


英格兰基因组项目公司是一家准备经营这个测序项目的国有公司,公司执行主席约翰·奇泽姆爵士(SirJohnChisholm)说:如果这些数据能够为病人带来益处的话,制药企业的参与是很关键的。他明确表示,安全措施已经到位,确保将病人的数据匿名化。


去年,英国政府本来计划利用一个叫做“保护数据(CareData)”方案,从医院和家庭医生那里获取病人的病例资料,却遭到隐私权保护者的强烈反对。之后,政府被迫将这项计划推迟。


100,000基因组项目是有所不同的,因为它所涉及的人是自愿参加的。约翰爵士说:绝大多数人很希望将自己的数据应用到可以帮助药物开发的研究中。


然而,约翰爵士说:只能允许制药公司以一种严格控制的方式访问数据。他是这样描述该项目的:“这就像一座阅览式图书馆,而不是外借式图书馆。”


亚力兄制药公司(Alexion)是美国一家生物技术公司,也参加了这个联盟。该公司研发部主任马丁?麦凯(MartinMackay)说:“这项计划有可能使专家们加速对罕见病的遗传基础进行理解,最终导致诊断和治疗方法的改进。”


联盟中的其他成员公司被称为“基因联盟(GeneConsortium)”,它们是比利时的优时比公司(UCB)、日本的武田制药公司(Takeda)以及美国的Dimension制药公司和Helomics公司。


此外,在另外的一次行动中,英格兰基因组项目公司将要宣布跟科学家和学术机构合作,使研究人员能够得到数据库资料。


英国政府利用NHS及其大量的医学数据来努力吸引国际医学研究的展开和在生命科学方面的投资,而100,000基因组项目是其中的一个环节。


约翰爵士是软件和工程行业的一位资深专家,曾经负责监督政府国防技术服务企业——奎奈蒂克公司(Qinetiq)的私有化过程。


“我曾把大量的工作时间花在改变了20世纪的微电子革新领域。”约翰爵士告诉《金融时报》的记者说,“在21世纪,基因组学将会使世界发生改变。”他接着说:利用更加个性化的药物来治疗具体病人的遗传缺陷,在向这个趋势转化的过程中,英格兰基因组项目公司将会起到重要的作用。他说:“过去我们常常给自己灌下药丸……当回顾这些的时候,我们将会觉得这种吃药方式跟为发烧的病人放血没有什么两样。”


另外一个大型基因组数据库是由23andMe公司创建的,这是一家由谷歌供公司支持的位于加州的公司,该公司出售的DNA测试套件价格为99美元。


与23andMe公司不同的是,100,000基因组项目可能提供的资源要丰富得多,因为该项目检测的是整个基因组,而不仅仅是DNA片段。


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