【研究速览】Nucleic Acids Research:高产量合成功能性小RNA新策略
RNA研究和治疗主要依赖合成的RNAs。当研究人员采用重组RNA技术在细菌中大规模生产pre-miRNA试剂时,却发现大部分的靶向RNAs不表达或是表达可以忽略。
为此,UC Davis医学院和浙江大学药学院的研究团队联合开发出一种新的获取稳定高产的生物合成嵌合RNAs的策略。该嵌合RNAs携带有各种小RNAs(如miRNAs,siRNA和RNA适体)。这一策略是基于优化的非编码RNA骨架(OnRS),来源于tRNA融合pre-miR-34a(tRNA/mir-34a)。使用该策略可从1升细菌培养物中获取毫克级的嵌合RNAs(如OnRS/miR-124,OnRS/GFP-siRNA,OnRS/Neg(scrambled RNA),和OnRS/MGA(孔雀石绿适配子))。深度测序分析表明在人类细胞中成熟的miR-124和靶向GFP-siRNA被选择性地从嵌合RNAs中释放。在ES-2/GFP细胞和GPF转基因小鼠中,OnRS/miR-124可以抑制miR-124靶基因的表达并控制细胞进程,而OnRS/GFP-siRNA可以有效敲减GFP基因水平和荧光强度。不仅如此,OnRS/MGA传感器在结合MG后会释放特定的强荧光,该特性可作为无标记底物来准确判断胰腺癌患者的血清核糖核酸酶活性。
上述研究结果表明,OnRS-Based生物工程技术,是一种通用的,稳定的,和灵活的策略,可用于组装各种类型的小分子RNA以满足广泛的应用场景。
图1 基于OnRS技术在E.Coli中高产量合成重组miRNA/siRNA
此研究中的小RNA测序由联川生物承担完成。
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参考文献:
Chen QX, Wang WP, Zeng S, Urayama S, Yu AM. (2015) A general approach to high-yield biosynthesis of chimeric RNAs bearing various types of functional small RNAs for broad applications. Nucl. Acids Res. doi: 10.1093/nar/gkv228. IF = 8.808