【新研究】植物所：测序鉴定苜蓿非生物胁迫应答lncRNAs

长链非编码RNA（lncRNAs）已被证明在不同的生物过程（涉及复杂的机制）中发挥重要的调控作用。然而，植物中有关lncRNAs数量、序列、特征、以及潜在功能等信息，到目前为止仍极度匮乏。

为此，中国科学院植物研究所张文浩研究员的团队以苜蓿（Medicago truncatula）为模型，采用lncRNA测序对苜蓿应答渗透和盐胁迫的lncRNAs进行了深入挖掘和分析。研究人员从对照，渗透胁迫，盐胁迫的苜蓿的叶和根中共鉴定出23,324个候选lncRNAs。在这些lncRNAs中，7,863和5,561个lncRNAs分别鉴定自渗透胁迫的叶和根样品。同时，7,361和7,874个lncRNAs分别鉴定自盐胁迫的叶和根样品。为揭示它们潜在的功能，研究人员分析了与胁迫应答相关lncRNAs重叠或是临近的基因GO功能。发现生物过程层次的GO如信号转导，能量合成，分子代谢，解毒，转录和翻译等出现富集。

图1 苜蓿lncRNA特征

图2 维恩图解共表达和特异表达lncRNAs

图3 lncRNA与蛋白编码基因相互作用网络

lncRNAs很可能与蛋白编码基因组成一个复杂的调控网络，参与调节植物响应与适应渗透和盐胁迫。上述研究结果对理解lncRNAs在植物特别是苜蓿应答非生物胁迫中的潜在作用具有重要意义。

本研究中的lncRNA测序项目由联川生物承担完成

参考文献

*Tian-Zuo Wang, MinLiu, Min-Gui Zhao, Rujin Chen, Wen-Hao Zhang. (2015) Identification andcharacterization of long non-coding RNAs involved in osmotic and salt stress in Medicago truncatula using genome-wide high-throughput sequencing. BMC PlantBiology. 15:131.