用户文章 | 广东昆虫所陈金平组:揭示鲟鱼性别分化miRNA表达谱
MicroRNAs(miRNAs)是在真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,其大小长约20~25个核苷酸。miRNA参与动物转录后调控,并在调控配子形成相关基因的表达中起着非常重要的作用。但是,鲟鱼的性别决定和分化机制仍不清楚。因此,鉴定miRNA和识别与性别分化相关的miRNA表达特征对于理解miRNA在鲟鱼性分化过程中的作用是至关重要的。
在这项研究中,研究人员选取鲟鱼性别分化之前的五个不同组织和性腺进行miRNA表达谱分析。miRNA芯片和qPCR筛选出1037个miRNA(miRBase20.0)和103个候选miRNA。此外,还发现1140个miRNA中有477个miRNA的序列在不同鱼类中高度保守(100%)。663个非冗余的miRNA探针中,481个miRNA均在两个性别的性腺中检测到。148个miRNA被鉴定为在睾丸和卵巢之间含有性别分化表达谱(P<0.01), 21个miRNA(14.19%)在睾丸或卵巢中的表达量相对较高,倍数变化大于2。随机选择13个性别分化miRNA的芯片数据获得了qPCR验证。靶基因预测揭示了一个显著的功能富集基团(88 GO terms))和18 条KEGG通路(P<0.05),提示性别分化的miRNA和25个假定的配子形成相关的靶基因之间有相互作用。
因此,鲟鱼幼鱼miRNA表达谱分析为了解和进一步研究miRNAs在鲟鱼性别分化中的作用奠定了基础。
本研究中的microRNA微流体芯片由联川生物协助完成。
参考文献
Zhang XJ, et al. Conservation, sex-biased expression andfunctional annotation of microRNAs in the gonad of Amur sturgeon (Acipenserschrenckii). Comparative Biochemistry and Physiology, Part D 18 (2016) 54–61
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