2018国自然两大热点:m6A&ceRNA深度解析
2018年国自然基金评审已落下帷幕,研究热点也都逐一浮出水面。今天小编想跟大家一起分享2018年国自然基金的2大热点(申请)方向——m6A&ceRNA近年来的数据情况。
RNA甲基化(m6A):开创表观修饰新领域!
RNA甲基化的研究开创了表观遗传组学的新领域。m6A和RNA的代谢过程密切相关,这包括RNA分子的转录、加工剪接、从细胞核到细胞质的RNA输出、mRNA的翻译、RNA分子衰变,另外甚至调控着长链非编码RNA(lncRNA)和microRNA的生物学发生。总的来说,2018年国自然批准的项目中,m6A相关的研究多达65项,相比去年足足翻了3倍。具体项目趋势见下图:
图 近7年国自然研究中m6A资助项目数量及金额
图 RNA甲基化相关国自然基金中标学科统计
此外,m6A研究的文章近期也大爆发了,仅仅7月以来发表10分以上的文章数量就高达15篇,仅9月就已经有6篇,更不用说10分一下的文章了:
图 m6A相关SCI论文数量
那么RNA甲基化的各个项目中毫无疑问,都涉及到了以下调控蛋白(酶分子)里的其中之一,有哪些呢?最多研究的还是这里面的“writers” “readers”“erasers”,也就是RNA甲基化以去甲基化的功能蛋白酶。还面对m6A了解还不深的可以查看文末28篇相关知识——m6A研究专题资料。
说完m6A,再来说说ceRNA。
竞争性内源RNA(ceRNA),转录调控机制研究新天地!
ceRNA并非一种新的RNA分子,只是一种最新发现的基因表达调节机制。ceRNA作为一个成熟的基因间调控假说,在国自然中受到广泛关注。ceRNA假说是对传统miRNA→ RNA学说的补充,并认为存在反向RNA→miRNA作用方式,即ceRNA是通过与miRNA反应原件(MREs)竞争相同的miRNA,进而调节靶基因转录本的表达。已发现的 ceRNA 包括蛋白编码 mRNA 和非编码 RNA, 其中后者包括假基因转录物、 长链非编码 RNA(lncRNA)、环状 RNA(circRNA)、人工miRNA抑制剂(Artificial miRNA sponges)、假基因(pseudogene)、病毒RNA抑制剂(viral miRNA sponges)。2018年国自然批准的项目中,ceRNA相关的研究多达45项,与去年。具体项目趋势见下图:
图 近7年国自然研究中ceRNA资助项目数量及金额
图 ceRNA相关国自然基金中标学科统计
此外,ceRNA研究的文章也逐年增加,2018年截至目前为止,一在线发表论文数量已达103篇,仅9月就已经发表论文10篇,相当于1天产出一篇文章的速度:
图 ceRNA相关SCI论文数量
关于ceRNA的研究目前集中在ceRNA鉴定以及ceRNA调控网络构建上,可以利用芯片(ceRNA芯片)或测序(全转录组测序)来进行研究,并结合下游验证,研究互作用的分子变化情况及其对功能调控的影响。
此外,不少的ceRNA项目均为多方向结合,即多组学整合,例如:CircRNA-Nalcn内源性竞争miR-223-3p上调靶基因Hsp90b1通过调控Akt通路抑制脊髓损伤诱导的脊髓神经元凋亡的作用机制研究,涉及到了circRNA、miRNA、细胞凋亡;肝细胞外泌体lncRNA调控HSC自噬及EMT促进肝纤维化的机制研究,涉及lncRNA、外泌体、细胞自噬。这种“嵌套组合”会比单点研究更受欢迎,你get到了吗?
国自然两大热点——m6A&ceRNA与大家分享完毕~
大家不禁要问了,那么多国自然热点,怎么小编独对这俩情有独钟呢?
请点开下方大图解答疑问!
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m6A专题资料:
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病毒m6A专题 | HIV感染宿主促进病毒及T细胞m6A修饰
CeRNA专题资料:
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差异表达lncRNAs和circRNAs的鉴定和联合分析揭示PDLSC成骨分化过程中潜在的ceRNA调控网络
深度解读《CircLMO7在调控成肌细胞分化和存活中的作用》
深度解读《CircFUT10在调控成肌细胞增殖和分化中的作用》
基于 SHEE 和 SHEEC 细胞系比较分析构建 ceRNA 网络图