生物信息零基础培训班(广州站)招生啦~
The following article is from 基因学苑 Author 王通
上期R语言培训课程已结束,错过的请戳此查看详情:联川记录—R语言培训班结课,上期课程我们请到了曾任职华大基因高级讲师,具有9年以上生物信息工作经验,全网首位生物信息在线视频制作者王通老师,王通老师细致、幽默的讲课收获了学员的一致好评反馈。本期生物信息培训课程将继续由王通老师担任讲师!!!
本次培训依然采用五天教学,通过5天的系统学习,带您入门生物信息行业,让您熟练掌握Linux操作,测序原理,常用生物软件的使用,并能独立完成基因组,重测序,外显子分析等内容。让您对生物信息有一个全面的了解。培训之后,通过观看视频课程,继续使用服务器练习,巩固生物信息分析技能,让您今年彻底学会生物信息,助您尽快发表SCI。
课程特色:
1、真正的小班授课,U型会议室,方便指导每个学员;
2、科学设计课程,循序渐进,课程包含Linux,测序原理,基因组分析,三代数据分析,重测序分析,外显子等,适合零基础开始;
3、以完整项目为案例,通过亲自上手操作,快速掌握技能;
4、赠送32G优盘,含有大量生物信息学习资料,可继续巩固学习。
5、赠送半年生物云服务器(32线程,256G,24T)使用权限,可分析自己数据;
6、培训结束之后,可继续微信群答疑交流。
主讲老师:
王通:曾任职于华大基因,9年以上生物信息分析经验,擅长基因组,转录组,宏基因组,肿瘤基因组等数据分析。曾任华大基因高级讲师。2015年开始创业,主要做生物信息培训工作。国内最早生物信息教学视频制作者,已制作视频500集以上。首创视频+云服务器培训模式,目前已在北京,深圳,哈尔滨,杭州,武汉,南京,长春,广州,青岛等组织过多场培训班,线上线下累计学员超过6000多名。公众号“基因学苑”作者,已写作生物信息教程180多篇。
课程安排:
日期 | 主题 | 课程安排 |
第1天 (上午) | 生物信息学简介及Linux操作 | 生物信息学简介 登录服务器 传输文件 常用Linux命令 选项参数 目录结构 权限管理 |
第1天 (下午) | 生物软件安装 | vim编写脚本 sh执行脚本 生物软件下载与安装 bioconda管理生物软件 PATH变量设置 |
第2天 (上午) | 生物数据下载 | 参考序列下载 数据库下载 SRA数据下载 批量下载数据 GTF文件下载 |
第2天 (下午) | 测序原理及数据质控 | 测序原理 一代测序 二代测序 三代测序 fastq文件格式 fastqc数据质控 数据过滤 进程管理 |
第3天 (上午) | 基因组拼接 | kmer估计基因组大小 基因组拼接原理 二代测序基因组拼接 基因组统计 QUAST评估组装质量 如何改善拼接效果 批量操作 |
第3天 (下午) | 三代测序数据处理 | nanopore数据质控过滤 Nanopolish进行组装错误校正 canu拼接nanopore数据 pacbio测序数据拼接 minimap2 比对参考序列 tablet可视化比对结果 |
(上午) | 基因组分析 | 基因预测 ncRNA分析 重复序列分析 基因功能注释 基因家族分析 |
第4天 (下午) | 比较基因组分析 | nt库比对鉴定物种 nr库比对基因功能注释 多序列比对 构建系统发育树 利用iTol美化系统发育树 |
第5天 (上午) | 基因组变异检测 | 变异检测原理 bwa比对 bam文件格式 samtools工具处理sam/bam格式 |
第5天 (下午) | 基因组变异检测 | 利用freebays筛选SNP bcftools工具处理vcf/bcf文件 利用IGV可视化比对结果 SNPeff注释工具 annovar工具 |
报名须知:
上课时间:2019年7月13—7月17日(五天)每天早上8:30~17:30
上课地点:广州粤北酒店(广州市越秀区东风东路617号)
请自带电脑(windows与mac系统均可)
付款方式:
培训费用:4900元
付款方式:对公转账
账户:杭州联川生物技术股份有限公司
账号:383158327308
开户行:中国银行杭州经济技术开发区支行
优惠政策:
往期培训班学员报名,每人优惠 200元
经往期学员推荐报名,可享优惠200元
注:以上优惠不可同享
报名方式:
1. 微信公众号报名:关注联川公众号,对话框回复:培训+姓名+单位+电话;
2. 邮件报名market@lc-bio.com:邮件主题“培训报名”,正文:姓名+单位+电话;
3. 委托联川驻各地科技代表报名;
4. 联系胡女士:hyqluna(微信号),黄女士:18506829175(微信号)。
常见问题:
1、零基础是否可以学会?
完全没有问题,我们本次培训班就是针对零基础学员,或者刚刚接触生物信息的学员,不要害怕自己是零基础,如果不学习,永远都是零基础。
2、上完课就能够自己做分析了吗?
可以,我们课上会演示大量操作案例,将脚本以及案例数据放到服务器上,只需要替换为自己数据即可完成分析。
3、赠送的服务器账号是做什么的?
生物信息分析需要大量的计算资源以及部署软件数据库,赠送的服务器在大家学习完成之后,可以使用该计算资源进行自己的数据分析,而无需继续购买计算资源和花费大量时间部署软件和数据库。
4、可以开发票吗?
可以,包括培训通知等,方便用户报销。
5、需要做哪些准备?
课程开始之前会发送在线视频和讲义,让用户预习Linux操作。
6、培训完后面有不会的问题怎么办?
生物信息学习是一样长期的任务,培训班结束了,学习并没有,我们有培训交流群,后续可以在群内继续交流学习。
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