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一封来自Illumina的回信 | 微生物专题

运营部-JTT 联川生物 2022-05-21

做高通量测序的,恐怕都绕不开Illumina,无论是RNA-seq还是全基因组测序,这个测序大牛总会在你的科研工作中占据重要的一席。当Illumina推出了越来越多的测序系统,你是否会犯上选择困难症呢。上期介绍到了Illumina测序仪进化史,作为小鲜肉的NovaSeq 6000表现非常抢眼。Illumina对NovaSeq 6000测序系统寄予厚望,个系统的推出标志着测序的新纪元正式到来,对于任何测序方法、基因组和规模的项目,您都能使用可扩展的通量,灵活简便的完成(最大测序读长2×250 bp,单次运行最多可产生6000 Gb数据量)。

编者注:2020年1月13日,Illumina发布了全新的中高通量桌面测序系统NextSeq 1000和NextSeq 2000,最大测序读长2×150 bp,单次运行最多可产生300 Gb数据量。

全能型测序系统NovaSeq 6000

上图展示了NovaSeq 6000凭借其超高通量和更短测序周期,应用于全基因组测序,全外显子组测序,和全转录组测序。只有这些应用吗?当然不是!这个系统还能出色地完成包括编码转录组分析、靶向DNA测序、甲基化测序、使用mRNA-Seq绘制基因表达图谱、从头测序,使用染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq)进行DNA-蛋白质互作分析、群体研究、宏基因组测序等。这简直是承包了各个课题组各种类型的测序项目。

等等,研究微生物群落多样性的神器,硕博之友,迷人可爱的16S rRNA基因扩增子项目怎么可以不上NovaSeq 6000的应用榜呢。不行,一定要找Illumina“理论”一下。壮着胆马上就给Illumina发了一封问询邮件,测序大牛还是很平易近人的,很快就给回复了。大意是,NovaSeq 6000 PE250模式可以用于16S测序,并友好地提醒注意NovaSeq具有很高的测序通量(ps:咱们做实验的就怕数据量不够多呢)。既然测序大牛都认了,没上榜的事咱们就不计较了吧。

扩展阅读:微生物组16S测序又有大动作!升级至NovaSeq PE250,数据量免费升至5万Tags

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