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什么是体细胞突变(somatic mutation)?|肿瘤全外

运营部-HFR 联川生物 2021-05-25

在基因组学领域当中,我们对于突变这个词可以说并不陌生,它指的是基因组DNA核酸序列发生的改变,其中最常见的就是单碱基变异SNP(什么是SNP?| 群体遗传专题)。在实际分析过程中呢,我们会将测序数据比对到基因组上,与参考基因组发生差异的会被检测为突变位点(简单来说是这样)。

但是在一些肿瘤相关的测序当中,我们会见到一个似乎有点不同的概念,叫做体细胞突变(somatic mutation)。它的展示结果也是在几号染色体上的几号位置,什么碱基突变成了什么碱基,但是可能我们测序了10个样本,但最后只拿到了5个体细胞突变的检测结果。这到底是是怎么回事呢?小编也觉得非常疑惑,下面就跟着小编一起来看看体细胞突变究竟是什么吧。

体细胞突变是相对于胚系突变而言的。胚系突变(germline mutation)指的是在有性生殖过程中,由生殖细胞携带的突变,这种突变在该个体的每个细胞当中均存在,并且可以遗传到下一代;而体细胞突变则与之相对,是在个体生长发育过程中,由于诱变因素的影响在部分体细胞中积累的突变。这种突变仅出现在身体的少数部位,并且不会被随着生殖细胞遗传到下一代。

那么为什么肿瘤的科研更关注体细胞突变呢?这是肿瘤的特性导致的。正常的细胞有一套严格的自我监控机制,防止细胞出现恶性增殖的情况;但是肿瘤细胞却可以突破这一套机制,我无限制地增殖并侵犯周边的器官。这主要是因为细胞中出现了特殊的突变,导致正常的监控机制被破坏,并且出现了其他一些有利于细胞无限增殖、游离入侵的特性,从而使细胞转变为恶性。



在不同种类的肿瘤中,由于细胞类型、组织的微环境各有差异,所以主导肿瘤发生发展的体细胞突变(即驱动突变)也各不相同,后续其他的突变负荷、克隆结构等特征也都能借助体细胞突变体现出来。所以对体细胞突变进行深入的分析,也就成了肿瘤基因组方面研究的重中之重。而如何利用体细胞突变的结果来进行各种后续的深入分析,我们在之前的文章中有过相关的解读和介绍,后续我们也会持续为大家带来相关的解析。

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