JACI – Olink高敏微量体液蛋白质组与单细胞转录组共同助力开发特应性皮炎（AD）检测新方法

特应性皮炎（AD）是最常见的慢性皮肤病，其影响多达20％的儿童，和7-10％的成年人（因人群而异）。该疾病非常复杂且异质，因此，找到有效的诊疗方法非常困难。此外，使用皮肤活检作为样本收集方法的方法极具侵入性，并且会造成疤痕，病人依从性很低。因此，如何借助最新的科技，找到新的“尽量无创”、“低样本量需求”、“高灵敏度”的新的检测方法，对于特应性皮炎（AD）等皮肤类疾病，显得极为重要。概述
在今天给大家介绍的这篇文章中，来自维也纳医科大学的Rojahn等皮肤医学科学家（2020年）通过探究，为我们展示了“Olink高灵敏度体液蛋白质组”和“单细胞转录组”如何互相补充，作为对于特应性皮炎（AD）的检测新方法，协同帮助揭示 这一“复杂的、人类认知尚且不足的疾病”的疾病的机理。研究方案
在这项研究中，Rojahn等试图测试一种被称为“皮肤吸泡Suction Blister”的方法，与皮肤活检不同，该方法侵入性和痛感较小，并且同时可以实现：1. 从皮肤细胞进行转录组分析，2. 对来自水泡的组织液进行蛋白质组学分析。由于水泡的样本量很低，并且其中的目标检测蛋白丰度低，需要高灵敏度、动态范围宽的蛋白质组检测方法。在此研究中，科学家同时用了Olink的Neurology，Inflammation和Immune三个96-plex panel，来分析来自于8个AD样本和8个健康对照的368种蛋白质；并与单细胞RNA转录组学（scRNA-seq）结合使用。结果解析
转录组学数据揭示了关键的炎症途径，并且比使用皮肤活检得到的相关数据分辨率更高。
通过用Olink蛋白质组学数据对scRNA-seq数据进行补充对照，研究人员发现，两种方法均识别到的目标蛋白中，有67%在特应性皮炎AD样品中表现出相较于健康对照样品中有相应的上调或下调。此外，Olink蛋白质组学还识别到了scRNA-seq尚未检测到的另外几种蛋白质。具体而言，髓样树突状细胞和相关蛋白质是特应性皮炎AD样本中扩展最多的免疫种群。通路富集分析还检测到了细胞因子与细胞因子受体的相互作用蛋白和其他蛋白（这些蛋白在抗原加工以及细胞外基质的呈递和重塑中起介导作用）。总体而言，实验结果为构成特应性皮炎AD疾病细胞和蛋白质组微环境的炎症分子进行了更为清晰的揭示。
结论
该研究得出的结论是，皮肤吸泡法比使用皮肤活检法监测特应性皮炎AD具有某些优势，这主要是因为皮肤细胞的转录组分析可以与起泡液的蛋白质组学分析相结合。这一点因为“mRNA的丰度无法准确反映蛋白质的丰度”而显得特别有意义。与皮肤活检相比，皮肤吸泡方法还可以使皮肤细胞具有更好的转录组学分辨率，进而给出与以往相比清晰得多的关于AD疾病机理的理解和描绘。对于在感染个体之间如此异质的疾病，这种清晰度至关重要。相关阅读

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