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战略合作 | 联川生物成为华大时空组学STOmics生态合作伙伴,携手打造优质的空间组学服务

联川生物 2024-03-27

The following article is from 华大时空 Author 华大时空



华大时空组学技术Stereo-seq是一项基于DNA纳米球测序芯片自主研发、可实现超高通量和超高精度的全景式时空转录组技术,它将认识生命空间的分辨率提升至500 nm的亚细胞层级,相比国际同类技术分辨率提升了40,000倍。Stereo-seq目前已被成功应用到动物胚胎发育、植物发育、脑科学、肿瘤等多个领域,并助力研究人员在Cell、Science、Nature等顶级学术期刊上发表近30篇文章。


近日,华大时空组学STOmics与联川生物达成战略合作,联川生物正式成为华大时空组学STOmics生态合作伙伴联川生物在单细胞及空间转录组平台积累了丰富的服务经验,在样本制备和生物信息学分析,以及云分析平台方面充分发挥自身优势,为客户提供优质服务。


此次联川生物全面引进华大时空组学技术,将为研究人员提供更高精度的空转检测服务,助力广大科研工作者在生命结构、疾病机制、生长发育机制等研究领域获得新的认知。



Stereo-seq技术优势


纳米级分辨率,实现亚细胞级分子定位

Stereo-seq的检测分辨率可达到500 nm,能实现对单个细胞及分子信息进行空间定位和检测。



厘米级全景视场,检测组织大小可定制

Stereo-seq设计的常规芯片大小为1 cm×1 cm,同时可依据组织大小定制不同尺寸的芯片。华大时空组学现已推出时空芯片S0.5,该芯片尺寸为0.5 cm×0.5 cm,可灵活兼容现有技术流程,极大地提升芯片利用率,同时依旧可以实现高水平的细胞分割。未来,华大时空组学还将根据实际科研需求推出大尺寸芯片。



物种组织不设限,人、动物及植物多覆盖

Stereo-seq目前已研发了针对人、不同动物及植物的各部位组织器官的检测方法,完成了多种动植物的组织器官研究。



自主研发时空云平台STOmics Cloud

加速科研转化

Stereo-seq配套搭建了领先的多组学数据分析平台空云平台STOmics Cloud,支持用户在线进行时空组学数据挖掘和分析结果可视化,全链助力时空科研成果产出。


同时,时空云平台STOmics Cloud基于大语言模型,创新建立了人工智能应用StereoCopilot,可以灵活辅助研究人员进行科研设计、数据分析及文章撰写等。


小鼠大脑演示数据



关于联川生物


杭州联川生物致力于为全球各地的科研用户提供基因组、转录组、表观组、蛋白组、代谢组,以及单细胞和空间组学测序服务。


单细胞和空间转录组测序是联川重点科研服务产品,联川生物在样本制备和生物信息学分析,以及云分析平台方面充分发挥自身优势,为客户提供优质的服务。


目前联川生物已经与多个国家及地区的100多个科研院校、医院、制药公司建立起了长期的合作伙伴关系,累计发表单细胞和空间转录组测序相关的SCI高质量论文已超过130篇,影响因子平均15+,其中空间转录组相关文章10余篇(包含单细胞&空间转录组联合分析文章)。联川在单细胞&空间组学整合分析具备成熟的流程和云分析工具,对于数据挖掘和生物学故事具备深度的理解力,是值得信赖的多组学整合专家。


关于华大时空组学


华大作为时空组学领域的重要推动者,在2020年发布了自主研发的时空组学技术Stereo-seq,华大时空组学STOmics应运而生,助力生老病死、意识起源、万物生长、生命起源等重大科学问题的研究与应用。


2022年,凭借能同时实现“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的技术优势,Stereo-seq助力研究人员陆续在Cell、NatureScience三大顶级学术期刊发表胚胎发育、器官再生、疾病等领域的重要成果。


秉承华大集团“基因科技造福人类”的使命,华大时空组学STOmics将积极推进全球科研合作,同时致力于促进时空组学技术的产业化应用,为科研和临床领域带来新的认知及价值。


特别关注



为助力研究人员在肿瘤、免疫等病理方面的科研探索,华大时空组学STOmics将在近期面向时空生态合作伙伴及其他试剂盒重点用户发起“时空试剂盒新品(兼容FFPE样本)的早期试用计划”


研究人员通过该方案能够对福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的组织切片,从空间维度进行全转录组信息的捕获及可视化分析。


具体细则将在后续公布,关注华大时空公众号及时了解最新产品动态。


参考文献:

Chen A, Liao S, Cheng M, et al. Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball-patterned arrays[J].Cell, 2022,185(10):1777-1792.e21. doi:10.1016/j.cell.2022.04.003.


题图 | 彭卫

排版 | 小鱼

审核 | 晓黎



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