2020年ASMS美国质谱年会 | 专题报道之Cancer & Biomarker
2020年，新冠疫情席卷全球，但并未能阻挡科学技术前进的脚步。6月1日-12日间，全球质谱届最重要的年会之一——2020美国质谱年会（ASMS 2020）如期举行。不同以往的是，受疫情的影响，本届年会转移至“线上”，采用网络会议形式举办。我们将持续关注，为您带来本届大会最新报道。
这些技术的不断涌现与发展，为蛋白质组学在基础科研和临床转化应用领域带来了无限可能，尤其是在癌症以及其他疾病的标志物筛选方面成果丰硕。本次ASMS大会也针对Cancer和Biomarker领域分别设立相应专题，来展示新技术在疾病和临床应用上的最新进展。
1. 肿瘤细胞系的百科全书的定量蛋白组学研究
Quantitative Proteomics of the Cancer Cell Line Encyclopedia
大会上，来自美国哈佛医学院Steven P. Gygi课题组的David Nusinow博士给大家分享了其2020年1月发表在Cell上的最新研究。
研究者通过TMT标记定量方法，对癌细胞系百科全书（Cancer Cell Line Encyclopedia，CCLE）中375种不同来源细胞系的数千种蛋白质进行定量蛋白质组分析，这些细胞系来自22个组织谱系，包括体液和实体瘤并涵盖了其起源组织中的多种亚型。作为CCLE项目的一部分，研究的蛋白组数据能与CCLE原有的多维组学数据如RNA表达，遗传突变等相结合，极大地促进了癌细胞行为的探索与癌症治疗的研究。
2. 三阴性乳腺癌代谢重编程的多组学研究
Multi-omic discovery of metabolic rewiring in triple-negative breast cancer following mitochondrial folate transport ablation
来自威尔康奈尔医学院的Qiuying Chen博士给大家带来关于质谱依赖的多组学技术包括蛋白组、代谢组等在三阴性乳腺癌代谢重编程中的应用研究的报告。
线粒体中四氢叶酸THF介导的反应能为嘌呤、嘧啶以及DNA/RNA、蛋白和脂质的甲基化提供一碳单元，尽管靶向线粒体叶酸介导的1C代谢是癌症化疗领域重点关注的方向，但是靶向该途径药物的研发却因为SHMT1介导的胞质1-C单元的补充合成而失败，因此了解胞质1C单元转换的代谢重编程能帮助预测新的治疗靶标。
本次报告的研究通过蛋白组学、非靶代谢组学、同位素标记以及转录组分析等方法，在线粒体叶酸转运蛋白（SLC25A32）敲除三阴性乳腺癌（TNBC）细胞系的实验模型中鉴定到了支持SHMT1活性上调的酶源，并发现其能作为与抗叶酸联合使用的新治疗靶点。
3. 自动样本制备和质谱在微量临床组织样本中的蛋白质组学研究
Streamlined Proteomic Profiling of quantity-limited Clinical Tissue facilitated by automated Sample Preparation and Mass Spectrometry
来自德国肿瘤研究中心（DKFZ）的Torsten Mueller博士给大家带来了关于微量临床组织样本的蛋白组学分析的报告。分子分型的研究补充了组织病理学常规分析，对于改善疾病分类，诊断准确性和治疗开发具有重要意义，而基于质谱（MS）的蛋白质组学技术在该领域发挥越来越重要的作用。
本次报告作者介绍了其研究团队建立的一个通用的自动化工作流程，从而能够以最少的动手时间和低样品消耗实现常规，强大而全面的蛋白质组分析。进一步研究者通过该自动化流程对96个室间隔膜瘤的脑肿瘤样本进行研究，并将获得的蛋白质组学数据与其他组学层面数据的进行联合分析，从而实现该样本的分子谱分析以及疾病亚分类，对于疾病的预防和诊疗具有重要意义。
4.蛋白质组学揭示急性肝排斥的生物标志物
Cell and Proteoform-Specific Top-Down Proteomics Reveals Biomarkers of Acute Liver Rejection
来自西北大学的Paul M Thomas博士带来了关于蛋白质组学揭示急性肝排斥生物标志物研究的报告。移植后维持同种异体器官是世界各地临床医生面临的重大挑战。没有侵入性活检，很难在急性排斥反应之前确定移植的健康状况。
在血液蛋白图谱（BPA）的基础上，研究者应用最先进的自上而下的蛋白质组学技术，将该图谱与现代转化医学的目标整合。利用蛋白质组学和靶向蛋白质组学方法，研究者鉴定到了一组与肝移植患者临床急性排斥反应相关的血液蛋白marker，对肝移植急性排斥的预测和诊断具有重要的指导价值。
5. 蛋白组学技术在竞技运动赛马药物滥用领域的研究
Equine Biological Passport using Orbitrap Exploris 480
来自美国肯塔基大学的Sophie Bromilow博士带来了关于蛋白组学在药物滥用领域鉴定生物标志物研究的报告。尽管分析化学取得了进步并在赛马竞技运动药物滥用的检测方面具有广泛应用，但控制赛马运动的药物滥用依然面临很大的挑战，并且对赛马这项运动的声誉和公正的竞争带来严重的威胁。
报告者的研究通过对服用药物之前和之后的赛马血清样本进行收集以及处理后，通过蛋白组学进行检测并对差异蛋白分析，后续进一步通过靶向蛋白组学进行验证。找到了一组蛋白标志物，对于指示赛马运动中药物滥用具有重要的意义。
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