上海5月CRISPR/Cas9基因编辑技术学习班
举办上海5月CRISPR/Cas9基因编辑技术学习班通知
开班时间: 上海 2017年5月13-14日
CRISPR/Cas9技术培训背景介绍:
CRISPR/Cas9 是细菌和古细菌在长期选择压力中形成的一种适应性免疫防御,可用来有效抵御病毒及外源的入侵。CRISPR的Type II已经被广泛用于基因工程,它包含Cas9,crRNA和tracrRNA,其中crRNA含有能够识别20bp的靶向互补序列。Cas9,和tracrRNA组成复合体,识别并结合crRNA互补的序列,然后解开DNA双链,Cas9中的HNH活性位点剪切crRNA的互补DNA链,RuvC活性位点剪切非互补链,最终导致DNA的双链断裂(DSB),进而实现基因的敲除和插入。
目前,CRISPR/Cas9系统已经广泛用于对哺乳动物细胞,细菌,斑马鱼,小鼠,猪,猴的基因编辑。本学习班将详细讲解CRISPR/Cas9基因编辑工具原理,操作流程,理论结合实践,将让大家详细了解到具体如何利用CRISPR/Cas9技术构建基因修饰动物等。学习班将为相关科研工作人员和兴趣爱好者提供了很好的培训资源。
讲师介绍:李博士,德国慕尼黑工业大学海归博士,具有多年丰富的基因编辑实操经验
参与德意志研究基金委项目(DFG)用于人类癌症研究的转基因克隆猪模型 (SCHN971/3-1)
Ø博士导师为原英国Roslin Institute克隆羊“多莉”团队的Prof. Dr. Angelika Schnieke
Ø成功构建世界上第一头ROSA26双荧光猪模型,极具有生物医学价值(已发表)。随后,成功构建Kras点突变基因修饰克隆猪模型,该模型为构建胰腺癌大动物模型提供了有力工具,为胰腺癌相关靶向药物开发,寻找新的胰腺癌治疗手段等提供了新的动物模型。
Ø熟练掌握载体构建,基因打靶(如用传统targeting vector或TALENs, CRISPR/Cas9介导的基因Knock-out和Knock-in), Cre/loxP系统,动物细胞分离和培养,细胞转染(Electroporation, Nucleofection, Nanofection, Stemfect RNA transfection),DNA甲基化和RNA甲基化分析,焦磷酸测序,各种分子生物学实验(Southern blot, Western blot, qPCR, RT-PCR)等技术。有较强的分子生物学,细胞生物学,遗传学,生物信息学,发育生物学,动物生物技术等理论基础。
Ø博士期间共指导德国学生3人
日程安排
第一天周六上午 9:00-12:00
理论一:基因修饰技术简介
1,基因打靶与基因编辑技术(ZNF, TALENs,CRISPR/Cas9)介绍
2,CRISPR/Cas9结构和特点
3,如何使用CRISPR/Cas9系统对特定基因进行敲除或定点插入(详细方法步骤)
4,新基因编辑工具Cpf1的结构、特点、工作原理(基因编辑工具知识拓展)
5,如何使用Cpf1系统对特定基因进行敲除或定点插入
6,Cpf1与CRISPR/Cas9的异同
7,Cpf1的应用和技术展望
8,CRISPR/Cas9系统介绍的相关值得推荐的视频。
理论二:CRISPR(sgRNA)设计方法和相关网站介绍
1,sgRNA设计方法和相关网站介绍
实验一:CRISPR(sgRNA)的在线设计(请自带可无线上网之笔记本电脑或手机)(在线互动设计演练)
2, sgRNA设计后挑选sgRNA经验和心得分享。
第一天下午 13:00-18:00
实验:
1,gRNA oligos模板退火
2,退火gRNA与线性化CRISPR/Cas9载体连接,
3,连接产物转化到大肠杆菌(DH5α)
4,转化产物涂板培养
5, 基因编辑质粒ps330A和ps330S系列如何具体构建和使用。
理论三:CRISPR/Cas9作为基因编辑工具的实验用处,案例:
1,Cas9的多功能系统(如Cut, Nick, Activate, dCas9-FokI)的详细介绍。
3,利用CRISPR/Cas9构建基因修饰小鼠方法与相关基因修饰小鼠模型介绍
3,利用CRISPR/Cas9构建基因修饰大动物(猪、猴)方法与相关基因修饰大动物模型介绍
第二天周日 上午9:00-12:00
理论四:利用CRISPR/Cas9技术编辑动物细胞系
1,CRISPR/Cas9质粒细胞转染方法
2,阳性细胞克隆筛选
3,基因编辑细胞系的建立
4,基因修饰情况分析方法
实验:
1,CRISPR/Cas9重组子细菌克隆挑取,扩大化培养,鉴定,
2,基因修饰基因组DNA模板(转染CRISPR/Cas9到动物细胞后提取DNA)制备
3,目的靶基因的基因组DNA片段的PCR扩增,电泳检测PCR产物
4,PCR产物退火变性,T7E1酶切,电泳鉴定基因修饰情况
理论五:利用CRISPR/Cas9技术构建基因敲除或敲入小鼠
1,基因编辑工具CRISPR/Cas9基本背景介绍
2,sgRNA设计及其功能验证
3,小鼠受精卵分离和培养
4,CRISPR/Cas9系统显微注射到小鼠受精卵
5,受精卵显微注射后回输到代孕母鼠体内
6,PCR和T7E1分析和鉴定基因敲除小鼠(Founder)
7,基因敲除小鼠基因敲除情况分析
8,CRISPR/Cas9构建基因敲除小鼠详细实验流程归纳和总结
第二天周日下午13:00-17:00
实验:实验结果的点评与讨论
1,CRISPR/Cas9载体构建讨论
2,目的靶基因的基因组DNA片段的PCR扩增,电泳检测PCR产物结果讨论
3,PCR产物T7E1酶切,电泳鉴定基因修饰情况结果讨论
4,Sanger测序鉴定基因编辑结果
1)CRISPR/Cas9质粒阳性转化子测序结果确认
2)Sanger测序阅读基因编辑情况
3)如何从测序色谱图中阅读靶向突变等位基因型
理论六:利用CRISPR/Cas9技术构建基因修饰大型动物(猪)
1,利用CRISPR/Cas9构建基因修饰大型动物(猪)流程
2,基因修饰大型动物优势
3,利用CRISPR/Cas9构建基因修饰大动物(猪)模型介绍
理论七:CRISPR/Cas9脱靶问题分析
1,脱靶产生的原因
2,脱靶检测方法
3,降低脱靶问题的方法
理论八:
1,CRISPR/Cas9技术的发展与应用
2,新基因编辑工具Cpf1,C2C2的用法与比较
3,基因编辑工具的伦理问题
声明 illustration
本次培训班是零基础起点的。因时间有限,本次培训班不涉及具体实验操作部分,通过2天的培训强化课程训练。如果还不能熟练掌握的学员,可以免费参加第二期同级学习班。
主办方:上海遐永医药科技有限公司
酒店安排: 上海中兴和泰酒店
【收费标准】
注册费3000元每位,在4月25号之前提前确定支付的每位优惠200元(并且会将座位安排在前排),授课期间发放纸质邀请函(盖章) 按交费先后顺序确定名额及座位,注册费包含教材、午餐等费用。
下面三个质粒可以选择订购,每个质粒500元 (发票可与会务费开一起)
1,ps330A-cas9-sgRNA(可插入任意20bp靶点序列)
2,ps330S-2-cas9-sgRNA(可用于同时敲除2个靶点的载体)
3,p-p53-cas9-GFP (可用于小鼠p53基因敲除的载体)
报名方式:
扫描下面二维码识别,即可报名登记!
下面是上期基因编辑学习班图片