上海CRISPR/Cas9 基因编辑技术学习班(9 月 23-24 日)
CRISPR/Cas9技术培训背景介绍:
CRISPR/Cas9 是细菌和古细菌在长期选择压力中形成的一种适应性免疫防御,可用来有效抵御病毒及外源DNA的入侵。CRISPR的Type II已经被广泛用于基因工程,它包含Cas9,crRNA和tracrRNA,其中crRNA含有能够识别20bp的靶向互补序列。Cas9,crRNA和tracrRNA组成复合体,识别并结合crRNA互补的序列,然后解开DNA双链,Cas9中的HNH活性位点剪切crRNA的互补DNA链,RuvC活性位点剪切非互补链,最终导致DNA的双链断裂(DSB),进而实现基因的敲除和插入。
目前,CRISPR/Cas9系统已经广泛用于对哺乳动物细胞,细菌,斑马鱼,小鼠,猪,猴的基因编辑。本学习班将详细讲解CRISPR/Cas9基因编辑工具原理,操作流程,理论结合实践,将让大家详细了解到具体如何利用CRISPR/Cas9技术构建基因修饰动物等。学习班将为相关科研工作人员和兴趣爱好者提供了很好的培训资源。
讲师介绍:李博士,德国慕尼黑工业大学海归博士,具有多年丰富的基因编辑实操经验
参与德意志研究基金委项目(DFG)用于人类癌症研究的转基因克隆猪模型 (SCHN971/3-1)
Ø博士导师为原英国Roslin Institute克隆羊“多莉”团队的Prof. Dr. Angelika Schnieke
Ø成功构建世界上第一头ROSA26双荧光猪模型,极具有生物医学价值(已发表)。随后,成功构建Kras点突变基因修饰克隆猪模型,该模型为构建胰腺癌大动物模型提供了有力工具,为胰腺癌相关靶向药物开发,寻找新的胰腺癌治疗手段等提供了新的动物模型。
Ø熟练掌握载体构建,基因打靶(如用传统targeting vector或TALENs, CRISPR/Cas9介导的基因Knock-out和Knock-in), Cre/loxP系统,动物细胞分离和培养,细胞转染(Electroporation, Nucleofection, Nanofection, Stemfect RNA transfection),DNA甲基化和RNA甲基化分析,焦磷酸测序,各种分子生物学实验(Southern blot, Western blot, qPCR, RT-PCR)等技术。有较强的分子生物学,细胞生物学,遗传学,生物信息学,发育生物学,动物生物技术等理论基础。
Ø博士期间共指导德国学生3人
日程安排
第一天 周六 上午 9:00-12:00
理论一:基因修饰技术简介
1,基因打靶与基因编辑技术(ZNF, TALENs,CRISPR/Cas9)介绍
2,CRISPR/Cas9 结构和特点
3,如何使用 CRISPR/Cas9 系统对特定基因进行敲除或定点插入(详细方法步骤)
4,新基因编辑工具 Cpf1 的结构、特点、工作原理(基因编辑工具知识拓展)
5,如何使用 Cpf1 系统对特定基因进行敲除或定点插入
6,Cpf1 与 CRISPR/Cas9 的异同
7,Cpf1 的应用和技术展望
8,CRISPR/Cas9 系统介绍的相关值得推荐的视频。
理论二:CRISPR(sgRNA)设计方法和相关网站介绍
1, sgRNA 设计方法和相关网站介绍
实验一:CRISPR(sgRNA)的在线设计(请自带可无线上网之笔记本电脑或手机)(在线互动
设计演练)
2, sgRNA 设计后挑选 sgRNA 经验和心得分享。
1
第一天 下午 13:00-18:00
实验:
1, gRNA oligos 模板退火
2, 退火 gRNA 与线性化 CRISPR/Cas9 载体连接,
3, 连接产物转化到大肠杆菌(DH5α)
4, 转化产物涂板培养
5, 基因编辑质粒 ps330A 和 ps330S 系列如何具体构建和使用。
理论三:CRISPR/Cas9 作为基因编辑工具的实验用处,案例:
1,Cas9 的多功能系统(如 Cut, Nick, Activate, dCas9-FokI)的详细介绍。
3, 利用 CRISPR/Cas9 构建基因修饰小鼠方法与相关基因修饰小鼠模型介绍
3,利用 CRISPR/Cas9 构建基因修饰大动物(猪、猴)方法与相关基因修饰大动物模型介绍
第二天 周日上午 9:00-12:00
理论四:利用 CRISPR/Cas9 技术编辑动物细胞系
1, CRISPR/Cas9 质粒细胞转染方法
2, 阳性细胞克隆筛选
3, 基因编辑细胞系的建立
4, 基因修饰情况分析方法
实验:
1, CRISPR/Cas9 重组子细菌克隆挑取,扩大化培养,鉴定,
2, 基因修饰基因组 DNA 模板(转染 CRISPR/Cas9 到动物细胞后提取 DNA)制备
3, 目的靶基因的基因组 DNA 片段的 PCR 扩增,电泳检测 PCR 产物
4, PCR 产物退火变性,T7E1 酶切,电泳鉴定基因修饰情况
理论五:利用 CRISPR/Cas9 技术构建基因敲除或敲入小鼠
1,基因编辑工具 CRISPR/Cas9 基本背景介绍
2,sgRNA 设计及其功能验证
3,小鼠受精卵分离和培养
4,CRISPR/Cas9 系统显微注射到小鼠受精卵
5,受精卵显微注射后回输到代孕母鼠体内
2
6,PCR 和 T7E1 分析和鉴定基因敲除小鼠(Founder)
7,基因敲除小鼠基因敲除情况分析
8,CRISPR/Cas9 构建基因敲除小鼠详细实验流程归纳和总结
第二天 周日 下午 13:00-17:00
实验:实验结果的点评与讨论
1, CRISPR/Cas9 载体构建讨论
2, 目的靶基因的基因组 DNA 片段的 PCR 扩增,电泳检测 PCR 产物结果讨论
3, PCR 产物 T7E1 酶切,电泳鉴定基因修饰情况结果讨论
4, Sanger 测序鉴定基因编辑结果
1) CRISPR/Cas9 质粒阳性转化子测序结果确认
2) Sanger 测序阅读基因编辑情况
3) 如何从测序色谱图中阅读靶向突变等位基因型
理论六:利用 CRISPR/Cas9 技术构建基因修饰大型动物(猪)
1, 利用 CRISPR/Cas9 构建基因修饰大型动物(猪)流程
2, 基因修饰大型动物优势
3, 利用 CRISPR/Cas9 构建基因修饰大动物(猪)模型介绍
理论七:CRISPR/Cas9 脱靶问题分析
1, 脱靶产生的原因
2, 脱靶检测方法
3, 降低脱靶问题的方法
理论八:
1, CRISPR/Cas9 技术的发展与应用
2, 新基因编辑工具 Cpf1,C2C2 的用法与比较
3, 基因编辑工具的伦理问题
4, 基因编辑工具的应用拓展。
5, 根据学员的研究内容,详细答疑如何使用基因编辑工具。
注意点:建议每人可以带笔记本电脑!
【收费标准】
注册费:2700元每位(注册费包含电子版教材、午餐,欢迎晚宴费用,住宿费自理。)
优惠措施:
1. 9月 10 号之前确认报名及转账的优惠 200 元
2. 三人组团报名,每人可优惠200元
3. 五人组团参会,领队人可以免费注册!
可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。
推荐下面三个基因编辑用的质粒可以选择订购,每个质粒500元 (发票单独开)
1,ps330A-cas9-sgRNA(可插入任意20bp靶点序列)
2,ps330S-2-cas9-sgRNA(可用于同时敲除2个靶点的载体)
3,p-p53-cas9-GFP (可用于小鼠p53基因敲除的载体)
报名方式:
扫描下面二维码识别,即可报名登记!
咨询电话:021-50327163
金老师:17701825941
王老师:13818765978
往期上海基因编辑学习班合影