全国TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班（上海班）
全国TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班
2019/1/19-20（18号报到）
上海浦东中兴和泰酒店
报名方式见文末
培训目的与培训预期
培训简介：
癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向（含30000个样本）的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加！如图1所示。
图1 基于 pubmed数据库检索的包含“TCGA”发表的SCI 文章数量（2018年11月7日）
关键靶标分析是指基于生信的方法从高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因（mRNA，miRNA，lncRNA或蛋白）。
因此，需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力以及逻辑性的生信分析思路，从海量信息中获得自己想要的关键基因！
培训预期：
1. 通过整整两天的培训，掌握TCGA，GEO数据库的使用、下载及分析思路和实用操作知识点。
2. 可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。
3. 课后还可以赠送1小时的全场串联视频，用于学员的复习。
4. 赠送一份最近5年的高价值国自然标书（医药加高价值标书库里面选择）
5. 讲师团队赠送TCGA数据库甲基化，基因表达谱整合分析报告与疾病mRNA+lncRNA分析报告
学习班组织方
主办方：医药加平台
承办方：上海遐锦生物科技有限公司
讲师简介
宋伟博士
成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。
培训经历：在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有：医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。
培训方向：《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等
时间安排 | 课程表 | 介绍 | |
第一天 | 9:00~10:00 | 生信简介 | 生物信息介绍 |
高通量：测序及芯片介绍——不同组学：转录组学、基因组学、表观组学、顺反组学、宏基因组学等。 | |||
经典生信SCI文章的解读，了解TCGA数据库、GEO 数据库这些公共数据的挖掘获得创新结论并发文章的思路。 | |||
10:15~12:00 | TCGA数据库 NCBI GEO数据库 | TCGA数据库：最全的癌症高通量数据公共库(简介) | |
TCGA数据库的产生过程 | |||
TCGA数据库的介绍和使用（包含了转录组、基因组、表观组和临床信息数据） | |||
GEO数据库介绍： 数据量最大的高通量公共数据库。 | |||
GEO数据库的高通量芯片数据查找、筛选、探针转换、差异分析等。 | |||
13:30~15:00 | TCGA相关的下载工具 | TCGA数据库癌症数据下载：RNA-seq数据、miRNA-seq数据、甲基化数据、基因组数据及临床信息数据的下载 | |
15:20~17:00 | TCGA相关的分析工具 | TCGA数据分析——突变分析、差异分析、关联分析、生存分析、miRNA调控靶基因分析等。 | |
第二天 | 8:30~12:00 | TCGA数据的后续高级分析工具实战 | 功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析 |
通路map图构建 | |||
聚类热图制作 | |||
蛋白互作分析（PPI）及网络图构建 | |||
网络分析及hub蛋白/基因获得。 | |||
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13:30~15:00 | TCGA数据库与GEO数据库挖掘 | 基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全转录组整合分析思路演练 | |
基于TCGA的甲基化与转录组整合分析思路演练 | |||
基于TCGA的基因组与转录组整合分析思路演练 | |||
基于GEO数据库多套数据整合（meta）分析思路演练 | |||
15:20~16:30 | 整体演练 | 在电脑上快速完成从头到尾的一套数据实战，及答疑 |
示例图 通路富集分析结果图
示例图 GO富集分析结果图
示例图 聚类热图分析
示例图 蛋白互作网络图
示例图 pathway map图
示例图 关键基因的KM生存曲线图
示例图 venn图
学习费用
学习费2800元每位（学习费包含电子版教材、午餐，住宿费自理，保证学员完全掌握。）
优惠政策：
1. 提前支付转账的可提前拿到学习资料
2. 三人组团报名，每人收费2700元
3. 四人组团报名，每人收费2600元
4. 五人组团报名缴费，额外带一人免费注册！
5. 参加过医药加测序与芯片数据挖掘的学员只要再支付1000元
可以开正规会务发票，纸质邀请函（盖红章）。
注意事项：携带windows系统的电脑，苹果电脑请务必提前做好双系统。现场不得录音录像。
报名咨询与报名方式
报名咨询可联系 金老师 18917745941 王老师 13818765978
报名方式一：
报名方式二：邮件方式
发报名邮件后若24h内未收到回复，请及时电话联系确认
为保证最快速的给您回复，请按下列格式撰写邮件发送到指定报名邮箱 ：13818765978@163.com
报名邮件内容模板：（同期有其他会议举办，请不要省略所参加的是哪个会议）TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班，以下是我的信息：
1、姓名：
2、性别：
3、邮箱：
4、手机：
5、参加场次：请写明参加期数 以及几月几日 北京还是上海的场次，以免弄错
6、发票抬头：如不确定，先留空。
7、纳税人识别号或统一社会信用代码：如不确定，先留空。
8、是否预订住宿：如需预订住宿请注明，一般默认住宿时间是从会议前一晚到会议最后一天中午退房，如果有特殊需要请注明。
9、备注：备注说明写在此，如有多人参加，请将姓名、性别、邮箱、手机在上面分别单独列出，备注中写明一位主要联系人。
住宿安排
住宿：（不强行规定，可自己预订附近其他酒店，费用自理）
2019/1/19-20（18号报到）
上海浦东中兴和泰酒店。 普通大床/标间： 400元， 商务标间 500
报名咨询
报名咨询电话：021-50327163
金老师：18917745941
王老师：13818765978
近期医药加学习班安排如下，如需要报名，请加学习班秘书微信yiyaojia01
| 12.15-16号 | 北京金泰绿洲大酒店 | TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班 |
| 12.15-16号 | 北京金泰绿洲大酒店 | 第27期非编码RNA与外泌体研究策略学习班 |
| 12.15-16号 | 北京金泰绿洲大酒店 | 肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议 |
| 12.15-16 | 郑州新华建国饭店 | 第八期国自然基金标书构思与撰写班 |
| 12.14-16 | 上海中兴和泰酒店 | 第36期循证医学与meta分析（含网状meta分析）学习班 |
| 12.15-16 | 上海中兴和泰酒店 | 第10期实用医学统计与GraphPad作图学习班 |
| 12.22-24 | 上海中兴和泰酒店 | 第11期 CRISPR/Cas9基因编辑技术（包含Base editor） |
| 1.5-6 | 北京金泰绿洲大酒店 | 光遗传膜片钳技术及该领域国自然构思写作学习班通知 |
| 1.5-6 | 北京金泰绿洲大酒店 | 中药网络药理学的研究策略与实用技能研讨班 |
| 1.5-6 | 北京金泰绿洲大酒店 | 临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班 |
| 1.4-6 | 北京金泰绿洲大酒店 | 第37期循证医学与meta分析（含网状meta分析）三天精讲学习班 |
| 1.12-13 | 上海好望角饭店 | 第10期测序与芯片高通量数据挖掘学习班 |
| 1.12-13 | 上海好望角饭店 | 肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题学习班 |
| 1.19-20 | 上海好望角饭店 | 第八期国自然基金标书构思与撰写冲刺班 |
| 1.19-20 | 上海中兴和泰 | TCGA/GEO高通量数据挖掘学习班 |
| 1.19-20 | 上海中兴和泰 | 第8期医学SCI论文写作及发表技巧学习班 |
| 1.19-20 | 上海中兴和泰 | 第28期非编码RNA与外泌体研究策略与基金申请学习班 |