转录组高通量数据分析思路如何？ 这个网络课堂来告诉你
实时直播
2019年3月28日（周四）19:00
医药加平台直播间
第【1】期
《转录组高通量数据分析思路》
直播结束后可反复看录播
转录组高通量数据包括样本的RNA-seq测序数据和基因表达谱芯片数据。
那么，我们做完测序/芯片实验，获得原始数据之后，有哪些标准分析以及高级分析呢？分析的创新性思路是怎么设计的呢？
我们整理了一篇包含“材料方法、结果及结论”的报告，然后给大家详细的讲解一下：
（1） 分析思路：材料方法、软件工具、逻辑学创新性体现；
（2） 分析结果：结果描述、结果整理、图表美化；
（3） 分析结论：有结果和有结论的区别联系。
通过以上3个方面的讲解，我们可以了解常见转录组数据分析常用的思路，常见的软件工具以及结果解读，另外也会有一些软件的实际操作讲解。
主讲人：宋伟
医药加金牌学习班讲师，有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。同时参与公司近几十场线下实操培训讲座，受到学员的一致好评。1.关注【医药加平台】公众号；
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医药加平台推出生信高级分析服务 （由医药加生信班专家讲师-宋伟博士团队提供服务）
测序/芯片/质谱公司的高通量数据标准分析结果不能直接使用，怎么办？
看到别人文献的创新思路或者漂亮图表不能生成，怎么办？
文章/标书的实验内容不够丰满，怎么办？
强强联合
生物信息是一种综合性的学科，也是一门工具。它与临床医学、动植物学、微生物学等方向有这密切的联系，通过生信分析可以——获得理论或基础的结论、指导实验方向和丰富文章内容。
我们需要“强强联合”，把各自擅长的领域联合——研究方向领域基础+生信高级分析。个性的分析服务，可以节省时间、提高质量。
高级分析特点：不同项目方向做高级生信分析，设计不同的创新思路，达到课题研究目的，获得结果（图表）及结论。
定制化数据分析内容展示
类别 | 分析项目 | 分析内容 |
单组学高通量高级分析 （基于已有的标准分析结果，添加高级分析） | 转录组学：lncRNA、miRNA、mRNA、circRNA测序/芯片数据。 基因组学：全基因组测序、外显子测序/芯片数据。 表观组学：DNA或RNA甲基化测序/芯片数据。 蛋白组学：ITRAQ质谱数据。 代谢组学：GC-MS,LC-MS,NMR 宏基因组学：16s测序、宏全基因组测序数据。 | 差异表达基因筛选； 无监督聚类的PCA或HeatMap分析； 有监督聚类的OPLS-DA分析； 基因上下游调控预测（miRNA，TF）； VENN图分析； 蛋白与蛋白互作网络分析； WGCNA模块分析； 基因相关性分析； lncRNA（circRNA）与mRNA共表达分析及网络构建； 关键lncRNA（circRNA）或miRNA功能分析； 竞争内源RNA（ceRNA）预测； 多组样本不同时间（浓度）递增数据分析； 筛选关键基因（lncRNA、circRNA或mRNA）； GSEA富集分析； 生存预后分析； |
基于公共数据库的高级分析。 | 基于TCGA/GEO/SRA/EBI数据库做癌症靶标预测（miRNA, lncRNA, mRNA）和通路功能筛选。 多套数据整合分析. | |
多组学整合分析（基于标准分析结果，添加高级分析） | 全转录组整合分析； 转录组与蛋白组整合分析； 蛋白组与代谢组整合分析； 基因组与转录组整合分析； 表观组与转录组整合分析； | |
个性化定制分析（想法帮你实现） | 根据需求做图、做表； 基于参考文献思路进行生信分析； 基于客户制定的分析思路进行生信分析。 | |
中药/单体网络药理学分析 | 中草药单体成分分析及有效成分预测 药物单体靶标蛋白预测及功能分析 药物功能网络药理学分析 |
关于我们
宋伟博士服务团队
成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发，每年为科研院所的几百个生信分析项目提供高级分析服务。
研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。
生信高级分析服务评估咨询：医药加范经理， 15301721511 （手机，微信号）
几年来参加过医药加金牌学习班的学员，很多学员都已经发了SCI或者拿了国自然， 我们会提供完善的售后服务，讲师也会在微信群里回答学员提出的技术问题，我们郑重承诺：一直陪伴你发SCI或者拿了国自然为止。
学习班时间： 见课程安排表 学习班地点：见课程安排表
咨询报名：请加学习班秘书微信yiyaojia01
上海课程时间地点安排表
| 3.28-29 | 上海中兴和泰酒店 | 第七期中药网络药理学的研究策略与实用技能研讨班 |
| 3.29-31 | 上海中兴和泰酒店 | 第40期全国循证医学Meta分析及网状Meta分析学习班通知 |
| 3.30-31 | 上海中兴和泰酒店 | 第三期全国临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班 |
| 3.30-31 | 上海中兴和泰酒店 | 2019全国科研作图高级学习班 |
| 3.30-31 | 上海中兴和泰酒店 | 第29期非编码RNA与外泌体研究策略与基金申请学习班 |
北京课程时间地点安排表
| 3.23-24 | 北京金泰绿洲大酒店 | 第12期测序与芯片高通量数据挖掘学习班 |
| 3.23-24 | 北京金泰绿洲大酒店 | 肠道菌群与代谢组学课题设计及研究策略专题学习班 |
| 3.23-24 | 北京金泰绿洲大酒店 | 第11期实用医学统计与GraphPad作图学习班 |
| 4.3-4 | 上海中兴和泰酒店 | 第13期测序与芯片高通量数据挖掘学习班 |
| 4.13-14 | 上海中兴和泰酒店 | 第5期肠道菌群与代谢组学课题设计及研究策略专题学习班 |
| 4.13-14 | 上海中兴和泰酒店 | 第7期R语言数据分析实战技术培训班 |
| 4.13-14 | 上海中兴和泰酒店 | 全国第9期临床研究设计学习班 |
| 4.13-14 | 上海中兴和泰酒店 | 全国光遗传与膜片钳技术学习班通知【上海 4.13-14】 |
| 4.20-21 | 上海中兴和泰酒店 | 第10期医学SCI论文写作及发表技巧学习班 |
| 4.25-26 | 北京金泰绿洲大酒店 | 第8期中药网络药理学的研究策略与实用技能研讨班 |
| 4.27-28 | 北京金泰绿洲大酒店 | 2019全国科研作图高级学习班 |
| 4.27-28 | 北京金泰绿洲大酒店 | TCGA/GEO高通量公共数据库挖掘学习班 |
| 4.27-28 | 北京金泰绿洲大酒店 | 第30期非编码RNA与外泌体研究策略与基金申请学习班 |
| 4.26-28 | 北京金泰绿洲大酒店 | 第41期循证医学与meta分析（含网状meta分析）三天精讲学习班 |