这15项生物信息学软件著作，都有哪些工具让你来用？

生物医学科研之家 2022-04-16

医药加平台（上海遐永医药科技）最近拿到了下面15项软件著作，如果您对其中的某项感兴趣，欢迎您联系我们一起深度合作，联系方式见文末。

如您看了某篇最新发表的高分文章的创新思路与漂亮图表，让你心里很痒痒，想模仿这篇文章的生信分析的套路，如何来学呢？

宋伟老师简介

个人成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。

培训经历：在上海、沈阳、济南、武汉、成都等城市举办过几十场培训班。培训的对象有：医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。

培训方向：《测序与芯片数据分析》、《TCGA/GEO数据库挖掘分析》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》、《ceRNA网络构建分析》等。

医药加平台推出生信高级分析服务 （由医药加生信班专家讲师-宋伟博士团队提供服务）

强强联合

生物信息是一种综合性的学科，也是一门工具。它与临床医学、动植物学、微生物学等方向有这密切的联系，通过生信分析可以——获得理论或基础的结论、指导实验方向和丰富文章内容。

我们需要“强强联合”，把各自擅长的领域联合——研究方向领域基础+生信高级分析。个性的分析服务，可以节省时间、提高质量。

高级分析特点：不同项目方向做高级生信分析，设计不同的创新思路，达到课题研究目的，获得结果（图表）及结论。

定制化数据分析内容展示：

类别	分析项目	分析内容
单组学高通量高级分析（基于已有的标准分析结果，添加高级分析）	转录组学：lncRNA、miRNA、mRNA、circRNA测序/芯片数据。基因组学：全基因组测序、外显子测序/芯片数据。表观组学：DNA或RNA甲基化测序/芯片数据。蛋白组学：ITRAQ质谱数据。代谢组学：GC-MS,LC-MS,NMR 宏基因组学：16s测序、宏全基因组测序数据。	差异表达基因筛选；无监督聚类的PCA或HeatMap分析；有监督聚类的OPLS-DA分析；基因上下游调控预测（miRNA，TF）； VENN图分析；蛋白与蛋白互作网络分析； WGCNA模块分析；基因相关性分析； lncRNA（circRNA）与mRNA共表达分析及网络构建；关键lncRNA（circRNA）或miRNA功能分析；竞争内源RNA（ceRNA）预测；多组样本不同时间（浓度）递增数据分析；筛选关键基因（lncRNA、circRNA或mRNA）； GSEA富集分析；生存预后分析；
基于公共数据库的高级分析。	基于TCGA/GEO/SRA/EBI数据库做癌症靶标预测（miRNA, lncRNA, mRNA）和通路功能筛选。多套数据整合分析.
多组学整合分析（基于标准分析结果，添加高级分析）	全转录组整合分析；转录组与蛋白组整合分析；蛋白组与代谢组整合分析；基因组与转录组整合分析；表观组与转录组整合分析；
个性化定制分析（想法帮你实现）	根据需求做图、做表；基于参考文献思路进行生信分析；基于客户制定的分析思路进行生信分析。
中药/单体网络药理学分析	中草药单体成分分析及有效成分预测药物单体靶标蛋白预测及功能分析药物功能网络药理学分析