【医药加】生物医学Python语言零基础学习班（10月3-5日）
题目：circRNA创新分析思路讨论
8月12日晚20：00准时开播，点击生信之家视频号名片，关注即可参加。
2021年10月3-5日 腾讯会议网络会议室
【课程背景】Python是一种结合解释性、编译性、互动性和面向对象的脚本语言。它设计简洁，具有很强的可读性。Python目前拥有众多专用的科学计算扩展库，以及生物信息学专用的Biopython，为分析处理生物信息学数据提供了强大功能。越来越多的科研人员开始学习Python语言用于机器深度学习，来处理实验数据、制作图表。
【课程特色】
1. 本课程覆盖python基础知识，通过atom程序编辑软件进行python程序写作。
Deep learning,决策树，支持向量机，神经网络
3. Github程序库介绍，Git使用下载、上传、协作软件编辑，
4. Python基本软件包Numpy、Pandas、Matplotlib、SKlearn及磁共振软件包nibabel介绍
5. 本课程手把手，实操性强，有全程屏幕录制视频课后发给学员，组群学员微信群便于学员与讲师互动交流
【讲师背景】
博士生导师。研究方向生物物理、生物光子学、生物医学虚拟场景开发。05获中科院分子发育生物学硕士学位，08年获美国东北大学物理化学硕士学位，13年获美国密苏里大学哥伦比亚生物物理博士学位与统计硕士学位，13-18年在加州大学伯克利分校博士后。目前已在Cell,Nature Communications,EMBO reports，ACS Sensors等杂志发表文章十余篇。
【主要内容】详细内容见课表
Git软件使用、Python编程详解
【学习目标】
通过学习，让学员掌握：Git、Atom的基本使用、python数据结构；python的输入输出、方程、模块、循环、算法、寻找bug；python常见软件包numpy、pandas、matplotlib、SKlearn、nibabel等安装使用及软件包功能介绍；通过python进行小的数据、图像、数学、统计计算分析;python深度学习介绍，人工智能训练线性及卷积神经网络。
时间：2021年10月3-5日，2日晚19点预备课，指导软件安装 ，7日晚19点指导答疑。
地点：腾讯会议网络会议室
主办方：上海遐永医药科技有限公司
收费标准：
3800元/人， 注册费包含教材、但不包括住宿费和晚餐。
优惠措施：提前报名并付费可以提前拿到学习资料
3人组团，每人优惠100元，4人组团，每人优惠200元
6人组团，可免一人注册费（即只交5个人的费用）
参加复听的学员，每人只需交600元费用（可以这次一起向单位多申请600元）
交费方式：
A：支付宝付款
账户：yonghong1028@126.com
账户信息：医药加-上海遐永医药
实名：金永红（大金额转账时可能需要您补全全名）
B:转账
账户名称：上海遐永医药科技有限公司
账户号：31050161413600000900
开户行：中国建设银行上海川沙支行
C：公务卡支付
报名方式：
王老师 13818765978（微信同号） 13818765978@163.com
填写报名表后发送至报名邮箱，若发送邮件后24h未收到任何回复，请及时联系
Python学习班课程安排 | |||
日期 | 时间 | 主要内容 | 详细内容 |
备课 | 19:00-20:30 | 软件安装 | Git、Atom、Python安装 |
第一天上午 | 9:00-10:30 | 计算机语言基本介绍 | 计算机语言介绍、不同语言比较、Python的优缺点、Github介绍 |
程序的组织与写作、Git介绍 | |||
基本数学计算、变量、字符、文字 | |||
交互式输入与输出、上载与下载文件 | |||
10:30-10:45 | 休息 | ||
10:45-12:00 | 计算机语言数据结构与逻辑教学 | 交互式输入与输出、上载与下载文件 | |
循环与逻辑 | |||
数据结构：序列和字典 | |||
12:00-13:00 | 午休时间 | ||
第一天下午 | 13:00-15:30 | 编程基本讲解与Python软件包教学 | 面向对象编程 |
模块、类与对象 | |||
Python软件包，如何制作并使用 | |||
Debugging、自测试 | |||
15:30-15:45 | 休息 | ||
15:45-18:00 | 基本程序写作及网络数据挖掘写作 | Python统计计算，均值、方差、t统计、p值、pdf和cdf统计分布图 | |
基本网络数据挖掘写作 | |||
第二天上午 | 9:00-10:30 | Matplotlin软件包及实操（一） | Matplotlin软件包介绍 |
现状图、柱形图、散点图、 | |||
轮廓图、图像保存 | |||
一般图像的输入、输出 | |||
10:30-10:45 | 休息 | ||
10:45-12:00 | Matplotlin软件包及实操（二） | 矩阵基础、数字图像是什么？ | |
基本图像数字处理、平移、缩放、旋转 | |||
Affine转化、图像切割、多图绘制 | |||
12:00-13:00 | 午休时间 | ||
第二天下午及晚上 | 13:00-15:30 | Numpy软件包介绍及实操（一） | Numpy软件包介绍、数组属性 |
创建数组、数值性质、切片索引 | |||
高级索引 | |||
15:30-15:45 | 休息 | ||
15:45-18:00 | Numpy软件包介绍及实操（二） | 广播、数组迭代 | |
数组操作、位运算、字符串函数 | |||
数学函数、统计函数、基础统计介绍 | |||
矩阵库、线性代数运算 | |||
18:00-19:00 | 晚饭及休息时间 | ||
19:00-22:00 | mxnet软件包介绍及实操 | 线性神经网络、softmax回归 | |
图像分类MNIST | |||
多层感知机 | |||
深度学习计算，卷积神经网络 | |||
第三天上午 | 9:00-10:30 | Pandas软件包介绍及实操 | Pandas软件包介绍 |
选择数据、设置值处理、数据丢失、合并出图 | |||
全基因组sgRNA数据的分析、sgRNA序列提取、GC含量、sgRNA位置信息提取、sgRNA序列比对 | |||
10:30-10:45 | 休息 | ||
10:45-12:00 | Biophython软件包介绍及实操 | 基因序列管理、比对 | |
DNA序列转录、翻译 | |||
多序列比对、序列输入输出 | |||
Nibabel软件包及实操 | Nibabel软件包介绍 | ||
磁共振MRI数据读取 | |||
矩阵提取、结果可视化、运动矫正、线性回归 | |||
磁共振MRI数据读取 | |||
12:00-13:00 | 午休时间 | ||
第三天下午 | 13:00-15:00 | Scikit learn软件包及实操 | 矩阵提取、结果可视化、运动矫正、线性回归 |
线性回归 | |||
分类、无监督 | |||
数据降维、数据预处理、PCA、K-means、支持向量机SVM、决策树 | |||
15:00-15:15 | |||
15:15-17:00 | Tensorflow深度学习介绍 | 卷积、正向反向传播、优化器、损失函数、池化、BN | |
LeNet, AlexNet, VGGnet, Inception, ResNet网络介绍与应用 | |||
图网络与超图网络介绍 | |||
备注：务必自带电脑，要求windows系统，有大于50G可用内存。学习班可提供安装包 | |||
医药加平台已经聘请了上百位各研究领域的专家（以医学，生命科学教授为主），都具有丰富的课题设计指导，高水平论文指导，国自然项目评审经验。 医药加金牌学习班自开办以来，已经成功举办了几百期，培训了全国（包涵港、澳、台地区）及加拿大、丹麦、澳大利亚等国家超过千家科研单位的近万名学员。良好的课堂氛围和讲师耐心的课后跟进，获得了学员的交口称赞。医药加金牌学习班，是让学员们真正能够学以致用，在科研上更上一层楼的学习班。 2017-2021年医药加学习班全年数据：金牌学习班场次：500+培训出的学员人次：15000+开设金牌课程数量：20门+开班城市：北京，上海，广州，深圳，南京，成都，武汉，长春，哈尔滨，大连，昆明医药加网络课堂参与人次：10万人次培训合作单位有：中科院，北大，清华，交大，浙大，复旦，南大，山大，吉大，武大，协和，首都医科等各地医科大学，全国各省中医药大学，以及全国各省市三甲医院。
医药加科研培训中心已经为上千位学员指导并发表SCI文章，很多学员中标了国自然项目。医药加平台有上百位国自然评审专家（教授，三项以上国自然主持经历，单篇SCI影响因子10以上），都具有丰富的SCI文章，国自然标书评审经验。
【医药加】课题/文章，专家精准匹配，课题辅导设计评审咨询
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| 8.14-15 | 临床预测模型 | 医药加腾讯会议 |
| 9.11-9.12两天，13~16号四晚 | 全转录组学训练营 | 医药加腾讯会议 |
| 8.21-22 | 高级科研作图现场精讲班， | 腾讯会议 |
| 8.21-22 | 全国R语言数据分析实战技术网络学习班（理论+实践课) | 医药加腾讯会议 |
| 8.21-22 | 医学SCI写作学习班 | 医药加腾讯会议 |
| 9.4-5 | 光遗传/膜片钳/网络学习班 | 医药加腾讯会议 |
| 9.4-5，6~9号晚上 | 非编码RNA与外泌体研究策略与数据分析网络精讲班 | 医药加腾讯会议 |
| 9.11-12 | RNA甲基化（M6A）数据分析与课题设计精讲班 | 医药加腾讯会议 |
| 9.11-12 | 基因编辑技术与动物模型构建网络精讲班 | 医药加腾讯会议 |
| 9.17-19 | 多组学数据整合分析挖掘3天精讲班 | 医药加腾讯会议 |
| 9.18-19 | 2022国自然基金标书课题构思辅导班（个性化现场点评辅导） | 上海中兴和泰酒店/腾讯会议 |
| 9.18-19 | 中药网络药理学的研究策略与技能及分子对接网络精讲班 | 腾讯会议 |
| 9.25-26 | 循证医学Meta分析及网状Meta分析精讲班 | 腾讯会议 |
| 9.25-26 | 肠道菌群与代谢组学课题设计网络精讲班 | 医药加腾讯会议 |
| 10月3号~5号，2号晚上 ，7号晚上 | 生物医学Python语言零基础学习班 | 医药加腾讯会议 |
| 10月15号~17号 | TCGA,GEO生信高通量数据挖掘两天两晚精讲班 | 医药加腾讯会议 |
为帮助医药加新老学员系统掌握生物信息，基础研究，临床研究思路与技能，从而能全面，系统，迅速提升学员的科研创新能力。考虑目前还在疫情期间的实际情况，我们设置了下面在线实操学习班（每月轮回开班），为了保证学习效果，我们采用网络会议平台授课+视频回放，互动体验效果好！欢迎科研单位来联系预约，如有需要，医药加专家教授还可以提供一对一的课题指导，授人以渔！
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