全转录组高通量测序&芯片数据生信分析实战训练营！
医药加生信训练营预览
【医药加】全转录组高通量测序&芯片数据生信分析实战训练营
（训练营时间：2022.1.15-16日白天，16~19号四晚）
为了保证训练营效果，我们腾讯网络会议平台授课，效果体验好！参加本次两天四晚训练营的学员，培训结束后可以获得全套视频，可通过微信群免费咨询，每周都可以免费进宋老师的腾讯会议参加宋老师的直播互动，学员可以获赠一份高价值标书参考。
培训简介
转录组数据除了mRNA之外，还有miRNA、lncRNA和circRNA等非编码RNA。它们在生物医药领域也起到了非常关键的作用。2019年度国家自然基金医学科学部共批资助10138项目，批助金额总计441310万元。初步统计，这些项目中大部分都与编码基因有直接或间接的关联。其中与miRNA相关的有630项，金额2.3亿；与lncRNA相关的有395项，金额1.45亿；如何获得有创新意义的疾病靶标基因（mRNA，lncRNA，circRNA，miRNA等）是项目申请及文章写作时最常见的问题。因此我们基于全转录组数据分析的思路，把RNA层面的mRNA、LncRNA、circRNA和miRNA等分子分别给大家做一个分析实操，以及整合这几个RNA的分析思路（具体参见课程表）。
为了适应生物医药科研工作者的学习效率，我们开展了此次训练营培训班。通过周末2天外加4个晚上的学习，我们在不影响正常工作的情况下，学习全转录组RNA分子的生信分析思路对项目及文章的帮助，以及实操常见的数据库、在线工具和本地软件（涉及了各种RNA分子相关的数据库、在线工具、免疫细胞浸润及R语言简单作图操作）。使得学员可以自己完成一个完整的分析报告并获得疾病相关的靶标基因。
讲师简介
宋伟博士， 中国精准医疗学会委员
研究成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。
培训经历：在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有：医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。
培训方向：《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等
训练营安排
时间安排
课程表
介绍
周六
9:00~12:00
生信简介
生物信息介绍
高通量：测序及芯片介绍
非编码RNA的机制、调控模式（miRNA、lncRNA与circRNA）
经典生信SCI文章的解读，了解TCGA数据库、GEO 数据库这些公共数据的挖掘获得创新结论并发文章的思路。
非编码RNA的创新文献解读（含miRNA、lncRNA和circRNA）
免疫细胞浸润创新文献解读
TCGA数据库
NCBI GEO数据库
TCGA数据库：最全的癌症高通量数据公共库(简介)
TCGA数据库的介绍和使用（包含了转录组、基因组、表观组和临床信息数据）
GEO数据库介绍：数据量最大的高通量公共数据库。
GEO数据库的高通量芯片数据查找、筛选、探针转换、差异分析等。
周六
13:30~17:30
TCGA相关的下载工具
TCGA数据库癌症数据下载：RNA-seq数据、miRNA-seq数据、及临床信息数据的下载
TCGA数据书库癌症数据的处理，获得关键mRNA、miRNA的表达谱矩阵。非编码RNA数据库简介
miRNA 注释数据库（注释及序列下载）
lncRNA注释数据库（注释及名称转换）
circRNA注释数据库
单细胞测序
单细胞测序数据挖掘思路
周日
9:00~12:00
R语言基础
R软件与Rstudio软件下载、安装、界面。
R语言基础：元素、向量、矩阵、数组
R语言函数：计算函数、统计函数等
R语言路径确认及修改
R语言文件（图、表）的导入和导出
R语言实战
R语言包：包的下载安装
R语言：差异分析limma包使用制作
周日
13:30~17:30
R语言实战
聚类热图制作
R语言pheatmap包做聚类热图
R语言ggplot2构建功能气泡图
基因功能分析
DAVID功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析
通路map图构建
周一
19:00~22:00
免疫细胞浸润
免疫细胞浸润分析相关数据库及工具实操
免疫细胞浸润结果图片R语言作图
免疫细胞浸润结果生信结果解读
周二
19:00~22:00
miRNA分析
差异miRNA分析
miRNA-mRNA数据库（验证和预测结果）
miRNA与靶基因结合位点（MRE）分析
VENN图分析
癌症的miRNA预后分析
lncRNA分析
miRNA-lncRNA数据库
lncRNA-target分析
lncRNA参与的ceRNA分析
共表达分析
周三
19:00~22:00
circRNA分析
circRNA-seq高通量测序解读
miRNA-circRNA数据库
circRNA参与ceRNA的分析
全转录组整合思路
ceRNA（竞争性内源RNA）的机制
ceRNA关系对分析
ceRNA网络构建
周四
19:00~22:00
网络图构建
Cytoscape软件——网络图构建、美化及分析实操
结尾
串讲
分析示例图
示例图 通路富集分析结果图
示例图 聚类热图分析
示例图 网络图
示例图 pathway map图
示例图 关键基因的KM生存曲线图
示例图 柱状图与venn图
示例图 相关性散点图
示例图 免疫细胞浸润分析
示例图非编码RNA调控网络及功能富集分析（pathway）
学习费用
本期训练营学费 4200元/每位
（集中网络授课，互动性好，可开发票，可全程回放）
优惠福利政策
1. 医药加学习班新学员可以分享朋友圈优惠100。
2. 医药加学习班老学员可以分享朋友圈优惠200。
3. 三人组团每人可减免200元，四人组团每人减免300元，5人组团可额外赠送一个培训名额。
4. 参加本次训练营的学员课后可通过微信群免费咨询，每周都可以免费进宋老师的腾讯会议参加宋老师的直播互动。
注意：此次课程为线上直播教学模式，网络会议平台授课，可回放，体验与质量有保证！报名付费成功后，提前发培训需要应用到的软件与课件，并且指导安装。
本次网络训练营报名通道，扫码报名
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医药加2022全新课表，全新起航，精耕细作打造临床科研方法学培训第一品牌！
「临床科研方法训练营」简介 科研是临床医生的另外一只眼睛，临床科研对于每一个有志于成为优秀临床医生的年轻人来说都是必需品。然而，由于种种原因，临床科研方法学知识的推广和普及并不理想。虽然我们诊治了大量的患者，有大量的临床资料，但是很难设计出较好的临床研究，很难把临床研究报告发表到较高影响力的SCI杂志上。绝大多数临床证据来自于国外的临床试验结果，本土的临床证据较少。基于此，我们启动“临床科研能力提升与论文写作培训项目”，专注于推广和普及临床科研的相关方法学知识、数据统计分析处理能力、统计分析结果可视化、SCI论文的写作技能，培训课程包括但不局限于以下方面：
以临床问题为导向，介绍常用类型临床研究设计原理，包括但不局限于随机对照试验、队列研究、病例-对照研究，诊断准确性研究，真实世界研究等，临床研究方案/标书撰写、样本量计算、临床研究数据的采集、临床试验数据管理等。时长：4天，计28小时。
2. 实用医学统计与统计作图--从入门到精通实战训练营
本课程以临床问题为导向，内容包括统计误用案例辨析、实用医学统计学方法选择及相应的统计软件实现、统计结果解读及可视化等。时长：4天，计28小时。
3. 临床预测模型构建与论文撰写--从入门到精通实战训练营
本课程以临床问题为导向，介绍如何升华临床资料的价值，对临床资料进行深度挖掘；深度讲解临床研究资料统计分析中的新方法与难方法；课程中所有统计分析与作图均基于R语言完成，所以也是一门针对医学专业人员的R语言培训课程！时长：4天，计28小时。
4. 临床研究SCI论文写作与投稿--从入门到精通实战训练营
本课程内容包括临床SCI论文写作技巧，论文表格制作，论文插图处理技巧，统计图形的制作，各类型临床研究SCI论文撰写范式，临床SCI投稿技巧，与编辑审稿人沟通的技巧等。时长：4天，计28小时。
5. 基于 R 语言机器学习与医学研究--从入门到精通实战训练营
本课程是基于机器学习算法解决医学研究中复杂数据分析问题的方法学培训，深度讲解时髦的机器学习常用方法在处理临床数据中的应用，课程中的全部案例均为医学研究相关真实案例！时长：4天，计28小时。
【以上5个训练营均可微信扫描文末二维码获得详细课程表及课程介绍】
【讲师团队介绍】讲师团队教育背景均为医学博士或临床流行病与卫生统计学博士，就职于国内著名三甲医院或国外临床药物研发机构，具有丰富的临床试验设计、统计分析、医学论文撰写的实战经验，擅长从临床问题出发，以真实案例讲解为主，讲授临床研究设计与统计学理论与实践操作，授课深入浅出，通俗易懂，广受好评。
「2022训练营日程安排与学费」
训练营日程 | 训练营具体名称 | |
2021.12.18-19，2022.1.2-3，课后安排一个晚上答疑 | 临床研究设计与方案撰写--从入门到精通实战训练营 | 4600 |
2022.2.12-13，2.19-20，课后安排一个晚上答疑 | 实用医学统计与统计作图--从入门到精通实战训练营 | 4600 |
2022.3.19-20，3.26-27，课后安排一个晚上答疑 | 临床预测模型构建与论文撰写--从入门到精通实战训练营 | 4600 |
2022.4.16-17,4.30-5.1,课后安排一个晚上答疑 | 临床研究SCI论文写作与投稿--从入门到精通实战训练营 | 4600 |
2022.5.21-22,6.3-4号，课后安排一个晚上答疑 | 基于 R 语言机器学习与医学研究--从入门到精通实战训练营 | 4600 |
2022.7.16-17，7.30-31号，课后安排一个晚上答疑 | 临床研究设计与方案撰写--从入门到精通实战训练营 | 4600 |
2022.8.20-21号，9.3-4号，课后安排一个晚上答疑 | 实用医学统计与统计作图--从入门到精通实战训练营 | 4600 |
2022.10.2-10.5号，课后安排一个晚上答疑 | 临床预测模型构建与论文撰写--从入门到精通实战训练营 | 4600 |
2022.10.29-30，11.5-6号，课后安排一个晚上答疑 | 临床研究SCI论文写作与投稿--从入门到精通实战训练营 | 4600 |
2022.11.26-27，12.10-11号，课后安排一个晚上答疑 | 基于 R 语言机器学习与医学研究--从入门到精通实战训练营 | 4600 |
【特惠政策与学员福利】
1、参加过[医药加】举办的往期对应的相同学习班的老学员，按照半价收费。
2、训练营长期建立答疑群，每个月讲师团队安排一个晚上集中答疑与讨论，目的是让学员能够充分掌握并应用，及时解决学员学习中遇到的问题。
3、参加每个训练营都赠送2次评估文章或标书的服务; 报2个临床研究训练营，每个营减免200元学费，报4个训练营，每个营减免400元学费。
4、全部5个训练营都报名的学员，打包优惠学费为2万元，并可以让讲师团队互动指导修改一篇文章或标书，指导学员到完成为止。
5、网络班学员可以获得全套课程录屏用于课后复习，如经过第一轮培训答疑后，还没有完全掌握的，可以申请免费参加本年度的第二次同名训练营培训。
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