计算机辅助药物设计（分子对接）网络学习班

医药加科研培训中心，2023年3月11日-12日  腾讯会议

近年来，随着计算机科学及相关基础学科的发展与进步，基于计算机图形学、数据库技术、人工智能等新技术的药物分子设计手段正日臻成熟，不断取得突破性进展，有力推动药物设计领域日趋完善。这不仅为新药创制事业提供了新利器，更有效加速了新药成功开发的概率、缩短新药上市周期，更好地满足临床需求。

计算机辅助药物设计（computer-aided drug design，CADD）通过计算机模拟等计算方法，预测药物与受体生物大分子之间的关系，设计和优化先导化合物。这种方法大大加快了新药设计的速度，节省了药物发现的人力和物力，使药物学家能够以理论为指导，有目的地开发新药。同时，在药物机制的研究中，在用实验方法验证药物与受体的相互作用之前，通常会用分子对接的方法预测药物与靶标的结合，以节省实验花费。计算机辅助药物设计已经成为新药开发、药物机制研究中重要的研究手段之一。

一、时间地点：3月11日-12日腾讯会议

二、学习目标：

本课程系统讲解计算机辅助药物设计的关键技术，配合案例解析边讲边练，使学员能运用模拟软件针对每个技术点进行上机操作。学习班全部采用免费数据库、免费软件、和在线分析工具，学员不需要编写程序。适合零基础学员，做到课程学完，就能独立进行蛋白质结构同源建模、分子对接、虚拟筛选等计算分析。

三、授课方式：

本学习班全程在线电脑实战教学，90%以上为上机指导操作，无繁琐的理论授课。建立专属班级交流平台，学员学完后可以继续在班级群与老师同学交流问题，巩固学习内容。

四、参会对象：

各级医院临床医生、药师、科研单位研究人员、高校老师、硕/博士研究生、对计算机辅助药物设计感兴趣的广大师生（尤其适合初学者和无基础的学员，无需任何基础，也无需学习任何编程语言）。

五、主讲专家:

本次主讲老师是生物信息学博士，大学教授, 从事计算生物学、生物信息学方向研究十余年，主持参与了多项国家自然基金项目，发表数十篇SCI论文，含多篇5分以上的文章。讲课效果好，深得学员好评。

六、课程安排：

	时间	授课内容
第1天	9:00-12:00	1. 分子对接基础知识 2. 分子结构文件的获取和处理   化合物结构的获取   化合物ADMET性质预测   多肽结构的获取   蛋白结构的获取   蛋白结构的同源建模   不同格式结构文件的转换 软件介绍   蛋白对象的操作、展现、隐藏、标记、测量   分子对接结果的美化展示
13:30-17:00	1. 配体-受体结合位点可视化分析工具介绍 2. 用AutoDock及autoDock vina进行小分子与蛋白对接   准备工作   准备受体文件   准备配体文件   确定对接盒子   蛋白受体格点计算   设置对接参数   用AutoDock作分子对接   结果查看与分析   用AutoDock vina 作对接   确定对接盒子的其他方法
第2天	9:00-12:00	1.  用AutoDock Vina 作虚拟筛选 l  蛋白活性口袋的预测 l  化合物的下载与处理 l  AutoDock vina 进行一对多或多对多的对接 l  计算redocking多个pose的RMSD 2.  金属酶蛋白与小分子对接 l  用AutoDock4Zn作对接的方法 用AotoDock vina作对接的方法
13:30-17:00	1.  蛋白-多肽对接 l  用免费在线平台作对接 l  用ADCP作对接—结合位点已知的情况 l  用ADCP作对接—结合位点未知的情况 l  用autoDock vina 作对接 2.  蛋白-蛋白对接 用免费在线平台作对接
备注：自带笔记本电脑，安装WINDOWS 64位操作系统。

学习费用

学费 3000元/每位（两天集中网络授课，互动性好，可开发票，可回放）

优惠政策

1. 疫情过后，可补差价参加医药加线下同名班

2. 参加过医药加同名线下班的学员，只要300元复听费用（推荐新学员的，免收复听费用）

3. 办理了SCI或者国自然VIP年卡的学员是免费参加。

4. 新学员分享朋友圈，支付一人，可以来两人参加或者赠送一个复听名额。

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