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用Graphpad软件绘制ROC曲线!

Mr lucky yang 如沐风科研 2022-10-07

本文灵感自小狗科研、聊点学术


    ROC的全称是Receiver Operating Characteristic Curve,中文称作 “受试者工作特征曲线”, 是医学科研工作者非常熟悉的一种曲线图,常用来决定最佳诊断点你还没有Graphpad软件,那您可以文末添加小编微信索取

  

    事实上,Graphpad软件索引中,ROC曲线的绘制有简单介绍。


  

那么,接下来以sample data为例给大家介绍方法:


1
打开软件,按下图选择 



2
点击creat,生成sample data 



3
点击analyze或者results下的New Analysis


进入下一级对话框,按下图进行选择:

👇


4
点击ok,进一步按下图选择



5
下一步:出统计分析结果


注意:AUC的取值一般在0.5~1之间。AUC的值越大,说明该模型的性能越好。


6
生成图片,点击上图中的Graphs部分


得到草图


7
实际情况中,我们经常会比较若干模型的ROC曲线


如何将若干曲线整合到一张图上,生成下图的组合图呢?


点击File选择New里的New Data Table and Graph,新建一个数据表。


8
重复上述方法


得到新的ROC curve 2 


现在进行合并曲线:双击曲线2 进入format graph对话框,按下图选择:


点击add,选择曲线1,点击ok


两条曲线就合二为一了。剩下的对曲线颜色、粗细等细节的修饰:双击图片进入Format Graph对话框


9
分别对data set里的曲线A和B进行修饰


如下图:


草图经过修饰后就变成了:


对于曲线与Y轴重合的情况,为了显示清晰,可以将坐标轴变细,双击坐标轴,如下图进行调整:


最后图片就调整成型了,A曲线为了区别显示,加了数据点


10
实际操作中所有曲线要保持一致:




这样给大家演示,是不是更简单易懂呢?





另外,再给大家简单介绍下如何看懂ROC曲线。可参考内容源自聊点学术【ROC曲线专栏】如何看懂ROC曲线?(点击阅读,侵删)


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