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Kaplan-Meier生存曲线(包括统计检验、95%Cl)的简介与绘制(不用R软件)

Mr lucky yang 如沐风科研 2022-10-07
肿瘤专业的小伙伴(当然不止)一定经常用到生存曲线,1928年生存曲线(又称存活曲线)首次由美国生物学家雷蒙·普尔提出,它可以反映不同种群在每个年龄段生存的数目。

1958年,Edward L. KaplanPaul Meier也首次在临床研究中提出了生存曲线的概念,又被称作 Kaplan-Meier曲线,主要用来对各组患者的生存状况进行描述。

本次推文简单介绍不用R软件如何绘制Kaplan-Meier 曲线并作统计分析和95%Cl

首先介绍下Graphpad Prism软件如何操作:

1.打开软件,survival 模块下, 选择 use sample data (Graphpad Prism5.0,更新的版本也类似)及2组数据。需要用自己的数据可以对应修改。2.点击 ok 后出现下图 data 数据,X 轴代表天数,Y1、2 分别用 0 和 1 表示,1 代表死亡;0 代表存活。(自己的数据可以对应修改即可,当然也可以在上面第一步选择start with a n empty data table)

3.数据填充好了后,下一步就是进行数据分析了:点击 results 模块下的 survival of two groups,生成下图的分析结果:

上图中:①Log rank检验:进行两组或多组生存曲线的比较,检验统计量在大样本时近似服从X2分布自由度为分组数-1;②Log rank趋势检验;③Breslow:检验生存分布是否相同,以各时间点的观察例数为权重;④Y轴的表现形式:有percent survival/death和fraction survival/death四种选择。

 5. 统计分析结果出来了,最后一步就是作图了:选择 graphs 模块,按下图进行选择。点击creat后草图形成,如下图。然后按照个人习惯调整曲线的颜色、样式以及粗细。

最终我们获得如下Figure:

此外,有时需要添加95%Cl,可点击此处:

但最终获得的效果图似乎不是很清楚:


别急,下面还将推荐两个网站来绘制生存曲线,直接生成Figure。

1.https://hiplot.com.cn/

1.1找到生存分析

1.2输入数据(以DEMO为例):


1.3提交数据即可获得如下Figure:


2.http://www.bioinformatics.com.cn/


2.1找到生存曲线


1.2输入数据(以DEMO为例):


1.3点击参数选项后提交数据即可获得如下Figure:

    以上几种方式不用R语言软件即可获得K-M生存曲线,你学会了吗?大家可以根据自己喜好选择适合自己的生存图


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