【技巧】信号通路图如何绘制-用AI?一起决胜国自然
转自科研讲坛(侵删)
本次推文选择Adobe Illustrator(AI)绘制,为国自然基金的撰写画上点睛一笔。
另外,我们上期还推荐了用小软件Pathwaybuildertool+PPT结合绘制机制图,感兴趣点击查看:SCI文章中机制图如何设计与绘制—这个小软件+PPT可帮你搞定。
本次推文以该图为例:
转自 https://www.nature.com/articles/s41580-020-0230-3
对模式图解构,整张图的几个元素如下:
绘制时先画整体再画细节:
1. 画细胞轮廓:打开AI,新建画板,我们从简单的开始入手。首先从工具箱中选择圆角矩形工具,画一个大的圆角矩形代表细胞。
2. 画左侧的细胞核:选择椭圆工具,按住shift拖拉出一个正圆。
从菜单栏的窗口中调出渐变窗口,为正圆添加渐变的填色。
3. 画核膜:按ctrl+C复制一层正圆,ctrl+F覆盖在前面,将这个复制的正圆填色设为无,描边设成灰色。
点击控制栏的“描边”,打开描边面板,设置端点为圆头端点,在虚线处打钩,设置合适的虚线参数。
从工具箱中点击小黑箭头——选择工具,选中这个虚线正圆,点击菜单栏的对象——路径——轮廓化描边,将描边轮廓化,这样我们就可以接着对核膜描边了。
在控制栏的描边中设置描边的颜色和粗细:
设置完成后效果如下图所示:
选中这个核膜,在菜单栏中点击对象——路径——偏移路径,调出选项,如下图所示设置参数,绘制磷脂双分子层。核膜绘制完成。
4. 绘制过氧化物酶体:同样用椭圆工具按住shift键画一个正圆,置于细胞右侧,通过渐变工具设置填色的渐变,通过控制栏的描边设置描边颜色和粗细。
绘制磷脂双分子层结构:选中红色渐变正圆,选择菜单栏对象——路径——偏移路径,设置偏移参数,绘制同心圆。
5. 绘制线粒体:选择椭圆工具,画一个椭圆,设置填色和描边。
选择菜单栏对象——路径——偏移路径,设置偏移参数,绘制双层线粒体膜:
将内层线粒体填色加深:
绘制线粒体嵴:再绘制一个椭圆,填色浅一些,再设置描边颜色和粗细。
选择橡皮擦工具,由外向内拖拉,在椭圆中擦出一条条竖线。通过键盘“【】”改变橡皮擦的大小。
选择小白箭头——直接选择工具。
调节完成后,同样选择菜单栏对象——路径——偏移路径,设置偏移参数,线粒体绘制完成。
6. 绘制内质网:内质网的绘制和核膜类似,我们先选择铅笔工具,绘制三条曲线。
点击控制栏的“描边”,打开描边选项,设置为圆头端点,设置描边的颜色和粗细如下图所示:
再通过铅笔工具绘制几条短线段置于曲线之间:
选择菜单栏对象——路径——轮廓化描边,将线条变成图形:
从菜单栏窗口中调出路径查找器,选择联集,将多个图形合并成一个。
换用工具箱的直接选择工具,调节每个尖角锚点对应的同心圆(圆角工具),将尖角变成圆角。
调节好后,再确认一下填色和描边,选择菜单栏对象——路径——偏移路径,设置偏移参数:
7. 受体和配体:
绘制配体:选择多边形工具,拖拉住多边形不放,按方向键“↓”减少多边形边数直至三条边,画出一个正三角形。
选择直接选择工具,拖拉圆角调节工具,将三角形的角变圆滑:
通过渐变窗口设置渐变的颜色,通过控制栏的描边选项设置描边颜色和粗细:
绘制受体:选择钢笔工具,点击三下绘制一条折线,并设置描边颜色和粗细,选择圆头端点:
选择菜单栏对象——路径——轮廓化描边,将线段变成图形,再设置它的描边颜色和粗细:
鼠标右键——变换——对称,调出镜像选项:
选择垂直——预览——复制:
窗口关闭后将多出一根垂直对称的线段,将这根线段用选择工具移动到合适位置:
8. 画各种分子:现在我们已经画好了大的框架,以及比较难画的部分,接下来只有一些简单图形的重复摆放了。
选择圆角矩形工具,拉出一个圆角矩形,通过方向键可以调整矩形圆角的程度。打开渐变窗口通过调整渐变滑块设置颜色,最后设置描边的颜色和粗细。
换用文字工具,键盘输入文字,通过控制栏的字体、字号等进行设置,使用选择工具移动文字到合适的位置。
如此绘制完成所有的分子,如下图所示,同样的图形可以通过快捷键复制粘贴或者按住alt键拖拉复制。
9. 绘制箭头:最后绘制元素之间的联系,包括实线箭头、虚线箭头、直线箭头和弧形箭头。
在控制栏设置描边为黑色,描边粗细合适,点击“描边”,在箭头处下拉选择箭头,并输入缩放比例。
鼠标右键选择变换——对称,选择水平——预览——复制,复制一个向上的箭头。将这个箭头水平移动到右侧。
用选择工具框选两个箭头,或按住shift键进行多选,鼠标右键——排列——后移一层,重复此步骤直至箭头移至黄色圆角矩形的后方。
弧线箭头:绘制方法很多,比如通过弧形工具、钢笔工具、曲率工具、铅笔工具都可以。
再点击控制栏的“描边”设置箭头:
虚线箭头通过描边面板中勾选虚线进行设置:
最后这幅信号通路图就画好了:
由于是矢量图,所有的图形都可以自由编辑和修改,非常方便,而且矢量图图片高清,任意缩放清晰度不变。
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