[简讯]中国脑胶质瘤基因组图谱CGGA首次对研究者部分开放 手把手教你做科研

神外前沿讯，8月31日，北京市神经外科研究所第一期生物信息培训班举行，这对于中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)项目的发展是一个重要时刻。培训班的举行标志着这个基于中国人群建立的著名数据库CGGA)开始正式向研究者开放。第一期培训班共有来自全国各地的30名神经科学及有关领域学者参加。

CGGA由北京市神经外科研究所副所长、首都医科大学附属北京天坛医院江涛教授创立，以早日攻克脑胶质瘤为目标，计划建成包含上千例生物信息资料齐全的胶质瘤患者的数据库。此次CGGA数据库部分开放，可以让有能力的科研工作者可获取更多的数据。

江涛教授在开班致辞中表示，希望数据的开放“激励科研工作者勇攀科研高峰”

此前，美国TCGA（The Cancer Genome Atlas）数据库的建立和发展以及基于TCGA数据库的生物信息挖掘使人们对癌症有了更加深刻的认识，并为癌症的精准诊治奠定了基础。在此背景下，基于中国人群建立的CGGA (Chinese Glioma Genome Atlas) 数据库应运而生。

这届培训班利用来自于中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)，癌症基因组图谱(TCGA)等数据库，结合上机实践，手把手的传授学员如何做科研、写论文。主讲教师均从事多年生物信息学科研工作，发表过多篇SCI论文。

部分实战教学内容要点如下（都是干货）：

生物信息学专家赵征博士首先介绍了脑胶质瘤研究常用的数据资源和分析工具，从DNA、RNA和蛋白质三个水平介绍了常用的数据资源及数据资源的获取方法。其中着重讲解了三个最常用的数据库：NCBI Sequencing Read Archive (SRA) 数据库、TCGA数据库、CGGA数据库。在课程的最后，赵征博士介绍了基于CGGA数据库的科研成果，如可以指导患者化疗的EM/PM分型，可以指导患者预后的IDH/TERT分型以及可以作为药物靶点的PTPRZ1-MET (ZM) 融合基因等。

R软件是一种常用的生物信息分析工具，它集数据处理、计算与制图与一身，在生物信息分析中扮演着重要角色。北京市神经外科研究所张传宝博士对这一分析工具进行了细致的讲解。由于多数学员是第一次接触这一分析工具，张传宝博士从零开始传授使用方法，介绍了R语言的常用函数、数据类型、t检验等，并结合随堂练习使学员初步掌握了R软件的使用方法。

北京市神经外科研究所王政博士进一步为学员讲解了R软件强大的数据处理及制图功能。通过带领学员做例子的方式，使学员迅速掌握R语言的绘图规则，均能绘制出符合文章发表水平的既美观又信息丰富的图片。讲课由浅入深，循序渐进，从开始的散点图，到后来的组合图、生存曲线、ROC曲线等。王政博士带领学员领略了R软件的魅力以及科研制图中的美学。

北京市神经外科研究所胡慧敏博士系统讲解了如何基于大数据生物信息分析进行实验设计以及基因功能研究；樊小龙教授畅谈了发育生物学指导的肿瘤基因组大数据分析，并对如何有效地将生物信息分析技术与临床实践相结合进行了深入探讨；刘幸博士后向学员演示了如何将影像组学数据与基因组学数据建立关联，为学员提供了新颖的科研思路；王引言博士则通过实战演练，带领学员学习了一些常用的影像学处理软件，练习了医学影像学数据预处理及其标准化流程。在课程的最后，王引言博士还提出大家携手共建影像学数据库的设想。

素材提供：北京市神经外科研究所；稿件改写：神外前沿

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