GWAS识别与颅内动脉瘤相关的新位点
【Ref: Foroud T, et al. Stroke. 2014 Nov;45(11):3194-9. doi: 10.1161/STROKEAHA.114.006096. Epub 2014 Sep 25.】
蛛网膜下腔出血（SAH）常见于颅内动脉瘤（intracranial aneurysm，IA）破裂。动脉瘤性蛛网膜下腔出血与遗传改变密切相关，主要证据为：1与年龄匹配对照组相比，蛛网膜下腔出血患者的一级亲属SAH发生率高出2-6倍；2IA或SAH患者的一级和二级亲属发生IA破裂的风险显著高于对照组（8.7%–13.9% 比 1%）。全基因组关联研究（Genome-Wide Association Study，GWAS）曾确定，与颅内动脉瘤易感性相关位点包括：4q31.23 （EDNRA）、5q31.3、6q24.2、8q12.1 （SOX17）、9p21.3（CDKN2A/CDKN2B/CDKN2BAS）、10q24.32（CNNM2）、12q22、13q13.1 （KL/STARD13）、18q11.2 （RBBP8）和20p12.1。然而，迄今为止未用发现的位点评估动脉瘤破裂的风险。美国印第安纳大学Tatiana Foroud等在2014年11月《Stroke》杂志上发表GWAS识别与颅内动脉瘤相关的新位点研究。
该项研究收集2617例白人颅内动脉瘤患者和2548例白人对照组进行GWAS分析，确定与颅内动脉瘤相关的新位点；继而在另外两个独立样本中进行验证，包括荷兰人样本，其中动脉瘤患者717例，对照组3004例和芬兰人样本，其中动脉瘤患者799例，对照组2317例。最后将三组样本进行荟萃分析确定感兴趣的关键位点。
通过2617例颅内动脉瘤患者和2548例对照组GWAS分析，作者发现9号染色体上的位点CDKN2BAS（rs10733376: P<1.0×10−11）与动脉瘤相关（图1），这个位点在既往的GWAS研究中已检出。
图1. GWAS分析发现9号染色体位点。
同时，作者在7号染色体HDAC9附近发现一个新位点（rs10230207；P=4.14×10−8）与动脉瘤相关（图2）。
在后续的验证过程中，rs10230207位点只在荷兰人样本中得到证实；在芬兰人样本中重复试验而失败。研究者认为可能是芬兰人的基因结构差异所致。
图2. GWAS分析发现7号染色体位点。
而且，7号染色体上的rs10230207位点在过去已发现与缺血性卒中和大血管闭塞性卒中亚型密切相关。荟萃分析表明，三组独立样本间存在明显的统计学差异（图3），上述卒中亚型与IA可能有一定的基因关联性。
（复旦大学附属华山医院Eric编译，江苏省常熟市第一人民医院刘创宏审校，《神外资讯》编辑部主编、复旦大学附属华山医院陈衔城教授终审）
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