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【新品】单细胞RNA-Seq测序服务重磅来袭

2014-03-12 华大科技BGITech

单细胞测序”被Science杂志评选为2013年最值得关注的领域!

 

研究背景

同一组织的细胞很少是同一类型的,即便是同一类型的细胞,各细胞间的基因表达及调控也通常存在一定的差异。但是迄今为止使用的测序材料无一例外都是数百万甚至更多细胞的混合样本,这种方法研究得到的结果只是一群细胞中信号的平均值,或者只代表其中占优势数量的细胞信息,单个细胞独有的特性被忽视,而在单细胞水平的基因表达及调控分析,则可以更全面、深刻地掌握组织的表达特征,对于分析器官发育及干细胞的诱导分化都具有非常重要的意义。

 

产品定义

单细胞RNA-Seq就是在单个细胞水平上对mRNA进行扩增与测序,并进行定量分析的一项新技术。

 

适用范围

单细胞RNA-Seq尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体,有助于深入理解细胞分化、细胞重编程及转分化等过程及相关的基因调节网络,此项技术开创了RNA研究的新纪元,逐渐成为研究新热点。

 

技术特点

样品被扩增百万倍,足以满足测序需求;

单管反应,能最大程度降低多次纯化造成的产物损耗;

实验技术重复性高,测序质量好,利于后续各类分析;

能探测到90%以上的基因表达;

比芯片检测到更多低丰度的转录本。

 

样本类型要求

单细胞样本:哺乳动物胚胎发育细胞(如鼠/猪/牛/羊/早期胚胎发育细胞);

Total RNA样本:每个样品总量不低于10 pg,浓度不低于10 pg/μL。

 

推荐数据量

推荐30M的clean reads,测序策略为50SE。

 

项目执行周期

单细胞RNA-Seq项目执行周期为35个工作日(50个细胞以上需额外增加工作日)。

 

技术路线


参考文献

单细胞RNA-Seq测序新技术

Pan X, Durrett RE, et. al., Two methodsfor full-length RNA sequencing for low quantities of cells and single cells. PNAS,110(2):594-599(2013).

 

使用单细胞RNA-Seq技术绘制人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组全景图

Yan L, Yang M, et.al., Single-cellRNA-Seq profiling of human preimplantation embryos and embryonic stem cells.Nature Structural & Molecular Biology . 20:1131-1139(2013).

 

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