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在这个看脸的时代,它一心一意做好“定量”

2017-02-21 赵青 华大科技BGITech

2016年,BGISEQ-500 RNA-Seq上市了, 

走遍全球国家和地区50+,中国城市70+,合作单位1000+,

上市以来签订样本数3万+,

公布了下机数据

数据质量Q20>97.8%,Q30>90.2%,

国际期刊上发表了文章

客户样品定量结果与qPCR一致性很高。



在这个看脸的时代,

它一心一意做好“定量”,

没有华丽的包装和喧闹的宣传,

即使新年新升级,

也以实实在在的数据说活。

(小广告:结尾有彩蛋!)



1核心竞争力——“准”


BGISEQ-500 RNA-Seq数据质量屡屡突破极限,定量结果超精准,凭的是严格的质控系统和层层把关。


严格的测序质控


BGISEQ-500 RNA-Seq不仅要求过滤后的数据质量,更要求“原始数据”就达到最严苛的标准;不仅监控每个样品的数据质量,也监控每条lane的数据质量。


下面是近期项目执行的101条lane,每条lane原始数据质量和产量分布情况。101条lane,在如此大数据统计情况下,每条lane的Q20均在96%以上,Q30均在88%以上。


又稳又准,是BGISEQ-500 RNA-Seq测序的双标!


原始数据的产量,reads数以M为单位(蓝色)。原始数据的质量,Q20%,每条lane的Q20均在96%以上(红色);Q30%,每条lane的Q30均在88%以上(绿色);GC含量%(紫色)。

 

独具特色的建库质控


随机加入Control样品掺入外源质控ERCC,把控建库每一步操作。ERCC RNA Spike-In Control Mixes随样本一起建库,通过分析ERCC浓度和RNA-Seq得到的表达量之间的相关性,评估mRNA定量结果(详见参考文献)。我们测试Control样本加入ERCC后下机数据情况。结果显示,在不同物种中Pearson系数都达到0.9以上,定量精准!


把控每一步操作,是BGISEQ-500 RNA-Seq建库的特色。






2起始量再刷新“低”


样品起始量:人鼠样本≥200ng,其他物种样本≥1ug。

起始量降低了,但我们保证同样的超高数据质量。




3唯“快”不破


天下武功,唯快不破,科研亦然!BGISEQ-500 RNA-Seq再次刷新执行速度,助您发文快人一步,抢占先机!

我们承诺:

从样本到数据,10天

从数据到分析结果,5天


这意味着,实验周期整整加快1倍,分析速度加快50%。专业的实验和分析团队日夜奋战,确保每个样品以最快的速度完成项目。




4好“价”给你

真核样本,促销价999元/个15个工作日。

不限样本数,1个样本起即可

建库+测序(数据量20M clean reads) +赠送标准分析。

原核样本也可参加活动,促销价1599元/个,25个工作日。


*若样本量较大请咨询科技代表执行周期。



联系我们

电话:400-706-6615

邮箱:info@bgitechsolutions.com

网站:www.bgitechsolutions.com

地址:深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋,518083



参考文献:

1. Risso D, Ngai J, Speed TP, et al. Normalization of RNA-seq data using factor analysis of control genes or samples. Nat Biotechnol. 2014, 2(9):896-902. doi: 10.1038/nbt.2931.

2. Munro SA, Lund SP, Pine PS, et al. Assessing technical performance in differential gene expression experiments with external spike-in RNA control ratio mixtures. Nat Commun. 2014, 5125. doi: 10.1038/ncomms6125.

3. SEQC/MAQC-III Consortium. A comprehensive assessment of RNA-seq accuracy, reproducibility and information content by the Sequencing Quality Control Consortium. Nat Biotechnol. 2014, 32(9):903-14. doi: 10.1038/nbt.2957. 

4. Li S, Tighe SW, Nicolet CM, et al. Multi-platform assessment of transcriptome profiling using RNA-seq in the ABRF next-generation sequencing study. Nat Biotechnol. 2014, 32(9):915-25. doi: 10.1038/nbt.2972. 

5. Xu J, Gong B, Wu L, et al. Comprehensive Assessments of RNA-seq by the SEQC Consortium: FDA-Led Efforts Advance Precision Medicine. Pharmaceutics. 2016, 8(1): 8. 

6. Tong L, Yang C, Wu PY, Wang MD, et al. Evaluating the impact of sequencing error correction for RNA-seq data with ERCC RNA spike-in controls. IEEE EMBS Int Conf Biomed Health Inform. 2016, 74-77.



撰稿:赵    青

编辑:市场部


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