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湖南20例新冠病毒标本测序均为德尔塔毒株,与南京高度同源!张家界新增本土3+1

杭州网 2021-10-09

记者今日获悉,自7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来,湖南省疾控中心已完成20例德尔塔新冠病毒基因组测序。已经完成测序结果的标本均为德尔塔毒株,与南京高度同源。


5天时间已完成20例标本测序


据省疾控中心检验科科长湛志飞介绍,基因组测序可在第一时间获取新发未知病毒的基因组序列信息,已成为研究疾病暴发的重要工具。通过构建进化树,研究不同患者病毒遗传序列变化,能在分子生物学层面揭示病毒的传播方式,分析新冠病毒的进化来源,研究新冠病毒的致病病理机制,为控制疫情暴发提供科学依据。


通过检测新冠病毒的全基因组序列,再将这个序列通过算法与数据库中的数据进行比对,可以初步判断其地域来源。将序列与既往病例序列进行比对,如果序列在同一进化树分支上,则可以判断这些病例是否来自同一传播链或传染源。


面对此次疫情,从7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来,湖南省疾控已完成20例标本测序。


24小时完成病毒基因测序溯源


“新冠病毒样本送到实验室后,一般需要经过多个步骤完成检测。”湛志飞称,在接到阳性样本后,工作人员首先进行复核工作,对样本进行核酸提取,再用两种试剂进行核酸检测。复核阳性的标本,分别用二代和三代高通量测序技术进行序列测定,为病毒溯源工作设置“双保险”,确保万无一失。


病毒基因序列测定完成后,工作人员还要马上进行生物信息学分析,将病毒序列与数据库中的序列进行比对,查看有无变异位点,进行同源性比较。完成数据比对后,还要及时撰写溯源报告。


“目前,湖南省疾控中心已具备新冠病毒基因组高通量二代和三代测序能力,为湖南省新型冠状病毒疫情以及其他传染病病原体的鉴定和溯源、防控应对提供了强大的技术支撑。”湛志飞介绍,去年10月份才掌握这项技术,以前都是送到国家疾控中心检测。目前湖南省疾控中心培养了3名技术骨干,所有的新冠病毒基因组测序都能在24小时内完成,情况复杂的也不会超过48小时。根据疫情的变化,只要有标本来,都会在24小时内启动测序流程。


测序结果与南京高度同源


7月28日,接到2021年第一例本土新冠肺炎病例标本测序工作以来,省疾控中心立即组织专业技术人员,日夜不停地开展测序工作,通过文库制备、簇生成、上机测序与数据比对分析,已经完成测序结果的标本均为德尔塔毒株。从国家疾控中心反馈的结果显示,和江苏省报送的南京疫情本土病例新冠病毒基因组序列高度同源。


根据最新疫情通报,2021年7月20日0时至8月1日24时,湖南省累计报告新型冠状病毒肺炎确诊病例22例。此次疫情病原体为德尔塔变异株,范围广、来势猛,广大民众一定不能掉以轻心,严格执行好持码进出、测量体温、佩戴口罩、保持距离等措施,有效降低病毒传播风险,减少不必要的人员聚集。


湖南省教育厅紧急通知:

暂停校内外线下教育教学活动

8月2日上午,湖南省教育厅下发紧急通知,要求暂停校内校外线下教育教学活动。


通知要求,暂停各级各类学校校内校外线下教育教学活动;暂停各级各类教育培训机构线下培训活动。


同时,通知要求各级各类学校师生员工要严格遵守属地疫情防控相关规定,近期非必要不出行。各级教育行政部门、各高校要坚持一把手负总责,加强疫情防控常态化措施落实情况督查,加强疫情防控紧急措施落实情况督查。违反上述规定的,一经发现,严肃查处。


张家界市新增3例本土确诊病例、

1例无症状感染者

2021年8月1日0-24时,湖南省张家界市报告新增本土新型冠状病毒肺炎确诊病例3例、新型冠状病毒肺炎无症状感染者1例。自7月29日以来,湖南省张家界市累计报告新型冠状病毒肺炎确诊病例10例(其中永定区10例),无症状感染者2例(其中永定区2例)。

新增确诊病例、无症状感染者具体情况如下:

确诊病例1:胡某某,男,39岁,永定区人,职业为送货司机。7月29日全员检测采样点采样,7月30日,经张家界市人民医院核酸检测呈阳性,7月31日,经张家界市疾控中心复核阳性,8月1日,市级专家会诊为确诊病例(轻型)。

确诊病例2:王某某,男,31岁,永定区人,职业为导游。7月29日核酸检测阳性,7月31日,经张家界市疾控中心复核阳性,8月1日,市级专家会诊为确诊病例(轻型)。

确诊病例3:胡某某,女,43岁,永定区人,系梅尼超市员工。7月29日,核酸检测呈阳性,7月31日,经张家界市疾控中心核酸检测复核阳性,8月1日,市级专家会诊为确诊病例(普通型)。

无症状感染者:田某,男,7岁,永定区人,系确诊病例曾某之子。7月31日,核酸检测阳性,当日经张家界市人民医院复检结果阳性,经张家界市疾控中心复核阳性,8月1日,市级专家会诊为无症状感染者。

新增3例确诊病例、1例无症状感染者活动轨迹通告如下:

一,胡某某的活动轨迹

胡某华,家住永定区熙城春天小区。

7月17日:7:30离开熙城春天,7:35到达教场路岩塔巷附近,11:29到达熙城春天,11: 35到达尹家溪镇,16:45到达月亮湾三期附近,17:09到达教场路岩塔巷附近,17:52到达熙城春天并停留。

7月18日:7:25离开熙城春天,7:36到达教场路岩塔巷附近,8:00到达月亮湾三期附近,10:53到达教场路岩塔巷附近,11:43 前往西溪坪,17:10到达教场路岩塔巷附近,18:01到达熙城春天并停留。

7月19日:7:30离开熙城春天,7:48到达教场路岩塔巷附近,8:42到达月亮湾三期附近,12:11到达永定区后坪镇附近,12:27到达熙城春天,14:26到达教场路岩塔巷附近,16:30到达子午路公园附近,17:49到达熙城春天并停留。
7月20日:11:16离开熙城春天,11:27到达教场路岩塔巷附近,12:21到达熙城春天并停留。
7月21日:7:21离开熙城春天,到达教场路岩塔巷附近,10:12到达后坪镇附近,11:43到达尹家溪镇附近,15:26到达月亮湾三期附近,17:10到达教场路岩塔巷附近,17:57到达熙城春天并停留。
7月22日:7:25离开熙城春天,7:39到达教场路岩塔巷附近,10:39到达南庄坪街道办事处荷花附近,11:01到达熙城春天,12:34到达西溪坪,17:00到达紫舞公园附近,17:57 到达熙城春天并停留。
7月23日:7:26离开熙城春天,7:39达到岩塔巷附近,8:22到达月亮湾三期附近,11:30到达熙城春天,12:01到达西溪坪,13:25到达月亮湾三期附近,15:52到达熙城春天,16:30到达火车站附近,17:12 到达岩塔巷附近留,23:28到达熙城春天并停留。
7月24日:7:25离开熙城春天,7:35到达岩塔巷附近,8:21到达月亮湾三期附近,12:01到达西溪坪,14:17到达月亮湾三期附近,17:51到达熙城春天并停留。
7月25日:7:25离开熙城春天,7:30到达教场路岩塔巷附近,8:00到达月亮湾三期附近,11:45到达熙城春天,12:00到达西溪坪,13:00到达月亮岛社区,16:35到达教场路岩塔巷附近,17:47到达月亮湾三期附近,21:40到达熙城春天并停留。
7月26日:7:22离开熙城春天,7:36到达教场路岩塔巷,8:10到达月亮湾三期附近,8:22到达尹家溪,9:22到达教字垭,10:16到达尹家溪并于11:30离开,11:48到达月亮岛社区,12:21先后到达大庸桥、永定、西溪坪、官黎坪等办事处并于18:22到达月亮岛社区,21:40到达熙城春天并停留。
7月27日:7:21离开熙城春天,7:35到达岩塔巷附近,8:20到达区月亮湾三期附近,12:56到达熙城春天,13:45到达月亮湾三期附近,15:05  到达嘉信花园附近,15:31到达张家界西站附近,20:00到达后坪镇,21:42到达熙城春天并停留。

7月28日:7:28离开熙城春天,7:41到达岩塔巷附近,8:27到达月亮湾三期附近,11:32先后到达后坪镇、官黎坪、西溪坪、月亮岛社区,18:45到达熙城春天并停留。

7月29日:7:28离开熙城春天,7:33先后到达市劳动就业中心、月亮湾、天门山索道公司、鲤鱼池、西溪坪,21:39到达熙城春天并停留。

7月30日:7:16离开熙城春天,7:27先后达市劳动就业中心、黄金大厦、时代广场、岩塔、月亮湾、官黎坪、西溪坪、大成山水酒店、广茂园、阳光酒店、天门中学,19:45到达熙城春天并停留。

7月31日:凌晨被接送到张家界国际大酒店集中隔离观察。后由120救护车接送到市人民医院东区(西溪坪)感染科接受隔离治疗。


二,王某某的活动轨迹

王某成,家住永定区龙庭鸬鹚湾二期。

7月17日:6:34离开龙庭鸬鹚湾二期,7:08到达蓝色港湾小区附近,7:50到达天门山索道公司,8:17-11:30到达天门山,11:50到达索道公司停车场附近并于12:51离开张家界。

7月18日:未在张家界市境内停留。

7月19日:10:17从常德方向进入慈利县,11:55到达慈利县大峡谷景区,13:32到达武陵源区黄龙洞,13:46到达武陵源区道观,14:39从标志门进入景区(水绕四门-百龙天梯-袁家界-百龙天梯-十里画廊),19:22到达汽车站附近,20:11到达武陵源区京武铂尔曼附近并停留。

7月20日:8:20到达宝峰湖,11:00到达永定区沙堤街道办事处,11:16到达市城区土司城,12:48到达蓝色港湾附近,14:02到达龙庭鸬鹚湾二期,19:19到达凤湾路口丽人医院附近,22:17到达龙庭鸬鹚湾二期并停留。

7月21日:全天龙庭鸬鹚湾二期停留。

7月22日:19:00离开龙庭鸬鹚湾二期,19:20到达月亮湾小区附近,20:50到达龙庭鸬鹚湾二期并停留。

7月23日:全天在龙庭鸬鹚湾二期停留。

7月24日:10:08离开龙庭鸬鹚湾二期,10:34到达高盛澧园三期附近,11:58到达龙庭鸬鹚湾二期,20:30到达新峰市场附近,21:03到达龙庭鸬鹚湾二期并停留。

7月25日:19:24离开龙庭鸬鹚湾二期,19:44到达大庸桥公园附近,20:11到达龙庭鸬鹚湾二期并停留。

7月26日:18:54离开龙庭鸬鹚湾二期,19:09到达高盛澧园三期附近,19:23到达北正街附近,19:32到达龙庭鸬鹚湾二期附近。

7月27日:6:50离开龙庭鸬鹚湾二期,7:10到达阳光酒店,7:40离开阳光酒店前往武陵源区,8:40从标志门进入景区(百龙天梯-袁家界-天子山),18:30到达武陵源区京武铂尔曼酒店附近并停留。

7月28日:9:00离开京武铂尔曼酒店,9:30到达慈利县大峡谷,11:40到达武陵源区江汉山庄附近并停留,18:00到达永定区碧桂园并停留。

7月29日:7:35离开碧桂园,8:00-13:20到达天门山索道下站进入天门山景区,14:00到达凤湾路口,16:00到达城墙路附近并停留。

7月30日:全天在城墙路附近并停留。

7月31日:7:40离开永定城墙路附近,前往市人民医院,10:00作为密切接触者被送至集中隔离点进行隔离。后由120救护车接送到市人民医院东区(西溪坪)感染科接受隔离治疗。


三,胡某某的活动轨迹

胡某玉,家住永定区官黎坪办事处黄金塔居委会。

7月16日:7:37离开黄金塔居委会,7:54到达梅尼购物中心、影视城附近并于16:53 离开,17:01到达逸臣桃园、美人山附近并于19:57离开,20:46到达黄金塔居委会并停留。

7月17日:14:00离开黄金塔居委会,14:19到达梅尼购物中心、影视城附近并于21:28离开,22:00到达黄金塔居委会并停留。

7月18日:7:37离开黄金塔居委会附近,7:53到达梅尼购物中心、影视城附近并于16:05离开,16:38到达黄金塔居委会并停留。

7月19日:14:02离开黄金塔居委会附近,14:22到达梅尼购物中心、影视城附近并于21:07离开,21:30到达黄金塔居委会并停留。

7月20日:7:38离开黄金塔居委会附近,7:52到达梅尼购物中心、影视城附近并于16:41离开,17:39到达黄金塔居委会并停留。

7月21日:7:32离开黄金塔居委会,7:52到达梅尼购物中心、影视城附近并于16:57离开,17:18到达黄金塔居委会并停留。

7月22日:7:40离开黄金塔居委会,7:55到达梅尼购物中心、影视城并于16:58离开,17:51到达黄金塔居委会并停留。

7月23日:7:30离开黄金塔居委会,9:50到达茂隆市场附近,10:49到达中商广场附近并停留,20:03到达黄金塔居委会并停留。

7月24日:7:34离开黄金塔居委会,7:50到达梅尼购物中心、影视城附近并于15:30离开,15:58到达黄金塔居委会并停留。

7月25日:14:01离开黄金塔居委会,14:25到达梅尼购物中心、影视城附近并于21:30离开,21:50到达黄金塔居委会并停留。

7月26日:7:30离开黄金塔居委会,7:47到达梅尼购物中心、影视城附近并于8:12离开,8:45到达黄金塔居委会并于9:12离开,9:23到达火车站附近并于9:38离开,10:00到达黄金塔居委会并于14:00离开,14:16到达梅尼购物中心、影视城附近并于21:06离开,22:55到达黄金塔居委会并停留。

7月27日:7:31离开黄金塔居委会,7:53到达梅尼购物中心、影视城附近并于14:56离开,15:18到达黄金塔居委会并停留。

7月28日:7:33离开黄金塔居委会,7:52到达梅尼购物中心、影视城附近并于15:12离开,15:31到达黄金塔居委会并停留。

7月29日:14:01离开黄金塔居委会,14:20到达梅尼购物中心、影视城附近并于21:03离开,并于21:23到达黄金塔居委会并停留。

7月30日:7:36离开黄金塔居委会附近,7:54到达梅尼购物中心、影视城附近并于14:59离开,15:19到达黄金塔居委会并停留。

7月31日:17:56离开黄金塔居委会,18:40到达张家界国际大酒店集中隔离观察。后由120救护车接送到市人民医院东区(西溪坪)感染科接受隔离治疗。


四,田某的活动轨迹

田某,家住永定区南庄坪街道办事处机场居委会。

7月15日:12:00母亲曾某带其乘坐私家车到达紫气东来餐厅就餐并入住酒店。

7月16日:8:00母亲曾某退房后带其离开张家界,22:40母亲曾某带其乘坐长沙坐城际高铁到达张家界,出站后坐网约车回家。

7月17日-21日:田某在家未外出。

7月22日,9:40曾某带其从家中出发前往天子巷其奶奶黄某家,11:00-13:00曾某带其到达逸城广场某旅行社停留后回家。

7月23日-26日:田某在家未外出。

7月27日:8:30曾某带其乘坐私家车前往金领国际附近梅尼超市购物,9:10步行前往博爱幼儿园附近某私房并停留,9:43乘坐私家车前往凤湾路口田家小厨就餐,11:40乘坐摩托车前往天子巷其奶奶家,11:49到达天子巷某理发店,12:54步行前往农夫烤薯店购物,13:06返回天子巷,就餐后于19:46乘坐网约车回家。

7月28日:田某在家,期间外出在家附近银行旁餐馆购买东西,并在机场诊所就诊、打针。

7月29日:15:00父亲带其到万泰酒店停车场进行核酸检测。

7月30日:田某作为密切接触者被送至集中隔离点进行隔离。后由120救护车接送到市人民医院东区(西溪坪)感染科接受隔离治疗。



来源:新湖南客户端、央视新闻客户端、掌上张家界
编辑:孙莉莉


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