考古发掘的尸骨主要有以下4种结果：
1.大部分被博物馆保存和研究
在我国古代，因为葬制和保存技术等原因，大多数千年以上的古墓，墓主人的尸骨已经完全腐烂，或者只残存少量骨骼碎片。这类保存情况不好的尸骨，同样具有考古研究价值。它们会被送到医学鉴定和科研机构，分析墓主人的性别、年龄和去世原因。这些信息对古墓的年代判定，以及对随葬品文物的研究，具有重要的佐证作用。在研究后，墓主人的尸骨会被博物馆和医学机构妥善保存。
2.少部分被原址回埋或火化
在古墓中，王侯贵族的大墓还是少数，大多数都是平民墓葬，几乎没有什么国宝文物，考古和历史研究价值也不高。这类古墓被考古发掘后，会将考古发掘过程、墓葬形制和位置等数据信息记录存档。如果墓中还保存有墓主人的尸骨，一般选择原址回埋。如果已经不具有回埋条件的，会采取火化的处置方式。
3.珍贵的进行展览和科研
这类就是我们在博物馆里亲眼见到的古代尸骨。像长沙马王堆汉墓的辛追夫人，新疆的小河遗址的楼兰美女这种保存完好的古代尸骨，可谓凤毛麟角，也都是国宝文物。因其珍贵的科研价值，在考古发掘出土时，以及存放博物馆展览期间，国家都需要投入高昂的财力、人力和物力进行保护。
另外，某些重要的古尸，还会被送到古人类研究所等学术机构，由专家进行研究。在现代的科技水平下，从对古尸遗骨能够提取遗传物质，获取古代人的DNA模型，有助于解开许多历史之谜。我国科学家曾经成功提取战国时期齐国古墓中尸骨的DNA模型，对于研究2000年前山东临淄地区的人种、饮食和习俗起到了重要作用。
4.某些特例被损毁和丢失
当然，在某些特殊年代和情况下，也有一些古墓的尸骨被损毁和丢失了。比如由郭沫若主持发掘的明朝皇陵，万历皇帝就遭遇了最悲惨的结果。因为当时考古发掘不够科学，万历皇帝和其皇后的棺椁，在没有保护措施的情况下被开启。后期也没有及时移入博物馆，长时间暴露在空气中，万历皇帝的尸骨迅速腐烂。到20世纪70年代，万历皇帝的尸骨居然被小将们焚毁了。
隋炀帝杨广：仅剩两颗牙齿，巡展ing
位列2013年度十大考古新发现之一的扬州曹庄隋炀帝墓，墓内两颗牙齿鉴定为50岁左右的男性个体，结合文献记载，隋炀帝杨广生于公元569年，卒于公元618年，年龄和“牙齿年龄”吻合，确认一号墓主人是隋炀帝杨广。二号墓内保存有部分人骨遗骸，经南京大学体质人类学专家鉴定为大于56岁、身高约1.5米的女性遗骸。二号墓虽无文字信息，但根据墓葬形制、墓内出土高等级随葬品和对人骨遗骸的鉴定，结合文献记载，判明墓主人正是萧后。
据考证，隋炀帝被勒死后，萧后拆了床板当棺材，把丈夫偷偷埋在流珠堂。他死后5个月，老部下陈稜又迁葬了一次，葬在了吴公台。到了唐代，因为唐高宗李渊和杨广是姨表兄弟关系，把墓又迁到了雷塘。牙齿是人身上最坚硬、最不容易腐蚀的部位，所以能够保存。
南宋理宗赵昀：头颅作酒器
元时陵寝被妖僧杨琏真迦盗掘，头骨做成了酒器(法器)。理宗的尸体被倒悬沥取注入腹中的水银。绍兴人唐珏，三十二岁，变卖家产，备办酒席，邀约乡里提议收埋先帝遗骨，用拾取荒郊兽骨放置莹地，以假乱真。理宗赵昀的颅骨特大，未敢更易。唐珏收取帝、后骨骸后七天，杨琏真珈命人将理宗颅骨镶银涂漆，以其头盖骨奉给帝师八思巴为饮器，是为骷髅碗。将布散于坟地的骨殖收集于临安故宫中，上筑高十三丈的白塔压之，名曰镇本，以厌胜之术，镇压南宋王气，同时打击江南士人的反抗意志。
明初，明太祖得知此事，“叹息久之”，派人找回理宗的头颅，洪武二年（1369年）以帝王礼葬于应天府（江苏南京），次年又将理宗的头骨归葬到绍兴永穆陵旧址。
明万历帝：焚烧殆尽
1956年定陵发掘后，在梓宫第11层清理到万历的遗骸。整个身体都已经完全腐烂，仅剩下骨架，最让现场所有人都大感诧异的是，尸骨并不是大家想象中仰卧的姿势，而是面向上，头顶微向右偏，右臂向上弯曲，手放在头右侧，左臂下垂，略向内弯，手放在腹部。手中持念珠一串。右腿稍弯曲，左腿直伸，两脚向外撇开。呈现出“北斗七星”帝王葬式。
1966年文革，保存于仓库的万历帝及两位皇后的尸骨被文革小将抬到定陵博物馆前的广场上示众、批斗，而后当做“地主阶级的总头目”砸烂、烧掉，化为青烟归于历史。
乾隆帝：
裕陵被盗后，尸骨混入墓室泥浆中，《东陵盗案汇编》中记载：“捡得肋骨一条，脚骨二块，膝骨一块。”“在砖中拾得脊骨一，色皆黑”。“手指及足趾骨则无从寻觅”。袝葬的后妃尸骨“均已十不存五六”。1928年东陵盗案发生后40天，溥仪派遗老遗少，还有宗室，官员、厨役、民国卫兵等一行七十余人重敛尸骨，发现墓中6具尸骨只剩4个头骨，尸骸全碎。而一具压在石门下的棺椁里，重敛者找出一具头骨，因为骨骼较大，判断是乾隆头骨，而下颌骨已被砸碎。《宝熙日记》中这样记载：“两眼只有深眶，执灯近前观看，好似有白光从眼眶里射出。”
清理后和孝贤后、慧贤哲悯淑嘉三位皇贵妃合计5人残骨收殓于一棺内。孝仪后尸体未腐，应该是单独殓于一棺了。
慈禧：
普陀峪定东陵被盗后尸体被弃于棺外，后来溥仪命清廷遗老重殓了。再后来东陵管理处重新整理过，还拍了视频。著名清陵研究专家徐广源先生就是亲手整理人。