模式微生物基因组可以免费测序了
自从2018年1月起，在《国际系统与进化微生物学杂志》(IJSEM）杂志上发表微生物的新种，都需要提供基因组测序数据了。
依托于中国科学院微生物研究所的世界微生物数据中心（WFCC-MIRCEN World Data Centre for Microorganisms, WDCM）在2017年底启动了全球微生物模式菌株基因组测序计划（GCM2.0），目前已经有16个国家的25家微生物资源保藏中心的正式加入。2019年3月5日，WDCM与《国际系统与进化微生物学杂志》(IJSEM）正式签订了合作协议，为广大分类学家提供了一个针对新物种基因组的免费测序分析平台。我们能够提供包括DNA提取、基因组测序、数据分析、数据投递到国家微生物科学数据中心平台(www.nmdc.cn)的一站式服务，数据可以直接用于在IJSEM杂志上发表新种文章。
WDCM与IJSEM杂志正式合作
数据在IJSEM杂志发表
01
请将需要测序的潜在新物种菌株邮寄至中国普通微生物菌种保藏中心CGMCC http://www.cgmcc.net/ 保藏。
02
详细阅读新种测序服务的说明http://gctype.wdcm.org/sequencingnovel.jsp。
03
请在WDCM GCM 系统(http://gctype.wdcm.org/register.jsp）中注册、登录，并在系统中填写菌株的基本信息（包括原始编号、种属名、分离源、分离时间、样品采集地点、采集国家及保藏人姓名、单位等信息。请在“菌株接收编号“一栏填写：CGMCC），随后请等待审核确认回复邮件。WDCM相关事务联系人: 何晴，电话：15726637270, 电子邮箱：heq@im.ac.cn
04
WDCM将在收到您的样本后三个月内将符合IJSEM发表要求的测序结果发送至注册账户邮箱（包括原始序列文件，组装，G+C含量，OGRI, N50和IJSEM要求的其他注释结果，以及GCM发布的基因组序列登记号）。
05
将GCM基因组序列号写在您提交的文章中，当文章投稿后，请通知WDCM团队，WDCM按照您的要求在国家微生物科学数据中心网站上www.nmdc.cn发布原始数据和注释数据以供审稿人审阅。
06
如果相关论文未在IJSEM等刊物上发表（包括未向期刊投稿，作者撤回或被编辑拒稿），WDCM会在测序后的第18个月将测序数据在NCBI/EMBL/DDBJ/GCM数据库中发布。
07
WDCM的模式菌株数据库gcType （http://gctype.wdcm.org/）还为大家提供了一站式的模式菌株基因组数据检索、分析、下载和新种鉴定服务。
模式菌基因组数据库
在线新种鉴定分析流程