安诺Hi-C新突破,开启分析新篇章系列三
Hi-C作为一个高大上的基因组学技术,其测序价格也十分之高冷。安诺基因作为三维基因组学测序技术的引领者,一直不断改进Hi-C测序技术,完善Hi-C分析内容,致力于为广大科研工作者提供最优质、性价比最高的Hi-C测序服务。小编也一直留心安诺Hi-C的各种动态,时常为小伙伴们带来安诺Hi-C的最新消息:安诺Hi-C新突破,开启分析新篇章系列一、安诺Hi-C新突破,开启分析新篇章系列二。这不,小编又为大家带来了该系列的第三篇文章,展示安诺Hi-C的最新进展~
测序数据量大幅度减少
依据目前所有的Hi-C高水平论文和安诺基因自身的项目经验,依据分辨率和基因组大小等参数,我们推导出一个科学的测序数据量计算公式(正在申请专利),并通过提高单个文库的数据量产出,大大减少了Hi-C所需测序数据量和文库数量,从而大幅降低了Hi-C测序的成本,使得Hi-C技术可以为更多的科研工作者服务。此进展对于Hi-C测序具有指导性意义,下面列举几个物种的对比数据,大家感受一下~
表1 Hi-C测序数据量比较
Hi-C技术的一大难点在于高水平文库的构建,提高数据利用率。安诺基因作为Hi-C项目经验200+,文库500+的业内老司机,设置了最严格的文库质控标准,步骤最繁琐的数据质控流程,为您的Hi-C文库和数据质控保驾护航。
表2 安诺基因Hi-C测序文库质控标准
表3 安诺基因Hi-C数据过滤质控步骤
由此才有了以下的优质数据(见表4),某些物种的valid paired-end reads比例已超过CNS文章水平。(PS:如果有人告诉你,他们Hi-C建库保证成功,恭喜你,你遇到了一个骗子~)
表4 安诺Hi-C建库经验数据
我们在对Hi-C测序流程实行严格质控的基础上,对分析内容进行了大升级,完善了与GWAS、RNA-seq及ChIP-seq等多组学数据关联的个性化分析内容,从基因表达调控、表观遗传调控等不同维度来阐释生物学事件的相关机制。
图1 Hi-C多组学关联分析路线图
安诺率先引入NovaSeq测序平台,具有更高的通量(6TB/run),周期更短(~2d/run),价格更低(50元/Gb),以最低的成本助力Hi-C研究!
NovaSeq预售活动
预售价格:50元/Gb
预售时间:即日起至2017年9月25日止
总数据量要求:>1 Tb且单次送样数据量>500 Gb
使用时间:2017年第四季度(推出S4试剂之后)
本活动最终解释权归安诺优达基因科技(北京)有限公司所有
Hi-C是安诺优达特色技术,不断探索不断创新
可揭示染色体三维结构,且可用于辅助组装
从群体细胞Hi-C、1kb Hi-C、捕获Hi-C
单细胞Hi-C拓展到Hi-C辅助组装
物种经验跨越动植物及微生物
合作单位贯穿国内外科研院所
安诺高端Hi-C诚邀您加入
文案:Hi-C产品经理 郑茹
设计:胡珊珊