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免疫治疗热点齐聚,事情搞起来~

2018-03-21 安诺基因 安诺基因

现代人都“谈癌色变”。目前常用的癌症治疗方法包括手术、放疗、化疗和靶向治疗等都存在一定缺陷,多数患者仍然挣扎于病痛之中。



近年来癌症治疗新增利器—免疫治疗,一举解决多项治疗难题。2018年初,业内十余位精准医学专家联合撰写了《Precision medicine and cancer immunology in China[1]》(Science增刊),足见免疫治疗已崭露锋芒,开启了肿瘤研究的新时代。


肿瘤免疫治疗即利用患者自身免疫系统的抵抗力来消除肿瘤细胞以抵御癌症,利用基因测序技术能够圈定癌症的致病突变。那为什么说肿瘤的免疫治疗与基因检测是癌症研究的左膀右臂呢?且听小编为您详细解读~

 

肿瘤突变负荷TMB

通过基因检测来判断外显子区每百万碱基上的体细胞突变,包括碱基替换、插入或缺失等。临床研究表明,TMB(Tumor Mutation Burden)越高,越适合进行免疫治疗;反之TMB越低,越不适合做免疫治疗。2017年12月,新英格兰杂志发表文章研究了27种不同类型的肿瘤中抗PD-1或抗PDL1治疗的肿瘤突变负荷,与客观反应率之间存在正相关性[2]

                           

图1 不同类型肿瘤中抗PD-1或抗PDL1治疗的肿瘤突变负荷与客观反应率之间的相关性[2]

 

肿瘤新生抗原负荷TNB

非同义突变通常会导致氨基酸编码序列发生变化,导致肿瘤细胞表达蛋白发生异常;而引起T细胞活化的异常蛋白,称为“新生抗原”。基因组和转录组层面检测能够较为全面地鉴定新生抗原,准确地定量TNB(Tumor Neoantigen Burden),并应用于临床[3]。TNB越高,越适合进行免疫治疗;反之TMB越低,则不适合做免疫治疗;新生抗原序列可作为肿瘤疫苗、细胞免疫治疗的抗原依据。



图2 新生抗原特异性T细胞疗法[3]

错配修复缺陷/微卫星不稳定性 dMMR/MSI

MMR基因是DNA错配修复基因,其表达缺失可引起DNA复制过程中发生错配,并累积导致微卫星不稳定性(MicroSatellite Instability, MSI)的发生;具有错配修复缺陷(MisMatch Repair deficient, dMMR)或微卫星高不稳定性(MSI-H)的肿瘤患者,其癌症基因组含有相对较高的体细胞突变,适合进行免疫治疗[4]

 

肿瘤免疫治疗作为目前热门的肿瘤治疗手段之一,在黑色素瘤、非小细胞肺癌等多种癌症治疗中取得喜人效果。但肿瘤免疫治疗也存在瓶颈,例如具有抗原呈递机器缺陷(Antigen Presentation Machinery, APM),采取免疫治疗存在更高的耐药风险[5];具有EGFR/MDM2/MDM4变异,进行免疫治疗会存在加速肿瘤生长速度的风险[6],足见癌症免疫治疗还有很大的研究空间。

安诺新动态

说到免疫治疗的科研应用,安诺基因第二季度将会隆重推出肿瘤免疫治疗分析模块,结合安诺已有业内领先的自动化建库技术、云平台快速分析、中国正常人基因组数据库、多组学技术解决方案,相信在癌症免疫治疗的新时代,必助科研工作者们一臂之力!

参考文献

[1] Precision medicine and cancer immunology in China. Science. 2018,359(6375), pp.598.

[2] Yarchoan M, Hopkins A, Jaffee EM. Tumor Mutational Burden and Response Rate to PD-1 Inhibition[J]. N Engl J Med. 2017,377(25):2500-2501.

[3] Gubin MM, Artyomov MN, et al. Tumor neoantigens: building a framework for personalized cancer immunotherapy[J]. J Clin Invest.2015,125(9):3413-21.

[4] Grasso CS, Giannakis M, et al. Genetic mechanisms of immune evasion in colorectal cancer[J].Cancer Discov. 2018,pii: CD-17-1327.

[5] Leone P, Shin EC, et al. MHC Class i Antigen Processing and Presenting Machinery:Organization, Function, and Defects in Tumor Cells[J]. J Natl Cancer Inst. 2013,105(16):1172-87.

[6] Kato S, Goodman A, et al. Hyper-progressors after Immunotherapy: Analysis of Genomic Alterations Associated with Accelerated Growth Rate[J]. Clin Cancer Res. 2017,23(15):4242-4250.


文案:人基因组产品经理 宫晓琳

设计:胡珊珊



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