致病菌如何从肠道到达子宫？血液~ | 热心肠日报

今天是第494期日报。

Microbiome：致病菌可通过血液从肠道传播到奶牛子宫

Microbiome[IF:8.496]

① 产后奶牛易得子宫炎，为此研究产后奶牛的血液、粪便、子宫、阴道菌群；② 主坐标分析发现血液菌群及粪便菌群表现为2个不同的集群，阴道菌群及子宫菌群更加分散，聚类分析发现子宫菌群与粪便菌群更加相似；③ 在血液、粪便、阴道、子宫菌群中存在相同的核心菌属；④ 主要子宫致病菌拟杆菌属、卟啉单胞菌属、梭杆菌属是血液、粪便及阴道菌群中的一部分；⑤ 子宫致病菌与血液而非粪便/阴道菌群有着显著的相关性，且总细菌属也相关。

Blood as a route of transmission of uterine pathogens from the gut to the uterus in cows

2017-08-25  DOI: 10.1186/s40168-017-0328-9

TM：拟杆菌如何利用多糖？(综述)

Trends in Microbiology[IF:11.020]

① 拟杆菌属分解宿主膳食、小肠粘膜层和其他细菌表面的复合多糖；② 多种跨膜调控蛋白控制多糖利用基因的转录，拟杆菌属贡献20%基因组进行多种多糖的转运和分解，并调控其加工过程，这些基因成簇分布在基因组上的特定区域，成为多糖利用位点（PUL）；③ PUL调控因子包括胞外功能σ因子（ECF-σ）/抗-σ因子、SusR-型、双组分杂交系统（HTCS）；④ 多层次多种调控促进优先利用多糖；⑤ 多糖分解的整体调控因子是拟杆菌在哺乳动物肠道内生存所必须。

Navigating the Gut Buffet: Control of Polysaccharide Utilization in Bacteroides spp.

2017-07-18  DOI: 10.1016/j.tim.2017.06.009

TFST：体外筛选的益生菌，到了体内可能没大用（综述）

Trends in Food Science & Technology[IF:5.191]

① 在乳杆菌和双歧杆菌作为益生菌的开发过程中，采用的方法包括低pH及胆汁酸暴露、对致病菌的竞争性排除、对细胞系的粘附、原核-真核共培养等；② 体外筛选方法与体内结果之间的关系仍不清楚，为此对两者的相关性研究进行综述，为益生菌的筛选提供指导；③ 体外预测的结果与人体临床试验的结果之间相关性十分有限，可能是由于不同个体之间的肠道菌群组成存在差异；④ 体外和体内研究标准化方案的缺乏，阻碍了新物种和菌株潜力的比较。

Correlation between in vitro and in vivo assays in selection of probiotics from traditional species of bacteria

2017-08-19  DOI: 10.1016/j.tifs.2017.08.005

JCM：病毒组对移植的影响（综述）

Journal of Clinical Microbiology[IF:3.712]

① 移植受体人群和其他免疫系统受损的宿主人群，发展出病毒相关疾病的风险较高；② 研究人体病毒组的方法包括：病毒特异性单靶点核酸扩增（NAAT）、NGS、非特异性扩增方法（例如滚环扩增）等；③ 供体病毒可传播给移植受体，在移植过程中，病毒可对免疫系统有多种影响，或导致同种异体移植排斥及损伤，引起交叉反应性细胞免疫，抑制耐受性；④ 例如，移植后的巨细胞病毒（CMV）与细菌感染等风险增加相关，细环病毒（TTV）与免疫抑制增强相关。

The Human Virome - Implications for Clinical Practice in Transplantation Medicine

2017-07-19  DOI: 10.1128/JCM.00489-17

Nutrients：补铁让肯尼亚婴儿的肠道菌群变“坏”

Nutrients[IF:3.550]

① 6月龄、非或轻度贫血、母乳喂养的肯尼亚疟疾流行地区的婴儿随机分为3组：含有12.5mg铁的多种微量营养元素粉（MNP+Fe）的MNP、不含铁的MNP（MNP-Fe）、安慰剂;② 基线时，变形菌门是最丰富的门，埃希氏菌属是所有门中最丰富的属；③ 干预结束时，MNP-Fe和安慰剂组的埃希氏菌相对丰度显著降低，基线时第二丰富的双歧杆菌属相对丰度在MNP+Fe和安慰机组中显著降低，仅MNP-Fe组的梭菌属升高；④ 炎症标志物无显著差异，除了IL-8在安慰剂组降低。

Iron in Micronutrient Powder Promotes an Unfavorable Gut Microbiota in Kenyan Infants

2017-07-19  DOI: 10.3390/nu9070776

FM：苯并芘如何影响肠道菌群代谢组及转录组

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 苯并芘是一种无处不在的致癌性环境污染物，属于多环芳香烃家族，可通过受到污染的食品进入消化道；② 苯并芘暴露不改变肠道菌群结构，但剂量依赖性地改变菌群的挥发性代谢组；③ 与维生素/辅因子代谢、细胞壁化合物代谢、DNA修复及复制系统、芳香族化合物代谢途径相关的转录产物水平上调；④ 与糖酵解-糖异生途径、细菌对简单碳水化合物的趋化性相关的转录产物水平下调。

Environmental Pollutant Benzo [a] Pyrene Impacts the Volatile Metabolome and Transcriptome of the Human Gut Microbiota

2017-08-15  DOI: 10.3389/fmicb.2017.01562

FM：益生菌组合改善沙门氏菌感染断奶仔猪的肠道健康

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 72只28天大的断奶仔猪分为4组：长双歧杆菌婴儿亚种CECT 7210及动物双歧杆菌乳亚种BPL6的益生菌组合处理/无益生菌处理，鼠伤寒沙门氏菌感染/无致病菌感染；② 相比于沙门氏菌+无益生菌组，沙门氏菌+益生菌组的断奶仔猪自主进食量增加，粪便排泄中的沙门氏菌减少，直肠温度降低，绒毛/隐窝比例上升；③ 无论是否感染沙门氏菌，益生菌组断奶仔猪的腹泻分数及发酵谱均得到改善，结肠氨浓度下降，绒毛上皮内淋巴细胞增加，绒毛/隐窝比例上升。

The Probiotic Combination of Bifidobacterium longum subsp. infantis CECT 7210 and Bifidobacterium animalis subsp. lactis BPL6 Reduces Pathogen Loads and Improves Gut Health of Weaned Piglets Orally Challenged with Salmonella Typhimurium

2017-08-15  DOI: 10.3389/fmicb.2017.01570

STM：特应性皮炎患儿皮肤菌群中的两种葡萄球菌

Science Translational Medicine[IF:16.796]

① 对特应性皮炎（AD）患儿的皮肤菌群动态进行分析；② 物种水平的分析发现，金黄色葡萄球菌在较为严重的患儿的皮肤上占主要地位，而在严重程度较轻的患儿的皮肤上，优势菌种为表皮葡萄球菌；③ 在菌株水平，宏基因组测序分析揭示了严重患儿的金黄色葡萄球菌菌株，以及所有患儿的异质性表皮葡萄球菌菌株；④ 将从严重AD患儿皮肤上分理处的金黄色葡萄球菌定殖于小鼠，可诱导表皮增厚、皮肤Th2及Th17细胞的扩增。

Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis strain diversity underlying pediatric atopic dermatitis

2017-07-05  DOI: 10.1126/scitranslmed.aal4651

感谢本期日报的创作者：沈志勋，花开，药农，小扣啊，女巫

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