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左手用R右手Python系列之——表格数据抓取之道

杜雨 R语言中文社区 2019-04-22

杜雨,EasyCharts团队成员,R语言中文社区专栏作者,兴趣方向为:Excel商务图表,R语言数据可视化,地理信息数据可视化。个人公众号:数据小魔方(微信ID:datamofang) ,“数据小魔方”创始人。


在抓取数据时,很大一部分需求是抓取网页上的关系型表格。

对于表格而言,R语言和Python中都封装了表格抓取的快捷函数,R语言中XML包中的readHTMLTables函数封装了提取HTML内嵌表格的功能,rvest包的read_table()函数也可以提供快捷表格提取需求。Python中read_html同样提供直接从HTML中抽取关系表格的功能。

HTML语法中内嵌表格有两类,一类是table,这种是通常意义上所说的表格,另一类是list,这种可以理解为列表,但从浏览器渲染后的网页来看,很难区分这两种,因为效果上几乎没有差异,但是通过开发者工具的后台代码界面,table和list是两种截然不同的HTML元素。

以上所说到的函数是针对HTML文档中不同标签设计的,所以说如果不加区分的使用这些函数提取表格,很可能对于那些你认为是表格,但是是实际上是list的内容无效。

library("RCurl")
library("XML")
library("magrittr")
library("rvest")

针对XML包而言,一共有三个HTML元素提取的快捷函数,分别是针对HTML表格元素,列表元素,和链接元素,这些快捷函数都是:

readHTMLTable()   #获取网页表格
readHTMLList()     #获取网页列表
getHTMLlinks()     #从HTML网页获取链接

readHTMLTable

readHTMLTable(doc,header=TRUE)
#the HTML document which can be a file name or a URL or an
#already parsed HTMLInternalDocument, or an HTML node of class
#XMLInternalElementNode, or a character vector containing the HTML
#content to parse and process.

该函数支持的HTML文档格式非常广泛,doc可以是一个url链接,可以是一个本地html文档,可以是一个已经解析过的HTMLInternalDocument部件,或者提取出来的HTML节点,甚至包含HTML语法元素的字符串向量。

以下是一个案例,也是我自学爬虫时爬过的网页,后来可能有改版,很多小伙伴儿用那些代码爬不出来,问我咋回事儿。自己试了以下也不行,今天借机重新梳理思路。

大连市2016年空气质量数据可视化~

URL<-"https://www.aqistudy.cn/historydata/monthdata.php?city=北京" %>% xml2::url_escape(reserved ="][!$&'()*+,;=:/?@#")
####
关于网址转码,如果你不想使用函数进行编码转换,
可以通过在线转码平台转码后赋值黏贴使用,但是这不是一个好习惯,
在封装程序代码时无法自动化。
#http://tool.oschina.net/encode?type=4
#R语言自带的转码函数URLencode()转码与浏览器转码结果不一致,
所以我找了很多资料,在xml2包里找打了rvest包的url转码函数,
稍微做了修改,现在这个函数你可以放心使用了!(注意里面的保留字)

###
mydata<-readHTMLTable(URL,header=TRUE) #Warning message: #XML content does not seem to be XML: #'https://www.aqistudy.cn/historydata/monthdata.php?city=%E5%8C%97%E4%BA%AC' header<-c("User-Agent"="Mozilla/5.0 (Windows NT 10.0; WOW64) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/61.0.3163.79 Safari/537.36") mytable<-getURL(URL,httpheader=header,.encoding="UTF-8") %>% htmlParse(encoding ="UTF-8") %>% readHTMLTable(header=TRUE)

结果竟然是空的,我猜测这个网页一定是近期做过改版,里面加入了一些数据隐藏措施,这样除了浏览器初始化解析可以看到数据表之外,浏览器后台的network请求链接里都看不到具体数据。

这样既没有API链接,又无法请求道完整网页怎么办呢?别怕,我们不是还有Selenium大法,不行我们就暴力抓取呀!

本次使用Rselenium包,结合plantomjs浏览器来抓取网页。(关于配置可以直接百度,此类帖子很多,主要是版本对应,相应路径加入环境变量)。

###启动selenium服务:
cd D:\ java -jar selenium-server-standalone-3.3.1.jar
###以上代码在PowerShell中运行,启动selenium服务器。
#创建一个remoteDriver对象,并打开
library("RSelenium") remDr <- remoteDriver(browserName = "phantomjs") remDr$open() #访问登录的页面
remDr$navigate("https://www.aqistudy.cn/historydata/monthdata.php?city=%E5%8C%97%E4%BA%AC") mytable<-remDr$getPageSource()[[1]] %>% htmlParse(encoding ="UTF-8") %>% readHTMLTable(header=TRUE,which =1) mytable<-remDr$getPageSource()[[1]] %>% read_html(encoding ="UTF-8") %>% html_table(header=TRUE) %>% `[[`(1)
#关闭remoteDriver对象
remDr$close()

以上两者是等价的,我们获取了一模一样的表格数据,数据预览如下:

DT::datatable(mytable)

readHTMLTable函数和rvest函数中的html_table都可以读取HTML文档中的内嵌表格,他们是很好的高级封装解析器,但是并不代表它们可以无所不能。

毕竟巧妇难为无米之炊,首先需要拿米才能下锅,所以我们在读取表格的时候,最好的方式是先利用请求库请求(RCurl或者httr),请求回来的HTML文档再使用readHTMLTable函数或者html_table函数进行表格提取,否则将无功而反,遇到今天这种情况的,明明浏览器渲染后可以看到完整表格,然后后台抓取没有内容,不提供API访问,也拿不到完整的html文档,就应该想到是有什么数据隐藏的设置。

没关系见招拆招嘛,既然浏览器能够解析,那我就驱动浏览器获取解析后的HTML文档,返回解析后的HTML文档,之后的工作就是使用这些高级函数提取内嵌表格了。

那么selenium服务器+plantomjs无头浏览器帮我们做了什么事呢,其实只做了一件事——帮我们做了一个真实的浏览器请求,这个请求是由plantomjs无头浏览器完成的,它帮我们把经过渲染后的完整HTML文档传送过来,这样我们就可以使用readHTMLTable函数或者read_table()

在XML包中,还有另外两个非常好用的高阶封装函数:

一个用于抓取链接,一个用于抓取列表。

readHTMLList
getHTMLLinks

http://www.tianqi.com/air/

我随便找了一个天气网首页,有全国各大城市的空气指数数据。这个看似是一个表格,实际不一定,我们可以使用现有表格函数试一试。

url<-"http://www.tianqi.com/air/"
mylist <-getURL(url,httpheader=header,.encoding="UTF-8") %>% htmlParse(encoding ="gbk") %>% readHTMLTable(header=TRUE) mylist < url %>%  read_html(encoding ="gbk") %>% html_table(header=TRUE) %>% `[[`(1)
NULL

使用以上代码抓内容是空的,原因有两种情况,一种是html里面标签根本不是table格式,有可能是list,另外一种情况可能跟上例一样,表格数据被隐藏。看一下源码就知道这个版块其实是list无序列表存储的,所以使用readtable肯定行不通,这时候就是readHTMLList函数大显身手的时候了。

header<-c(
     "User-Agent"="Mozilla/5.0 (Windows NT 10.0; WOW64) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/61.0.3163.79 Safari/537.36"      ) mylist <-getURL(url,httpheader=header,.encoding="windows-1253") %>% htmlParse() %>% readHTMLList()  %>% `[[`(4)  %>% .[2:length(.)] mylist <-read_html(url,encoding="UTF-8") %>% html_nodes(".thead li") %>% html_text()  %>% `[[`(4)  %>% .[2:length(.)] mylist <-read_html(url,encoding="UTF-8") %>% htmlParse() %>% readHTMLList()  %>% `[[`(4)

虽然成功的获取到了结果,但是遇到了令人厌恶的编码问题,不想跟各种编码斗智斗勇,再次使用了phantomjs无头浏览器,毕竟作为浏览器总是可以正确的解析并渲染网页内容,无论HTML文档的编码声明有多么糟糕!

#cd D:\ #java -jar selenium-server-standalone-3.3.1.jar#创建一个remoteDriver对象,并打开
library("RSelenium") remDr <- remoteDriver(browserName = "phantomjs") remDr$open() #访问登录的页面
remDr$navigate("http://www.tianqi.com/air/") mylist<-remDr$getPageSource()[[1]] %>% htmlParse(encoding="utf-8") %>% readHTMLList() %>% `[[`(8) %>% .[2:length(.)]
#关闭remoteDriver对象
remDr$close()

这次终于看到了希望,果然plantomjs浏览器的渲染效果非同一般!

使用str_extract()函数提取城市id、城市名称、城市污染物指数、污染状况。

library("stringr") pattern<-"(\\d{1,})([\\u4e00-\\u9fa5]{1,})"
mylist<-data.frame( ID   = mylist %>% str_extract_all(pattern) %>% do.call(rbind,.) %>% .[,1] %>% str_extract("\\d{1,}"), City = mylist %>% str_extract_all(pattern) %>% do.call(rbind,.) %>% .[,1] %>% str_extract("[\\u4e00-\\u9fa5]{1,}"), AQI  = mylist %>% str_extract_all(pattern) %>% do.call(rbind,.) %>% .[,2] %>% str_extract("\\d{1,}"), Quity= mylist %>% str_extract_all(pattern) %>% do.call(rbind,.) %>% .[,2] %>% str_extract("[\\u4e00-\\u9fa5]{1,}") ) DT::datatable(mylist)

最后一个函数便是抓取网址链接的高级封装函数,因为在html中,网址的tag一般都比较固定,跳转的网址链接一般在<a>标签的href属性中,图片链接一般在<img>标签下的src属性内,比较好定位。

随便找一个知乎的摄影帖子,高清图多的那种!

url<-"https://www.zhihu.com/question/35017762"
mylink <-getURL(url,httpheader=header,.encoding="utf-8") %>% htmlParse() %>% getHTMLLinks() [1] "/"                                   "/"                                   "/explore"                           [4] "/topic"                              "/topic/19551388"                     "/topic/19555444"                     [7] "/topic/19559348"                     "/topic/19569883"                     "/topic/19626553"                    
[10] "/people/geng-da-shan-ren"            "/people/geng-da-shan-ren"            "/question/35017762/answer/240404907"
[13] "/people/he-xiao-pang-zi-30"          "/people/he-xiao-pang-zi-30"          "/question/35017762/answer/209942092"

getHTMLLinks(doc, externalOnly = TRUE, xpQuery = “//a/@href”,baseURL = docName(doc), relative = FALSE)

通过getHTMLLinks的源码可以看到,该函数过滤的链接的条件仅仅是标签下的href属性内的链接,我们可以通过修改xpQuery内的apath表达式参数来获取图片链接。

mylink <-getURL(url,httpheader=header,.encoding="utf-8") %>% htmlParse() %>% getHTMLLinks(xpQuery = "//img/@data-original")

这样轻而易举的就拿到了该知乎摄影帖子的所有高清图片原地址,效率也高了很多。




Python:

python中如果不用爬虫工具,目前我所知道的表格提取工具就是pandas中的read_html函数了,他相当于一个I/O函数(同其他的read_csv,read_table,read_xlsx等函数一样)。同样适用以上R语言中第一个案例的天气数据,直接利用pd.read_html函数也无法获取表格数据,原因相同,html文档中有数据隐藏设定。

import pandas as pd url="https://www.aqistudy.cn/historydata/monthdata.php?city=%E5%8C%97%E4%BA%AC"
dfs = pd.read_html(url)

这里我们同样使用Python中的selenium+plantomjs工具来请求网页,获取完整的源文档之后,使用pd.read_html函数进行提取。

from selenium import webdriver driver = webdriver.PhantomJS() driver.get('https://www.aqistudy.cn/historydata/monthdata.php?city=%E5%8C%97%E4%BA%AC') dfs = pd.read_html(driver.page_source,header=0)[0] driver.quit()


OK,简直不能再完美,对于网页表格数据而言,pd.read_html函数是一个及其高效封装,但是前提是你要确定这个网页中的数据确实是table格式,并且网页没有做任何的隐藏措施。


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https://github.com/ljtyduyu/DataWarehouse/tree/master/File


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