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核酸检测、防疫监控,深圳科技抗疫的“硬核实力”是什么?

王延林 深圳卫视深视新闻 2021-07-23


自盐田“5·21”疫情发生以来,深圳的防控处置工作第一时间有序展开:应急反应快、检测速度快、病毒溯源快、有效控制快……


深圳市疾控中心病原生物研究所所长张仁利在深圳卫视《晚间报道》节目中表示,深圳已建立起一个较为完善的疾病监测体系,此次疫情就是主动监测出来的,而深圳也是去年继武汉发现新冠病毒病例后,全球较早发现新冠病毒的城市。他表示,深圳的疾病监测网络体系应该在全球处于领先地位。


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5月21日,在盐田港国际货轮登轮作业人员例行检测中,发现一例新冠病毒无症状感染者穆某。22日,发现一例关联境外输入关联无症状感染者。


此外,在管控的重点人员中,新发现两名无症状感染者。根据流行病学调查情况、核酸检测和病毒基因检测结果,初步判定此次疫情为一起境外输入关联的新冠肺炎疫情。



27小时侦破变异毒株“Alpha”

大大低于国家标准76小时

面对狡猾的变异病毒,如何找到它的源头,考验着深圳的检测水平。在对“5·21”疫情溯源中,疾控中心的“核心武器”发挥了关键作用。



为了应对一些未知病源的快速检测、分型和溯源,市疾控中心提前建立了二代、三代测序平台,该技术在传染病的病原学诊断,发现高变异、罕见以及新病原体方面具有极大优势。


“5·21”疫情出现当天,市疾控中心对盐田区一例境外输入关联新冠无症状感染者的样本进行了溯源分析。当时,样本的CT值比较低,意味着其病毒载量相对较高,病原所新冠溯源团队马上启动了二代和三代测序。



为了能更快跑赢新冠病毒,从样本准备、文库构建,上机测序、序列拼接、基因比对到撰写溯源分析报告,溯源团队不分昼夜争分夺秒,仅用27小时即成功测定首名无症状感染者病毒全基因组序列,大大低于国家标准的76小时


新冠病毒变异毒株“Alpha”被侦破,这对科学研判疫情、采取精准的防控措施、锁定重点人群和重点场所,起到了很关键的作用。



截至5月29日14时,溯源团队已成功获得“5.21”疫情中11例无症状感染者病毒全基因组序列,序列覆盖度在98.9%-99.9%之间。经分析,该11例无症状感染者的新冠病毒高度同源,推断11人属于同一感染来源或同一传播链。结合流行病学调查数据,基本判定本起疫情为境外输入关联疫情。



核心技术:病原体核酸就像水在管道流动

可通过信息库比对溯源



二代、三代测序平台为此次侦破变异病毒起到了关键作用,而这与测序平台的核心技术密不可分。


张仁利表示,它的核心技术,就是通过一个纳米孔一个电泳技术,把所有的感染者检测到的病毒,剪辑的序列慢慢阅读出来,就像水在管道里面流动一样。阅读出来以后进行拼接,再将信息库里面所有的新冠病毒进行比对,随后就能判断出此次主要传播的哪一种病原体,并能了解它的传播和传染源。


全面大规模筛查如同排雷


张仁利同时表示,对于城市的大人群全面筛查,主要涉及以下因素:


第一,对于感染者或者无症状感染者,他的密切接触者,以及密切接触者的密切接触者,很难完全掌握感染情况;


第二,因为新冠病毒的无症状感染者存在传染性,所以必须要进行整个人群的全面筛查,就好像把埋在地里的地雷全部排除一样。把所有的传染源筛查出来以后,才能控制疫情。



华大“火眼”实验室已完成

超121万人份核酸检测


6月4日下午,盐田区开展第四轮全员核酸检测,确保应检尽检、不漏一户、不落一人。


为迅速响应疫情防控需求,连日来深圳正有力有序地开展大规模的核酸检测。


5月24日,华大基因在大鹏搭建完成2万单管通量的“火眼”实验室。5月27日,连夜搭建龙岗、盐田两座“火眼”实验室,扩展后日检测通量为11万单管。截至6月3日中午12点,华大基因所有“火眼”实验室已完成超过121万人份的核酸检测。



海普洛斯移动负压硬气膜实验室

已检测超120万人次

同样检测超过百万人次的,还有海普洛斯医学检验实验室。5月27日,海普洛斯仅用6小时,便建成了日检测3万单管通量的移动负压硬气膜实验室。目前,海普洛斯南山、坂田两处医学检验实验室已完成超120万人次的核酸检测。



深圳共有88家新冠病毒核酸检测机构

一天可检测150万人


张仁利表示,目前深圳市可以进行新冠病毒核酸检测的机构一共有88家,主要包括疾病预防控制体系、临床医院和第三方检测机构,均是以筛查为主,筛查到有疑似阳性的样本,都要送到市疾控中心进行复核。


目前全市使用的核酸检测试剂盒,是按照国家卫生部要求,保证了检测结果的可靠性。全市88家医疗检测机构按照5混1的检测,一天可以检测150万人,能够满足目前的疫情检测需求。


对于核酸检测的技术原理,张仁利解释:采集对象的样本如果被新冠病毒感染,或者被检查对象的体内存在新冠病毒的核酸骨架,那么在很微量的情况下,可通过体外扩增技术,通过一个指数级的级别增长,收集指数级别扩增的产物信号,既能够定型检测感染者,也能够相对定量检测病毒的载量。


病毒在上呼吸道排放、积累达到一定量

才能显示其阳性


对于市民关心的前几次检测为阴性、随后却又检测到阳性的情况,张仁利解释,这是不同感染者存在的个体差异。有些免疫比较强的个体,病毒在上呼吸道复制的过程非常弱,所以有可能采集不到;还有病毒或者核酸的样本通过一段时间的积累,或者复制达到一定程度以后,可以达到体外扩增的最低检测量水平,才能显示阳性。


张仁利提醒:第一,打了疫苗以后,要24小时后才能接受新冠病毒的采样和检测;第二,在做核酸检测前半小时,尽量不要抽烟、喝酒,同时不要嚼口香糖;第三,在采样时要密切配合采样人员,确确实实采到一个可靠的样本。


记者 / 王延林
编辑 / 李雄飞


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