【学术快讯】生化所陈玲玲组《Mol Cell》发表封面重要文章丨BioArt原创

10月27日晚，《Mol Cell》在线发表了中科院上海生化细胞所陈玲玲研究员课题组的文章。笔者在10月22号的全国生化大会上不巧miss掉了陈老师的大部分演讲内容，但是最后一点时间内还是得知该项工作将于11月3号正式出版，并且是封面文章（见下图），那幅封面中的凤凰图案据陈老师当时讲是她的学生手绘的。不曾想到此文会提前一周online，笔者虽然有点措手不及，不过还是硬着头皮把这个故事简要的写下来了，不当之处敬请批评指正。

陈玲玲研究员在全国生化大会上做报告

该篇文章主要描述了她们课题组鉴定到的一类新的长片段非编码RNA SPAs（5‘ small nucleolar RNA (snoRNA) capped and 3‘ polyadenylated lncRNAs），SPA的加工过程与新生的mRNA 3’加工及XRN2（5’—3’外切酶）酶“修剪（trimming）”和Pol II聚合酶之间的动力学竞争相关联。在上游基因的剪切或者多聚腺苷酸化之后，下游尚未“带帽（uncapped）”的前体pre-SPA会被XRN2核酸外切酶“修剪”直到这种内切酶到达共转录组装的snoRNP上。snoRNP复合体随后会阻止外切酶的进一步切割，从而产生一个snoRNA 5’端从而使得Pol II聚合酶继续延伸。

以前的研究表明，Prader-Willi综合征（PWS）是由于染色体15q11-q13缺失，导致生长发育迟缓、身材矮小、手足小、智力低下、肌张力低下等一些列症状。而陈玲玲课题组的这项研究发现染色体15q11-q13区域恰好编码两个SPAs，而且这一类lncRNAs在细胞核中形成一个聚集，并且富集在一些RNA结合蛋白包括TDP43、RBFFOX2和hnRNP M周围。

PWS区域的SPAs与一些RNA结合蛋白相互作用

通过在人类干细胞中的一些实验，表明PWS区域的lncRNAs的缺失会改变上述RNA结合蛋白的结合pattern，而且这种结合的改变会导致可变剪接发生一系列的变化。但是这些变化是否与产生PWS综合征有关呢？接下来，她们从一例人PWS患者身上derive的iPSCs中找到了一些相关性，实验结果表明RIMS2和DLG1的mRNA发声了可变剪接，而且这两个基因正好此前报道与突出发生相关。

hESCs中PWS区域SPAs的缺失改变了系列的RNA可变剪接

基于以上结果，她们认为SPAs的缺失导改变了一些RNA结合蛋白的定位pattern，从而影响下游基因的可变剪接，而且与一些神经行为有很好的关联性，最后猜测SPAs这类型的lncRNAs可能与Prader-Willi综合征的发生可能有关。而且这一点正是本文的核心生物学意义所在，当然后续还需要很多实验去证明到底二者之间是否存在直接的联系，是否可以用小鼠模型去验证？相信不久会有一些答案。

工作模型图

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陈玲玲研究员简介

陈玲玲研究员2009年2月毕业于美国Universityof Connecticut Health Center 获得生物医学博士学位，并同时获得商学院工商管理学硕士学位。同年5月作为独立PI获得Connecticut Stem Cell Seed Award研究经费资助，受聘于University of Connecticut Stem Cell Institute 从事博士后研究，并于2010年5月起任助理教授。主要从事RNA编辑和长非编码RNA对基因表达调控和干细胞命运决定的分子机制研究。2011年起为上海生命科学院生物化学与细胞生物学研究所研究员，研究组长。建立独立实验室以来，在Cell, Molecular Cell, Genes & Development, Cell Research等杂志以通讯作者发表研究论文多篇。 陈玲玲研究组从事长非编码RNA研究，近年来揭示细胞核内非编码RNA参与基因表达调控的机制(Genes Dev, 2015; Cell Res, 2014, 2015)。也首次创建非poly(A)转录组纯化体系(Genome Biol, 2011)，系统发现一系列新RNA分子家族，揭示其生成加工机制及生物学功能，其中包括sno-lncRNAs (Mol Cell, 2012; NAR, 2015)，内含子来源环形RNA (Mol Cell, 2013)及外显子反向剪接环形RNA (Cell, 2014)。相关研究极大地推动了长非编码RNA和环形RNA研究领域的发展。目前是国家基金委优秀青年基金获得者、中组部“万人计划”青年拔尖人才、第八届上海青年科技英才。今年7月底，还获得第十一届华人生物学家协会Young Investigator Award。

特别值得一提的是，陈玲玲研究员的工作曾多次在Mol Cell和Cell Res上发表封面文章（见上图），而且近期连续受邀在《Current Opinion in Genetics & Development》、《Nat Rev Mol Cell Biol》、《Trends Biochem Sci》等知名期刊上发表综述专评类文章（见下图）。不可否认，陈玲玲老师是目前国内从事非编码RNA研究人员中一颗最闪亮的星星，其科研成就未来不可限量，同行们对她的工作都赞赏有加。

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