勾搭学妹，应该如何查找基因

提示：请点击标题下方蓝色“实验万事屋”，添加关注后，发“嗯”可以查看我们之前的文章。未经允许，其他公众号及网站不得转载哦！违者一律举报，绝不姑息！

“师妹，我有一条祖传的DNA想送给你”

“哪条？ID号？别名是什么？多少个bp？有多少个转录本？........”

“呃……其实是一整条……好吧，呐，我还有一个祖传的单倍体细胞系，你有没有兴趣呢？”

真的连基因都找不到，就不要在实验室里勾搭师妹了，现在的师妹都挺厉害的不是么……

要真找基因也并不是很容易的，我们先来分析一下基因名字。你要问了，师姐，你这不是侮辱我么，基因名字我

会不知道？什么P53、Nf-kB、β-Catenin，E-Cadherin，我是张嘴就来啊……

傲娇吧，年轻人，我们先来看看你用这种名字来，要怎么搜Actin这个基因。

点开NCBI的Gene，然后，输入你觉得是这个基因的名字：βActin，然后：

好吧，看到这里我们发觉，起码好歹真的有叫β Actin的基因，但怎么说呢，反正不是人的就对了。

那我们找是人的，好啦，旁边有工具，显示：

人么，就是这个Homo Sapiens，点进去还有48个基因，尼玛到底是哪个呢？

仔细看描述一栏，也就是Description，中间有一个是描述成actin，beta的，这个基因名（Symbol）应该是ACTB。而不是我们通常说的β Actin。

Symbol是基因的名称，在文献是可以经常看到的，经常会提到某个基因的基因名。我们就可以用Symbol在NCBI的Gene数据库搜索。但有一点需注意，Symbol是经常会改变的，就是说随着序列的升级，对该基因的研究更加深入，Symbol会改变。但这个基本上不会影响使用，因为NCBI仍然会保留旧的基因名。用旧的Symbol在Gene数据库搜索同样有效。

我们打开β Actin的Gene页面，抱歉，应该是ACTB。然后可以看到这样的信息，ATCB到底有多少种名字。这里有ACTB的官方基因名，官方全名也就是俗名，基因ID号（这个在做GO分析的时候很重要），还有该基因的别名。

是光这点基因名称就Over了么？还么有辣么简单，你会看到NC_0000000，NG_000000,NM_000000这样一系列的编码。这又特么是什么呢？

这是NCBI上对于基因注释的参考序列编码，我们稍微解释一下，基本上是这样的：

按照下面这个表格上的注释编码，就可以找到你想要的基因序列了。

学会了这个，你就可以轻松勾搭师妹了（感觉还是有点坑爹呢，不要在意这些细节。）对话就很可能是下面这样：

“师妹，我有一条祖传的DNA想送给你”

“哪条？ID号？别名是什么？多少个bp？有多少个转录本？........”

“Chromosome Y, NC_000024.10 (12904108..12920478)”

“那……那你把这段序列全长背一下吧……FASTA格式的……”

“呃……好吧，呐，我还有一个祖传的单倍体细胞系，你有没有兴趣呢？”

…华丽丽的分割线…

李莫愁博士：有很多基因名并不是大家口头所说的那些，比如P53，其实Symbol应该是TP53，Nf-kB的Symbol应该是NFKB1，β-Catenin的Symbol应该是CTNNB1，E-Cadherin的Symbol应该是CDH1，诸如此类。了解之后，大家就应该明白，为啥要搜基因去设计qPCR引物的时候，压根找不到要找的基因的俗名了吧？好了，今天就策到这里吧。