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人家五分文章是用这个神器来验证免疫组化的

2017-02-13 右哉 实验万事屋

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知道了如何用那种看起来没什么用的神器,来随手编课题(不知道的点),我们再回过头来看那篇文章了(没看过的点)。



对,没错,就是上次那篇Oncogenesis(IF=5.037)上的那篇文献,最后他们给出了一个免疫组化的图片,这个图片来源呢,是一个数据库,就是下面这个图:



这免疫组化的图是哪里来的呢?按照这篇文献上提供的线索,我们打开一下这个看看:



这个是基因蛋白表达的数据库,里面包含了来源于文献的免疫组化,测序和表达的数据,还是满全的。于是我搜一下文献里提到的这个基因Atg4B。



结果就出来了,分成组织、细胞和肿瘤三个分栏。



第一个打开的就是细胞,会显示这个基因的亚细胞结构表达,可以看到旁边的图例里绿色部分是表达该基因的。同时还有检测到这个基因的文献里,所使用的抗体信息。



点击进去就是这样,分成不同实验项目,例如:免疫组化啊,Western啊等等。这都可以给你做一个参考。



当然还有不同的样本中RNA的表达情况,可以按照组织、来源、表达情况等等来进行排序。



第一栏是组织情况,我们可以打开然后看这基因在不同组织中的表达,既然那篇文献研究的是肝癌,那作为对照,就应该是一个肝组织的表达。


于是我找到这个图,这个图似曾相识。



找到了对照,那我们就要看一下肿瘤中的表达,于是拉到Cancer一栏,点击一下肝癌。



于是会显示出肝癌中的Atg4B的表达情况,在这个上面,又可以看到一个似曾相识的图。



把这两个图凑在一起的话,就是这篇5分文献中所用到的这个图例了,明确显示了Atg4B基因在肿瘤中的高表达的情况。


…华丽丽的分割线…


李莫愁博士:这样的数据库数不胜数,就像那篇文献中一样,拿来作为佐证,其实也不错呢。当然,这些数据库不光能提供佐证,也能给我们一些提示,如果你反过来思考的话,可能还有更多收获,不是么?好了,网址已经写上了,请仔细在帖子里找,今天就先策到这里吧。


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