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更深层次的文献分析神器Get√!

2015-11-20 右哉 实验万事屋

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我叫郭芙,在万事屋的NPC里,不经常出现,我是莫愁师姐的师妹。上次听杀姐姐跟小林子说PubReMiner确实是神器(不知道就点这里)。但总觉得这些高频词真的好想用得上的也不是很多,又没有个统计啥的,分析文献多困难。应该咋办呢?


神师兄:这个简单,我教你,要偷懒就不要用PubReMiner,要用GoPubmed,这又是另一件神器了。


小郭:师兄,我已经跪下了,请告诉我吧!


神师兄:GoPubmed(http://www.gopubmed.com/web/gopubmed/)是一个类似Pubmed的搜索网站,当然,数据库也全都取材自PubMed。网站界面还是比较小清新的:



这样小清新的网页,我们能用来干嘛呢?很简单,用来分析文献!分析些啥呢?我们举个例子,用最近比较火,容易躺枪的circRNA来搜一下:



我们可以看到搜索完之后,会有这样的界面,搜索框下面有几个按钮,分别是显示摘要的按钮,文件格式显示的按钮(通常就是默认界面,不要去按的),统计分析的按钮,最高频作者的按钮,和筛选文献进行分析的按钮(也就是小抄分析)。


我们分析论文的话,主要靠的是统计分析这一栏,十分好用,点进去的话,会显示这样的界面:



会统计出搜索到的文献的文献年份,文献作者,文献发表的作者所在的国家和城市(当然没什么卵用),文献发表的杂志名,和文献的高频MeSH(不懂这是啥的话,就点这里吧)


高频的MeSH可以屏蔽掉大量的近义词,这样就会使得文献的高频词更为集中,容易分析,看看现在都研究到了什么方向。接着往下拉,会发现有文献的发表趋势图:



以此,可以判断你现在搜索的这个关键词,作为研究热点的概率有多少?可以看到的是circRNA,才刚刚起步,还有很长足的发展空间。应该不失为一个好的研究方向。除了这个之外,还有一个就是作者之间的相互关系:



这个就代表了发表过文献比较多的几个作者之间的合作关系,相互之间有么有什么联系就一目了然了……


接着,退回到文件格式界面(按第二个按钮),然后点击第四个按钮,看看发表文献最多的作者,这个作者是比较值得关注的。



再次按第二个按钮,退回到文件摘要格式上,然后可以细看一下,每一条有这些内容,比如有摘要(点一下就可以显示了),然后如果你看了觉得有必要分析一下,可以直接点到保存到小抄中,进行进一步分析。同时可以保存导出,比如摘要的pdf,或者保存到endnote中。同样可以从这个里面直接进入PubMed中。同样,还有一个功能,就是相关文献,这个可以分析与这篇文献的MeSH相关的PubMed中的其他文献。按照这个相关文献,也能进一步分析你要研究的对象。



当然,如果你要进一步研究的话,可以看到,其实GoPubMed还有一个左边栏。



这个左边栏是用来对你搜索的关键词进一步筛选的,怎么筛选,首先你能看到你要研究的这个关键词,会有很多相关的MeSH高频词。可以按图索骥,找出你要深入研究的方向。同时,在下面,还有杂志一栏。这个很屌的选项,可以让你远离低分杂志,一键完成PubMed的杂志筛选(不知道咋筛选的就点这里)。


还有比这个能更神器的么?好好试试看分析一下你的文献吧!


…华丽丽的分割线…


李莫愁博士:PubReMiner是能筛选出高频词,但是也只是筛选的功能,相对于GoPubmed而言,缺少了文献分析的功能。用GoPubmed的话,可以完成在MeSH词指导下,对文献的一个较好的分析。看看你要研究的这个课题,在科研上研究趋势怎么样。对你而言,会是把握课题方向的一个捷径。


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