一条背锅的三文鱼，一个恐慌的水产业
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历史上最冤的鱼，莫过于三文鱼。
因为名气太大，所以被“虹鳟鱼”冒充了很久。
这不，最近又因为在切三文鱼的案板上检测出了新冠病毒而开始让三文鱼背锅。
今天还有人用2019年的文章想要证明三文鱼“或可感染新冠病毒”。
同时，一批刺身店、日料店、海鲜店纷纷来询“华大能不能给我们的鱼查一下新冠病毒，帮帮我们吧，好容易复工，这又快倒闭了。”
好吧，今天尹哥决定为给人类很大贡献的三文鱼正个名！
下面就是几个核心点的技术分析。
三文鱼体内的病毒是什么？
自媒体评判三文鱼“或可感染新冠病毒”的依据主要是加拿大不列颠哥伦比亚大学（UBC）于2019年9月在著名生物学期刊 Elife 杂志发表的一篇研究论文，题为：Endangered wild salmon infected by newly discovered viruses。
该研究用宏转录组测序技术，筛选了6000多条三文鱼（包括野生，孵化和养殖），在其体内发现了3种新的病毒，其中一种为太平洋鲑套式病毒（Pacific salmon nidovirus ，PsNV）。
研究显示，PsNV和冠状病毒簇靠近，所以研究人员认为其与冠状病毒“同目”，属于Nidovirus病毒目。既然“同目”，意味着“血缘相近”，似乎科学已经证实了人鱼之间的病毒纽带关系，恐慌遂再度蔓延。
在尹哥看来，这种恐慌并无必要。病毒进入生物体内基本是一把“钥匙”开一把“锁”。如果新冠病毒发生了变异，能感染鱼了，那么变异后的“它”基本不能再感染人了，因为“钥匙”换了。
回到上述研究论文，虽然Nidovirus病毒目中包含了冠状病毒科、动脉炎病毒科和罗尼病毒科，但目前PsNV还没有归入任何一个科。
从原文中的系统分类树来看，PsNV和冠状病毒并不算是近缘。
1. 计算Pacific salmon nidovirus（PsNV）与2019新型冠状病毒（PMDB数据库的参考序列）的ANI（(Average Nucleotide Identity）值，为61.53%。
2. PsNV与2019新型冠状病毒（PMDB数据库的参考序列）也进行了blast比对，PsNV分别有两段区域比上PMseq数据库里的新冠参考序列，一段是91bp（位置15454-15543bp），其中17个错配，2个gap，一致性只有62.1%；另一段是48bp（位置13779-13826bp），其中6个错配，一致性只有56.5%。
尹哥翻看这篇研究论文的原文，发现里面也没有提及PsNV和冠状病毒的关系，作者只是画出一个“分类树”，想表达三文鱼身上的PsNV病毒离冠状病毒的“分类树”很近而已。此次被自媒体翻出来“炒冷饭”，实属有蹭热点的嫌疑。
病毒同“目”意味着什么？
病毒有很多种分类方式，如根据核酸类型可分为DNA、RNA；单链、双链等，根据病毒形态可分为球状、带状、冠状等。在科研文章中确实也会使用界门纲目科属种对病毒进行分类。（在生物分类上，目>科>属>种。）
《三文鱼或可感染新冠病毒》一文根据PsNV病毒与冠状病毒科同“目”，就说“该病毒与其远亲呼吸道冠状病毒拥有相似的感染策略”，未免有些牵强附会。
PsNV病毒作为一种新归类于套式病毒目的后来者，其与冠状病毒仅仅是同一个“目”，而这个“目”的分类标准是“有囊膜的单股正链RNA病毒”，打个比方，陆地上的交通工具是一个“目”，大家都能看出汽车、火车、自行车之间的差距非常大。而冠状病毒的几个高致病性成员：SARS、MERS和新冠病毒，它们已经在一个科，甚至是同属，它们之间的差别，类似于跑车之间找不同，比如法拉利、保时捷、兰博尼基之间的区别，共同点还是比较多的。
事实上，由于病毒的多样性和高突变率，目前人类所知道和能鉴定的病毒数量、种类非常有限。就拿肠道病毒组来说，目前研究的较少，基本上只关注一些噬菌体和丰度较高的几个“目”和“科”，其中有很多组装出来的序列尚不清楚是否属于病毒。
尽管病毒确实会使用Taxonomy来进行分类和描述，但病毒之间的序列差别非常大。病毒分类即使是同一个“科”，甚至在同一个“种”，都有可能性质不同，而现在只是“同目”，宿主特异性可能都会存在差别。怎么就能轻易下结论呢？
拿真菌举个例子，如镰刀枯萎病菌（Fusarium），在同一个种的内部存在很多生理小种，不同生理小种之间的遗传差异不是特别大，但每个生理小种只能专性地寄生小范围的宿主。遗传差别如此相近的真菌都如此，根据“目”水平上的相似性来进行病毒推断，更是不合理的。
新冠病毒能结合鱼类的ACE2受体么？
前两天有小伙伴问尹哥，新冠病毒的受体是ACE2，虽然鱼类没有肺，但是否会结合鱼类的ACE2受体呢？
此前，华大青岛海洋研究团队在关键的系统发生位置挑选了8种鱼类进行了新冠受体相关基因ACE2和TMPRSS2的同源性比较研究，结果显示两个基因与哺乳动物受体基因的同源性相似性很低。因此鱼类感染的可能性微乎其微。
这不，昨天国家官方就辟谣了“海鲜带毒”，还三文鱼一个清白。从切割进口三文鱼的案板中检测到了新冠病毒后，全国多地市场进行了核酸检测。6月15日，官方发布的最新检测结果如下：全国多地海鲜水产市场核酸检测结果为阴性，包括北京、广州、武汉、湖北、天津、成都、宁波、西安、云南等。
挪威、智利、法罗群岛紧急发布官方声明：挪威承诺在新冠疫情期间提供安全的食品；智利表示了解并确定智利的三文鱼是安全的产品；法罗群岛表示2020 年4月22日起没有发现任何一例新冠肺炎病例。
还是那句话，对于新冠我们要保持警惕，但不要因此采取过度防疫措施，“一刀切”政策只会平添恐慌，我们还应理性对待，尽量不影响民生经济的复苏。让三文鱼成为罪魁祸首时，我们要想一想那些以三文鱼为生的人，其中牵扯到多少就业和收入？影响了多少家庭的经济来源？这些“次生灾害”不能一而再再而三地发生了。
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