李登辉暗推两国论入宪，台海险开战！
蔡英文在9月24日民进党“全代会”提出“宪改”议题，民进党“立委”苏巧慧随即提出“修宪案”，其中条文隐含“一边一国”、“两国论”内容。台湾《中国时报》10月6日发表对国民党前“国大”代表暨党团书记长蔡志弘的专访，蔡志弘披露台湾地区前领导人李登辉早在1999年接受“德国之声”访问，抛出“两国论”之际，就曾交代他运作和推动当年由民进党陈婉真等人所提“修宪案”，铺陈“两国论入宪”。最后因大陆强硬回应、国际多国反对等各种因素，令李登辉收手，台海才躲过一次重大危机。
蔡志弘：李登辉交代处理“两国论入宪”
蔡志弘披露，李登辉早有让“两国论入宪”想法，当年亲自交代他运作和推动。蔡志弘还原当时过程说，李登辉1999年7月9日接受“德国之声”专访，抛出“特殊国与国关系”论述，投下台海震撼弹。蔡志弘说，李登辉在专访后隔日就当面交代他，对陈婉真(民进党籍“国大代表”)等人所提“修宪案”(限缩领土范围于台澎金马)，“爱厚轨啦(要让它通过啦)”，详细做法，李要他去问章孝严和黄昆辉。
蔡志弘还透露，李登辉交付他任务当晚与几位“国大代表”聚餐，李看来很高兴，喝酒大家都干杯，但他不太喝酒，就没干杯。李就跟他说：“诶，蔡志弘，你要当大政治家，就要有气魄，要干!”蔡志弘认为，当晚李登辉的话似有言外之意，感觉是鼓励他勇敢去做李下午交代的事(居中运作让民进党所提“修宪案”过关)。
李登辉交代任务后，蔡志弘接着几天在与美国国会议员、欧盟议员会面交流，都感受各国对“两国论”论述非常惊讶，加上诸多反向评论，他当下判断绝不能推动，否则不堪设想。
蔡志弘说，后来北京强力反制李登辉的“特殊两国论”，大陆提升东南沿海战备，台海情势陷入紧张，如果再推动“两国论入宪”，台海可能失控爆发战争，因此他没付诸行动。蔡志弘透露，为反制李的言论，当时解放军加强对台战备，“曾听说平潭当时聚集了106颗星星(将领星级数)，准备要拿下乌坵，给台湾动动小手术。”
乌丘屿归台湾金门县管辖，包括大丘、小丘两个岛屿，总面积约1平方公里。是台湾与大陆对峙的一个据点，目前驻扎有台海军陆战队一个营的兵力，500余人。由于乌丘邻近大陆边缘，扼控福建莆田兴化湾、湄洲湾出海口，与金门、马祖互为犄角，监控台湾海峡南北交通，可监侦解放军动态、获取情资，台军视其为台海防御作战最前哨及争取战略纵深的重要一环。
“九二一”大地震解除战争危机
蔡志弘说，根据后来美方的解密文件，李登辉抛出“两国论”后，大陆计划拿下乌坵。蔡志弘说，他曾遇到当年派驻乌丘的一位连长，此人后来也当上将军，这位当时在乌丘的连长说，当时情况危急，乌丘曾禁止通讯一个月，官兵连遗书都写好了，可见战火一触即发。
蔡志弘说，两岸当时情势已非常危险，后来因为“九二一”大地震，加上李登辉也喊停了“修宪案”，该案在“国大”制度终结后不了了之。亲历这段历史，蔡志弘说，当年台湾尚无条件，现在大陆实力强大，民进党苏巧慧等41位“立委”推动“修宪”，务必要了解可能带来的严重性后果，要谨慎再谨慎。
李登辉推“两国论”器重蔡英文
《中国时报》的报道说，李登辉1999年发表“两国论”前，曾于1998年8月成立“强化中华民国主权国家地位”小组，召集多位年轻法政学者参与研究，而时任“国安会”咨询委员的蔡英文不只是该小组核心成员，更被李登辉授权专责运作该小组。
当时该小组由“国安会”咨询委员蔡英文、张荣丰、时任“总统府”副秘书长的林碧照和台湾大学、政治大学及“台经院”等机构多位法政学者组成，研究如何“强化中华民国主权国家地位”。
李登辉还接受几位“国安会”资深幕僚建议，决定委请专精国际法的蔡英文负责主持该项目小组。研究期间，蔡英文曾赴美国、日本、意大利等地，与知名国际法学者交流，就如何从法律面突破国际困境征询意见，并定期直接向李报告进度。
早在1995年，时任政治大学国贸系教授的蔡英文，就被李登辉政府借调入“国安会”，成为李的幕僚。1998年10月在上海举行的第二次“汪辜会谈”，蔡英文也以专家身分随团登陆。可见李登辉对蔡英文极为器重。
大陆学者：若“法理台独”将“非和平”解决
《中国时报》10月6日推出的相关报道，还采访了多位大陆学者，针对民进党“立委”提出“修宪”版本，试图重新定义两岸关系性质，大陆涉台学者表示，这形同推动“法理台独”，与李登辉“两国论”无异，已触犯红线。这是对北京最严厉的挑衅，将进一步迫使大陆以“非和平”方式加快解决台湾问题。民进党此举根本是拉着台湾民众福祉一同陪葬。
民进党主席蔡英文在民进党“全代会”抛出“宪改”议题后，民进党“立委”苏巧慧随即提出早已拟好的“宪法增修条文”修正草案，内容涉及取消“自由地区与大陆地区”用法，改为“我国与中华人民共和国”等文字。
大陆华东师范大学两岸区域研究所副所长包承柯指出，民进党当局正在操作非常危险的提案，是一种走钢索的行径，想要制造“一边一国”、“一中一台”，这形同是炮制李登辉时期的“两国论”。
包承柯直言，蔡政府若是要把所谓“两国论”观点，放在“宪法及其增修条文”的内文，很明显是一个实质性的“法理台独”。过去李登辉、陈水扁要推动“法理台独”都没有成功，蔡英文想要“借尸还魂”更是想都别想。
包承柯说，全世界没有任何国家支持台湾走向“法理台独”，倘若提案弄假成真，必然会导致两岸冲突，不只两岸永无宁日，台湾民众的福祉也将一同陪葬。
北京联合大学台研院副院长李振广强调，绿营有些民代想要改变两岸定位，这种提案是赤裸裸的“台独”，北京绝不允许任何政党将台湾分裂出去。
李振广认为，尽管这仍只是提案，能否成局还有待观察，但倘若成真，将是大陆开启以“非和平”方式实现国家统一的开端，将迫使大陆加快统一进程。他还说，如果“台独”份子给了北京这样的机会，相信北京一定会抓住“宝贵机会”，实现国家统一，尽管可能是以非和平方式。