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颜宁将辞职回国加盟深圳医科院,深圳:不是抢饭碗,而是把蛋糕做大 | 科研圈日报

科研圈 2022-11-10
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· 科研机构


颜宁将辞职回国加盟深圳医科院,深圳:不是抢饭碗,而是把蛋糕做大


图片来源:“人才深圳”公众号


在 11 月 1 日的 2022 深圳全球创新人才论坛上,著名科学家颜宁宣布将辞去普林斯顿大学教职,以全职身份协助深圳创建深圳医学科学院。据公众号“深圳发布”,深圳医学科学院由市政府设立,不定编制,不定级别,实行社会化用人制度,院长面向全球招聘。深圳市政府公报印发的《深圳医学科学院建设方案》介绍,深圳医学科学院将按照全新机制的要求,主要建设“四平台一智库”,力争到本世纪中叶成为全球著名医学研究机构。


澎湃新闻援引深圳市卫健委文章,深圳市卫健委科教处处长周丽萍表示,深圳医学科学院绝不是来抢饭碗的,相反,要帮助大家把蛋糕做得越来越大:“深圳医学科学院不是要跟其它高校和研究院所抢资源,抢人才,而是要成为一个协同创新的机构,通过项目和资金为纽带,把这些院校和研究院所连接起来,为他们的临床研究及转化提供服务。”周丽萍还说,深圳医学科学院将建设一个医学科技的基础支撑平台,包括生物样本库、动物实验中心、卫生健康科学数据中心等,可以供全市乃至国内外的研究机构、企业及科研人员使用。(深圳发布、澎湃新闻)


· 人工智能


Meta 开发 AI 预测超 6 亿种未知蛋白质结构


图片来源:ESM Metagenomic Atlas (CC BY 4.0)


《自然》新闻Nature news)报道,Meta 公司开发的 ESMfold 模型预测了细菌、病毒和其他微生物的 6.17 亿种蛋白质结构。这些蛋白质结构与任何已知的结构都不同,不曾出现在实验确定的蛋白质结构数据库或 Alphafold 数据库中。

今年 7 月,Alphafold2 发布了对 2.14 亿个已知蛋白质三维结构的预测,涵盖了地球上几乎所有已知的蛋白质,但 Alphafold2 的工作依赖于多序列比对(MSA)。相比之下,ESMfold 引入了大型语言预测模型,大大加快了结构预测的速度,速度是目前最快模型的 60 倍。研究者将这一模型应用于环境来源的宏基因组 DNA 数据库,根据其中可能的编码 DNA 序列,仅用 2 星期就得到了超 6 亿个蛋白质结构的预测结果。

但 ESMfold 的准确率也饱受争议。论文中指出,在 6.17 亿个预测结果中,只有约三分之一被认为是“高置信”(high confience)的预测结果——研究者认为这些预测符合实际结构,且有时可以提供原子尺度的细节特征。与此同时,也有部分科学家对 ESMfold 预测结果的准确性提出质疑。一些科学家认为,ESMFold 提供的数亿个低置信度的预测结果存在很大问题,其中有些预测结果可能缺乏明确的结构,另一些可能属于被误判的非编码DNA。相关论文已于 10 月 31 日发布于 bioRxiv 预印本网站。(Nature News)



· 海洋环境


鲸类每日可摄入数百万微塑料颗粒


《卫报》(The Guardian报道,日益加重的海洋塑料污染正导致鲸类暴露于微塑料的极端风险。近日,美国加利福尼亚州立大学(California State University)与斯坦福大学霍普金斯海洋站(Hopkins Marine Station, Stanford University)的一项联合研究量化模拟了滤食性鲸类微塑料的摄入量和途径,指出以磷虾为食的蓝鲸每日可摄入1000万颗微塑料,而以鱼为食的座头鲸可能会摄入20万颗微塑料。

研究人员结合了加州海流生态系统(California Current Ecosystem,CCE)的微塑料数据和 191 头带有标记的蓝鲸、长须鲸和座头鲸的高分辨率摄食行为测量数据。结果表明,几乎所有的微塑料摄取都是通过摄食行为发生的,以鱼为食的鲸鱼比以磷虾为食的鲸鱼更少摄入到微塑料。研究人员称,如果塑料污染在未来继续上升,或在高度污染的地区,鲸类每天可能会吃掉 1.5 亿颗微塑料。相关论文 12 月 1 日发表于《自然-通讯》(Nature Communications。(The Guardian



· 神经科学


科学家发现新的精神分裂症风险基因


多巴胺是神经系统中使人们获得愉悦感的神经递质。此前,曾有一些研究提出多巴胺 D2 受体的过度活化会导致精神分裂症,且很多精神分裂症治疗药物通过阻断纹状体中的多巴胺 D2 受体起效。然而,之前对精神分裂症的大规模基因研究多集中于多巴胺 D2 受体低表达的大脑皮层区域,且并没有发现多巴胺 D2 受体是精神分裂症风险因素的直接证据。


近日,来自美国利伯大脑发育研究所(Lieber Institute for Brain Development)的研究人员通过对 443 个捐献者死后大脑中多巴胺 D2 受体基因高表达的尾核区域进行全面的基因组和转录组分析,发现与此前的观点相悖,一个多巴胺 D2 受体的短型异构体的表达降低是精神分裂症的主要风险因素。在精神分裂症患者脑中,该受体表达的减少会导致多巴胺释放过多,破坏突触前的自调节机制,从而导致疾病。研究者认为该基因的发现可为发展全新的抗精神病药物提供潜在靶点。相关论文于 11 月 1 日发表于《自然-神经科学》(Nature Neuroscience。(Lieber Institute for Brain Development)



· 疫情通报


11 月 1 日我国内地新增本土确诊病例 409 例,新增本土无症状感染者 2346 例


根据国家卫健委官网报,11 月 1 日 0—24 时,31 个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例 465 例。其中境外输入病例 56 例(福建 18 例,广东 10 例,上海 8 例,四川 7 例,北京 5 例,云南 2 例,天津 1 例,内蒙古 1 例,辽宁 1 例,黑龙江 1 例,浙江 1 例,山东 1 例),含 12 例由无症状感染者转为确诊病例(福建 6 例,四川 3 例,北京 1 例,辽宁 1 例,浙江 1 例);本土病例 409 例(广东 125 例,河南 64 例,福建 39 例,新疆 30 例,北京 28 例,山西 24 例,内蒙古 24 例,重庆 13 例,黑龙江 12 例,湖南 10 例,江苏 8 例,陕西 8 例,青海 8 例,山东 4 例,四川 4 例,云南 3 例,辽宁 2 例,上海 1 例,湖北 1 例,宁夏 1 例),含 69 例由无症状感染者转为确诊病例(福建 32 例,广东 19 例,重庆 7 例,北京 4 例,黑龙江 2 例,云南 2 例,陕西 2 例,四川 1 例)。新增无症状感染者 2463 例,其中境外输入 117 例,本土 2346 例(新疆 400 例,广东 298 例,内蒙古 296 例,河南 295 例,黑龙江 187 例,湖南 135 例,山西 112 例,山东 93 例,福建 85 例,青海 83 例,河北 68 例,湖北 64 例,甘肃 58 例,四川 33 例,云南 29 例,陕西 29 例,辽宁 25 例,天津 17 例,江苏 11 例,安徽 5 例,广西 5 例,西藏 5 例,北京 4 例,浙江 4 例,重庆 3 例,吉林 1 例,宁夏 1 例)。截至 11 月 1 日 24 时,我国内地累计报告确诊病例 260 971 例,累计死亡病例 5226 例。(国家卫健委)


编写:张雪莉、张宇、翁佳玉、张琪

编辑:张琪

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