1979年3月，广东省委为加强对宝安的领导，促进宝安的对外开放和发展，将宝安县改为深圳市，辖深圳、南头、松岗、龙华、葵冲、龙岗六个区，总人口约35.8万人。10月，设立罗湖管理区。11月，深圳市由原省、地双重领导的体制改为地区一级的省辖市，直属广东省领导，管辖龙岗、葵冲、龙华、罗湖、南头、松岗6个区。
1980年7月，分罗湖管理区，成立沙头角管理区。8月，为了给全国的改革开放探索一条新路，提供一个突破口和实验场，建立深圳经济特区，包括深圳、沙头角二镇和附城、盐田、南头、蛇口公社，总面积327.5平方公里。
1981年10月，恢复宝安县建置，辖深圳经济特区外的原宝安县地区，以加强对深圳市经济特区以外区域的领导和管理，促进该区域的经济社会发展和改革开放。全县划分为大鹏、葵涌、坪山、龙岗、坪地、横岗、平湖、布吉、观澜、龙华、石岩、西乡、沙井、福永、松岗、公明16个人民公社和光明华侨畜牧场。
1982年1月，设立罗湖行政区，原沙头角区并入罗湖区。9月，沙头角镇从罗湖区分出。
1983年9月，分罗湖区，分别成立罗湖、上步、南头、沙头角4个管理区，属县级建置，作为深圳市政府的派出机构。至此，特区内共设4个县级行政区。
1984年8月，从南头管理区分出部分地域，成立蛇口管理区，面积11.4平方公里,驻地设在蛇口,下设1个办事处.
1986年10月，区、乡建置改为镇、村建置，南澳从大鹏分出，坑梓从坪山分出。
1987年2月，全县共整编为18个区级镇、165个行政村；光明华侨畜牧场仍托宝安县管辖。1989年，全县分18个镇、178个行政村。
1989年10月,上步管理区改名为福田管理区。
1990年1月，特区内撤销罗湖、福田、南头、蛇口、沙头角管理区，成立罗湖、福田、南山三个市辖区。3月，沙头角区并入罗湖区。
1991年，全县分18个镇、191个行政村；光明华侨畜牧场仍在宝安县区划内。18个镇是：新安、福永、沙井、松岗、公明、石岩、龙华、观澜、平湖、布吉、横岗、龙岗、坪地、坪山、坑梓、葵涌、大鹏、南澳。
1993年1月，撤销宝安县建置，设宝安、龙岗2个市辖区。宝安县辖西乡、福永、沙井、松岗、公明、石岩、龙华、观澜8镇；龙岗区辖平湖、布吉、横岗、龙岗、坪地、坪山、坑梓、葵涌、大鹏、南澳10镇。
1997年10月，为促进深圳经济特区东部的开发和经济发展，及加强区域的行政管理，分罗湖区，设盐田区。盐田区总面积71.828平方公里，地理上相对独立，自成一体，1996年总人口18.7万人，工农业总产值71.07亿元，国内生产总值17.4亿元，预算内财政收入2.45亿元，市政基础设施完整配套。
2004年，为实现特区内外一体化发展，推进宝安龙岗两区城市化工作，撤销宝安和龙岗两区所管辖17个镇改为街道办事处。2010年，深圳已实现特区内外一体化，经济特区范围已扩大到全市。
至2010年12月，全市共设6个市辖行政区和光明、坪山2个管理区，57个街道办事处，791个居民委员会。
至2014年2月，全市共设6个市辖行政区和光明、坪山、龙华、大鹏4个功能区，57个街道办事处，796个居民委员会。
至2015年6月，全市共设福田、罗湖、南山、盐田、宝安、龙岗6个市辖行政区和光明、坪山、龙华、大鹏4个功能区，59个街道办事处，796个居民委员会。
截至2016年10月，深圳全市共设福田、罗湖、南山、盐田、宝安、龙岗、龙华、坪山8个市辖行政区和光明、大鹏2个功能区，63个街道办事处，796个居民委员会。（来源：深圳市民政局）