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关于外泌体的转录组学研究与运用思考

基因芯片知识屋 伯豪生物 2022-08-30

外泌体(Exosome)是一类由细胞分泌的囊泡结构,携带了来自母细胞的多重蛋白,脂类,DNA和RNA等信息。外泌体无论在正常细胞还是异常细胞中都能分泌。现有的研究表明,外泌体无论对于正常生命过程或者是疾病发生发展都有着重要的作用。

外泌体天然存在于各类体液中,包括血液,唾液,尿液,母乳等都能分离到外泌体。最近由华中农业大学的研究显示,从汗液中也能分离出外泌体(Wu and Liu 2017)。因此,从可检测的角度来说,外泌体肯定是未来转化医学领域重要的体外诊断对象之一。那么,从转录组学研究外泌体,可行性有多大呢?


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外泌体成分决定可从转录组学角度进行研究

外泌体中包含有母细胞来源的RNAs,具体包括mRNA,miRNA,lncRNA和最新研究热点circRNA。只要是目前转录组学大家关心的,都能在外泌体中检测到。因此,常规细胞中研究的RNAs,都能在外泌体中进行研究。


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外泌体特性决定其运用价值

由于外泌体是囊泡结构,又有母细胞分泌而来。因此有两点信息非常重要,一个是携带了母细胞的信息,一个是保护了内部成分在细胞外免受降解。有研究表明,血清外泌体中的lncRNA,相对血清样本作为biomarker特异性和敏感性都更高(Dong, Lin et al. 2016)。所以,通过外泌体内部的分子鉴定来作为biomarker,是一个非常非常理想的方向。当然,至于具体的分子,上面转录组学提到的RNAs,或者是蛋白,脂类等都是可以考虑的。


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外泌体来源决定其运用广泛性

由于外泌体在体液中广泛存在,无论是血,唾液,尿液,母乳,还是汗液,都能分离到外泌体,而且能在外泌体中找到与疾病特异性相关的分子。因此,就这一点来说,外泌体是未来临床诊断的一大热点之一,将会用于疾病诊断,跟踪或预后。


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外泌体分离方法的进步是其发展的重要动力

外泌体区别与常规样本在于其本身是细胞分泌产物,含量低,分离到足够的量是能否对其进行研究的重要因素。但是,现在的技术发展,包括常规的超速离心,磁珠,免疫,和商用试剂盒(SBI ExoQuick,Qiagen exoRNeasy Serum/Plasma Kit等),都能很好地对外泌体进行分离和纯化。因此,有了技术的支持,将外泌体进行广泛的研究就有了可能性。


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外泌体的未知也是它最大的魅力所在

研究外泌体的方向很多,从生成到转运,或者用于疾病marker研究。但是,相对来说,这个领域还是有太多的未知。目前从蛋白角度和miRNA角度来找特定分子的研究比较多。然而,lncRNA,circRNA,这些本身在细胞中还有太多未知的分子,在外泌体里的研究就相对更少了。因此,从这些新的分子出发,在外泌体中去发现更多新的东西,虽然会有难度,但是成果也是颇丰的。

综上所述,外泌体无论从研究还是运用角度,都是疾病或者基础研究的理想选择。肿瘤研究,心血管疾病,慢性病,代谢紊乱相关疾病等等,小编认为,从科研发现的角度来说,去尝试和深究是可行


参考文献

Dong, L., W. Lin, P. Qi, M. D. Xu, X. Wu, S. Ni, D. Huang, W. W. Weng, C. Tan, W. Sheng, X. Zhou and X. Du (2016). "Circulating Long RNAs in Serum Extracellular Vesicles: Their Characterization and Potential Application as Biomarkers for Diagnosis of Colorectal Cancer." Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 25(7): 1158-1166.

Wu, C. X. and Z. F. Liu (2017). "Proteomic profiling of sweat exosome suggests its involvement in skin immunity." J Invest Dermatol.


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