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外泌体研究数据库大揭秘

基因芯片知识屋 伯豪生物 2022-08-30


外泌体(exosomes)

外泌体(exosomes)是一类由细胞分泌的胞外囊泡结构,由于其内部包含有DNA,蛋白,脂类,RNA等信息,可以作为细胞间交流的载体而受广泛关注。那么,现在有哪些外泌体数据库可用呢?今天,小编和大家分享三个外泌体相关数据库。

ExoCarta(http://exocarta.org/)

ExoCarta是一个收录了包括人(Homo sapiens),大鼠(Rattus norveqicus),小鼠(Mus musculus),绵羊(Ovis aries),豚鼠(Cavia porcellus),果蝇(Drosophila melanogaster),马(Equus caballus),穴兔(Oryctolagus cuniculus),牛(Bos taurus)在内的几个物种的286个研究结果,涉及到不同组织器官来源的外泌体中的蛋白,mRNA,miRNA,脂类等信息。同时,该数据库把在不同研究中多次鉴定到,可能作为marker的100个蛋白进行了统计。该数据库为开放平台,个人研究发现结果,该数据库也欢迎大家上传更新。该数据库最新更新时间为2016年09月12日。

Vesiclepedia(http://www.microvesicles.org/)

Vesiclepedia是一个专门收录胞外囊泡研究的数据库,涉及到的物种有33个,来源研究538个,包含了包括凋亡体,微泡,外泌体等在内的囊泡中发现的蛋白,mRNA,miRNA 和脂类信息。数据库最新更新时间为2015年1月1日。

EVpedia(http://student4.postech.ac.kr/evpedia2_xe/xe/)

EVpedia是一个收录了原核和真核生物胞外囊泡研究的数据库。该数据库将不同囊泡研究(包括外泌体)中发现的蛋白,mRNA,miRNA,脂类,代谢产物进行了整理。当然,该数据库对可用于囊泡marker(蛋白,mRNA,miRNA等)进行了归整。除此之外,该数据库还可以进行数据分析和功能注释。该数据库最新更新时间为2015年2月6日。

以上三个数据库有专门收录外泌体,也有收录囊泡研究的。虽然从数量上来说,不是非常多,但是,从涵盖的内容来说,基本满足了外泌体研究的基本需求。应该来说,这些数据库无论是对做人,大小鼠模式动物的,还是做其他生物外泌体研究的小伙伴们,都可用来参考。


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