代谢组学|一篇文章告诉你如何收集样本！

之前我们略述了代谢组学的课题设计，按照设计的思路进行实验后，就需要进行代谢样本的收集了。今天咱按照不同类型的样本，给大家提供一点收集的建议。

针对细胞类型样本，可分为四类

贴壁细胞

悬浮细胞

微生物

胞外代谢产物

处理如下

贴壁细胞

去除培养基，采用预冷的PBS清洗2-3次，离心弃去上清，加入1ml 60%冷甲醇，把培养容器中的所有细胞都刮取干净，收集在1.5ml离心管中，液氮速冻后-80°C保存。

悬浮细胞

离心收集悬浮细胞，用预冷的PBS清洗2-3次，离心弃上清，收集细胞于1.5ml 离心管中，液氮速冻后-80°C保存。

胞外代谢物

培养基上清收集后液氮淬灭，冻干处理后-80℃保存。

微生物

取生长对数后期的或者稳定期中段的微生物，低温离心（4°C, 12000rpm, 10min），沉淀微生物，去掉上清液，放入液氮中或-80°C保存。

针对植物类型样本，可按部位分为根、茎叶、果实及培养液等

处理如下

根

取植物的根部50mg以上，用PBS漂洗掉根上的泥土后用吸水纸吸掉多余水分，装入离心管，立即用液氮速冻处理15min，于-80°C下保存。

茎、叶、花等

参照实验设计取特定组织部位50mg以上。用锡箔纸包裹并标记后，立即用液氮速冻处理15min，于-80°C下保存。

果实

将同组的植株种子混匀后分装50mg以上至冻存管中，立即用液氮速冻处理15min，于-80°C下保存。（如果果实外壳较硬，需要用粉碎机打碎过筛。）

植物培养液

直接低温离心（4°C, 12000rpm, 10min），取上清液，移至1.5mL离心管，200μL分装后，于-80°C下保存。

针对临床和动物类型样本

主要可分为体液（血清、血浆、尿液、泪液、脑脊液等）和组织类型（肝脏、肿瘤、肌肉、粪便等）等

处理如下           

血清

血液收集在不含抗凝剂的离心管中 4°C（或冰浴）静置 1h 进行凝固分层，低温离心（4°C, 12000rpm, 10min），取上清转移至干净的离心管中。取上清分装到 1.5mL 离心管中，每管 0.2mL，于-80°C下保存。

血浆

使用肝素钠抗凝管采集全血，轻轻摇晃采血管（避免红细胞破裂）使抗凝剂和血液充分混合，低温离心（4°C, 12000rpm, 10min），取上清液分装到 1.5mL 离心管中，每管 0.2mL，于-80°C下保存。

尿液

取称取中段尿到离心管中，低温离心（4°C, 12000rpm, 10min）,吸取澄清尿液分装到 1.5mL 离心管中，每管 0.2mL，于-80°C下保存。

粪便&肠道内容物

取新鲜粪便或内容物，分装样本到离心管中，每管50mg以上，后立即用液氮速冻处理15min，于-80°C下保存。

组织（肝脏、肿瘤、肌肉等）

根据实验设计取特定组织部位，如果组织上有血液残留，用生理盐水将其漂洗掉，按照100 mg/样本装入冻存管中；后立即用液氮速冻处理15min，于-80°C下保存。

以上是主要常见的几种样本类型采集方式啦，不过生物样本类型多样，童鞋们有其他类型的样本不确定如何收集可与我们直接沟通~

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