内测福利预约|伯豪生物FFPE空间转录组解决方案！
FFPE处理是目前长期保存病理样本的标准化方法，保存了大量的临床上患病和正常组织的样本资源，该样本代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料，据统计世界上大约有数十亿份组织样品保存在医院或者组织样品库中，其中绝大多数是FFPE样品。但是由于FFPE样本通常珍贵且保存时间长，存在RNA/DNA量少和高度降解的问题，因此如何获得FFPE样本所蕴藏的生物信息，如何利用分子生物学方法对FFPE 样本进行检测，进而针对FFPE 样本进行高通量组学分析就变得越来越重要。针对目前热度很高的空间转录组学，如何实现对FFPE样本的检测显得尤为迫切。
10X Genomics旗下全新的Visium FFPE空间基因表达解决方案，打破过去从FFPE组织中获取空间全转录组基因表达信息的壁垒 空间转录组：Visium Spatial Gene Expression技术不在局限于冰冻组织切片，10XGenomics通过不懈的研发整合，已推出Visium FFPE空间基因表达解决方案，伯豪生物成为中国首批引进该技术方案的高新技术企业之一。通过优化后空间Visium FFPE全转录组方案，能够从FFPE样本中以高灵敏度和高特异性分析相关基因的表达，在形态学背景下实现真正的探索发现。
国际护士节
伯豪生物已开启FFPE空间转录组测序产品服务预订，
5.12护士节，致敬白衣天使，
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Visium FFPE的原理示意
Visium FFPE的产品特色
（1）使用已存档的生物库样本进行生物标记物挖掘；
（2）进行回顾性研究和纵向研究，以追踪特定时间内的生物学过程；
（3）通过结合免疫荧光技术，同时进行蛋白和基因表达可视化检测；
（4）与H＆E技术结合进行形态学分析，充分挖掘珍贵的组织样本中的信息；
关于Visium FFPE
Visium FFPE组织样本的可视化空间基因表达是一种突破性的解决方案，它将FFPE组织样本的组织学优势与高通量的sc-RNA-seq相结合，为传统的病理学分析提供了详实的补充。该技术可对人类和小鼠FFPE样本中超过18,000个基因的RNA表达进行高分辨率的空间分析。通过全转录组分析（WTA）和FFPE组织图谱分析，您可以检测任何通路中的任何基因，解决组织细胞类群组成的异质性，并获得这些信息在组织样本中的空间信息。
图1 获得FFPE组织切片中基于形态学背景的高分辨率基因表达特征。
Visium FFPE的可视化空间基因表达在完整的FFPE组织切片上获取基因表达信息，可以更深入的了解组织的生理生化特征：包括生物标志物的发现，对保存的样本进行回顾性和纵向研究，以及对正常和病变组织的比较研究。
图 2 流程化的Visium FFPE轻松地从样本获得数据
a .将FFPE组织切片置于Visium基因表达片上，进行组织学成像(H&E用于形态学背景，IF用于蛋白质共表达检测)。载玻片上的每个捕获区域都有一个oligo阵列，每条Oligo上包含与RNA结合的捕获探针，该oligo同时具备描述空间信息的标记性序列，以及文库构建所需测序。FFPE组织的基因表达信息与位置信息被该款载玻片捕获，并完成文库构建，然后，通过常规的测序检测和数据的可视化呈现，我们便可以确定哪些基因发生表达，在哪里表达，以及表达的数量。b. Visium FFPE检测采用RNA模板连接探针(RTL)，针对基因编码转录组中特定基因的成对探针与它们的基因靶标杂交，然后彼此连接，组织透化后，基因表达信息被芯片捕获。
FFPE组织的可视化空间基因表达具有高敏感性、特异性和可重复性
图3 Visium FFPE分别对小鼠脑组织的冰冻切片或FFPE进行WTA
a . Visium FFPE的数据与Visium新鲜冷冻组织的数据具有高度相关性，显示了两种方法之间的可比性和高灵敏度；b. Hpca的mRNA的空间表达数据显示，在新鲜冷冻和FFPE样品的海马中均有表达，与已知的表达模式一致，表明了Visium对FFPE的特异性；c.从小鼠大脑FFPE样本中连续切片，通过Visium FFPE分析，结果数据显示出高重现性。可在人乳腺导管癌原位FFPE样本中检测到18,000个基因。
Visium FFPE对保存的FFPE组织样本进行了全组织覆盖的转录组分析
图4 Visium FFPE分析覆盖人乳腺导管原位肿瘤FFPE样本中约18,000个基因
a.H&E染色图像，覆盖了来自FFPE的WTA数据；b.总基因；c.聚类分析；d.关键乳腺癌基因（ERBB2 (HER2)，孕酮受体(PGR)和雌激素受体(ESR1)）的表达水平和空间组织位置分布。
应用示例：Visium FFPE空间技术呈现三阳性导管癌原位样本的肿瘤微环境
伯豪生物目前已经开通10x Visium FFPE产品预定，想要尽早抢鲜体验该产品的老师们，请尽快同驻地销售联系吧。
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