技术应用|全外测序显著提高临床诊断能力

   点击蓝字 关注我们

随着测序技术的发展和测序成本的下降，全外显子组测序除了被广泛应用于科学研究，也正越来越多地应用于临床诊断，在多种遗传病、肿瘤以及一些复杂疾病的诊断中发挥着重要作用。尤其是全外显子组测序数据可重复利用，当新的疾病及分子机制被不断发现，临床医生可以随时对已有数据进行再分析，从而解读出更多的基因信息。患者无需再做全外检测，性价比更高。本期简要分享外显子组测序能显著提高临床诊断能力的文献报道。

01

外显子组和全基因组测序在未确诊成人队列诊断的应用

发表年度：2021             

发表期刊：J Med Genet

主要内容：外显子组和全基因组测序已被证明可以提高儿科人群的诊断率、改善治疗方案并为亲属提供患病风险信息，但是其应用于成人疾病的临床诊断的有关研究十分有限，该前瞻性研究有助于扩充全外和全基因组测序的应用。本研究招募了来自加拿大安大略省多伦多的成人和癌症遗传学诊所的患者，符合条件的患者满足年龄≥18岁，怀疑患有遗传性疾病，但之前进行过基因检测但没有发现明确信息。总共有47名先证者及其34名亲属同意参与并接受外显子组或基因组测序。结果发现：大约17%（8/47）的先证者在与其主要检测适应症相关的基因中发现了致病性或可能致病性变异。有癌症病史患者的诊断率与无癌症病史患者的诊断率相似（4/18（22%）vs 4/29（14%））。另外24名先证者（51%）的结果不确定。21%患者（10/47）有次要发现结果。

主要结论：本研究为未确诊的成年人群中外显子组或基因组测序的诊断提供了证据。诊断率具有显著增加，这也保证了外显子测序技术的有效使用。外显子测序应用于一线测试时，次要结果的识别和发现可能会提供额外的附加信息。

02

全外的再分析揭示了新的诊断变异并提高了猝死和特发性疾病的分子诊断率

发表年度：2019             

发表期刊：Genome Medicine

主要内容：在初始分析后1到7年再分析的101个WES病例，其中51例是罕见的特发性疾病病例（IDIOM），50例是早期不明原因猝死的死后“分子尸检”病例（MA）。根据报告的变异分为三个组：（1）诊断变异，已知导致感兴趣表型的基因中的致病性和可能致病性变异；（2）可能的诊断变异，已知导致感兴趣表型的基因中可能的致病变异或可能导致感兴趣表型的基因中的致病变异；（3）不确定诊断意义的变异，可能导致感兴趣表型的基因中潜在的有害变异。初步分析揭示了13例罕见病病例（25.4%）和5例猝死病例（10%）的诊断变异。全外再分析后发现了3例罕见病病例（5.9%）和1例不明原因猝死病例（2%）中发现了额外的诊断变异，将分子诊断率分别提高到了31.4% 和 12%。

主要结论：早期突然不明原因死亡和罕见的未确诊疾病对受影响的个人及其家庭成员产生重大影响，这两种情况通常都与遗传有关。全外显子组测序 (WES) 是识别这些遗传风险因素的有力方法。全外数据的再分析结果获得了额外诊断率，将综合诊断率提高了 10%，揭示出在初始WES后仍未确诊的病例中的诊断变异。这一结果表明，对全外数据的定期再分析可以揭示新的诊断，并为意义不明的变异提供更多的解读。

全外测序凭借高性价比优势在科研和临检方面都有越来越多的应用，下期我们将分享近期新报道的案例。伯豪生物全外优惠活动进行中，详情联系：021-58955370

推/荐/阅/读 

END

服务科技创新，护航人类健康

伯豪生物｜Shbio

电话:[phone]｜邮箱:[e-mail] 

更多精彩内容“阅读原文”

右边给我一朵小花花